随着人口老龄化加剧,阿尔茨海默病(AD)疾病负担不断增加。由于AD病理变化常早于临床症状出现,寻找可靠的早期生物标志物具有重要意义。传统脑脊液检测和PET影像虽可反映AD病理,但受侵入性和成本限制。近年来,具有高稳定性和组织特异性的血液circRNA逐渐成为AD早期检测的重要候选标志物,并为液体活检技术在AD风险评估中的应用提供了新的方向。

近日,圣路易斯华盛顿大学Carlos Cruchaga研究团队在 Nature Medicine 发表题为:Blood-based circular RNAs for early diagnosis of Alzheimer’s disease 的研究论文。

该研究围绕血液circRNA与阿尔茨海默病之间的关联展开,通过大规模队列分析筛选AD相关circRNA,并构建基于血液circRNA特征的预测模型,系统评估其在疾病早期识别和进展预测中的应用价值,并在多个独立队列中进行验证。该研究为circRNA作为神经退行性疾病液体活检标志物提供了重要证据,并拓展了AD早期检测的新方向。

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研究设计

研究团队收集了816名认知正常(CU)人群和405名AD患者的血液样本,通过RNA测序结合多种生物信息学工具筛选AD相关circRNA,并构建预测模型。随后,研究利用脑脊液Aβ/Tau、amyloid-PET、血浆pTau217及纵向随访数据评估circRNA模型对AD诊断和疾病进展的预测能力,并在Knight-ADRC和A4独立队列中进行验证。

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Fig. 1 | 研究设计

血液AD相关circRNA的筛选与鉴定

基于Knight-ADRC队列(405名AD患者与829名认知正常人群),研究团队通过多种算法交叉验证,从1601个高质量血液circRNA中,最终锁定34个高度稳定且与AD显著相关的候选分子(如circDNAJC6等)。这一严格的筛选过程,为后续构建AD诊断与预测模型奠定了坚实基础。

AD相关circRNA脑组织富集特征

为探究34个AD相关circRNA的组织来源,研究团队利用CircAtlas 3.0数据库分析其在33种组织中的表达特征。结果显示,其中30个circRNA在脑组织中表现出高度富集;进一步qPCR验证发现,在21个有效检测的circRNA中,有14个在脑组织中表达更高。研究结果表明,多数AD相关circRNA具有脑组织富集特征,结合circRNA可跨越血脑屏障的特点,提示血液circRNA可能反映脑部AD相关分子变化,为其作为AD血液生物标志物提供依据。

AD相关circRNA独立于线性mRNA变化

由于circRNA可能与其宿主基因的线性mRNA存在关联,研究团队进一步分析了AD相关circRNA是否独立于对应mRNA。结果显示,34个候选circRNA中有33个具有对应线性mRNA来源,其中29个(87%以上)在校正线性mRNA影响后仍与AD显著相关,包括circDNAJC6、circPICALM和circNUP54等。该结果表明,多数AD相关circRNA并非简单反映宿主基因mRNA水平变化,而具有独立的AD相关表达特征,支持其作为独立血液生物标志物的潜力。

血液circRNA模型的AD诊断能力

研究团队基于34个AD相关circRNA构建预测模型。结果显示,该模型识别AD相关病理状态的AUC达到0.945,优于血浆pTau217(AUC=0.877),联合pTau217后提升至0.967。同时,该模型在不同性别、APOE4亚组及amyloid-PET检测中均保持稳定预测能力,表明血液circRNA具有较好的AD病理识别潜力。

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Fig. 2 | 利用血液circRNA作为临床AD诊断及淀粉样蛋白病理检测的生物标志物

circRNA模型具有跨祖源稳定性

为验证circRNA模型在不同祖源人群中的稳定性,研究团队进一步在欧洲祖源(n=978)、非洲祖源(n=92)及其他混合祖源人群(n=35)中进行测试。结果显示,该模型在不同祖源人群中均保持良好的预测性能,AUC分别达到0.906、0.934和0.922。研究表明,血液circRNA模型具有较好的跨祖源泛化能力。

血液circRNA模型具有AD特异性

为验证34个circRNA模型的AD特异性,研究团队进一步在帕金森病(PD)、路易体痴呆(DLB)和额颞叶痴呆(FTD)患者中进行测试。结果显示,该模型在非AD痴呆中的预测能力较低(PD、DLB、FTD的AUC分别为0.413、0.545和0.404)。进一步分析发现,仅少数circRNA与其他神经退行性疾病相关,而大多数circRNA主要与AD相关,表明该模型具有较好的AD疾病特异性。

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Fig. 3 | 不同祖源人群及不同类型痴呆疾病中的预测模型评估

血液circRNA预测AD进展风险

研究团队利用纵向随访数据评估circRNA模型对AD进展的预测能力。结果显示,circRNA模型预测症状性AD发展的HR达到2.92,高于pTau217模型(HR=1.81);在5年进展预测中,AUC达到0.870,优于pTau217(AUC=0.676)。此外,circRNA联合pTau217可进一步提升风险预测能力,双阳性人群进展风险最高(HR=4.83)。研究表明,血液circRNA具有预测AD进展和风险分层的潜力。

circRNA变化可提前反映AD进展

研究团队利用TTO分析circRNA变化与AD发病时间的关系,发现34个circRNA整体水平在临床症状出现前约2–4年开始发生变化,并随疾病进展持续升高。此外,基于CDR评分分析显示,circRNA模型能够预测未来认知下降(AUC=0.781)及早期痴呆阶段(AUC=0.722)。结果表明,血液circRNA可反映AD早期分子变化,并与疾病进展程度相关。

多算法验证circRNA模型稳定性

为验证模型可靠性,研究团队采用CIRI2和CIRI3对基于DCC构建的circRNA模型进行交叉验证。结果显示,CIRI2和CIRI3模型预测AD生物标志物状态的AUC分别为0.848和0.801,与DCC模型保持一致趋势。此外,在AD进展预测和生存分析中,不同算法同样获得稳定结果,进一步证明了circRNA模型的可靠性和重复性。

独立样本验证circRNA模型稳定性

为验证circRNA模型的稳健性,研究团队在Knight-ADRC队列中选取未用于模型训练的独立样本进行验证,并利用amyloid-PET(n=543)和血浆pTau217(n=602)评估模型性能。结果显示,circRNA模型在独立样本中仍保持稳定预测能力,amyloid-PET预测AUC为0.726,pTau217预测AUC为0.716,与训练样本结果一致。研究表明,血液circRNA模型具有较好的稳定性和重复性。

Knight-ADRC独立队列验证circRNA模型

研究团队在Knight-ADRC独立复制队列(n=551)中验证circRNA模型。结果显示,该模型预测AD相关生物标志物状态的AUC达到0.863,联合pTau217后提升至0.955;同时可预测症状性AD进展风险(HR=3.83),联合pTau217后进一步提高至13.95,表明其具有良好的稳定性和重复性。

A4独立队列验证模型泛化能力

研究团队进一步利用A4队列RNA测序数据验证circRNA模型。由于该队列基线均为认知正常人群,研究主要评估模型对AD相关生物标志物状态及疾病进展的预测能力。结果显示,circRNA模型预测生物标志物阳性的AUC达到0.723,并可预测症状性AD进展(HR=2.93),联合pTau217后进一步提升至4.58。不同circRNA定量方法均获得一致结果,表明该模型具有良好的稳定性和泛化能力。

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Fig. 4 | 血液circRNA对AD疾病进展的预测能力高于pTau217

总结

本研究系统评估了血液circRNA在AD早期识别和疾病进展预测中的潜力。研究团队筛选获得34个AD相关circRNA并构建预测模型,发现该模型不仅能够识别AD相关病理状态,还可预测无症状人群未来疾病进展风险,并在部分指标中表现出优于血浆pTau217的预测能力。此外,这些circRNA具有脑组织富集特征,其变化可在临床症状出现前被检测,并在多个独立队列中得到验证。

基于该研究成果,Circular Genomics进一步开发了CircPATH™平台,旨在将脑富集circRNA信号转化为血液分子诊断工具,用于探索AD风险评估和疾病监测。未来,circRNA血液检测策略有望为AD早期筛查、风险分层及临床研究提供新的技术支持。

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41591-026-04485-5

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