网址:http://www.circbank.cn/

物种:人、小鼠、大鼠、裸鼹鼠、热带爪蟾、斑马鱼、果蝇、秀丽隐杆线虫、拟南芥和酿酒酵母

功能:circBank 2.0数据库

1. circRNA标准化命名体系;

2. circRNA基因组线性和成熟circRNA结构及序列;

3. circRNA在不同组织或发育阶段的表达情况;

4. circRNA-miRNA结合位点;

5. circRNA跨物种保守性分析;

6. circRNA的m6A修饰相关数据;

7. circRNA实验验证信息;

8. circRNA蛋白编码潜能与ORF,及IRES位点预测;

9. circRNA的UCSC基因组trackhub(实现全基因组circRNA数据可视化);

10. 提供miRNA Prediction、blastCirc、ORF identification、IRES finding在线分析软件。

 

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