网址:http://circatlas.biols.ac.cn/

物种:circAtlas包括从六种脊椎动物(人类,猕猴,小鼠,大鼠,猪和鸡)收集的19种正常组织

功能:每种物种中的circRNA使用四种可靠的检测算法进行了识别,包括CIRI2,find_circ,CIRCexplorer2和DCC。使用CIRI-full/CIRI-vis pipline重建鉴定出的circRNA的全长序列。在全长circRNA中搜索内部核糖体进入位点(IRESs)和ORF,预测其编码潜力。使用多重保守评分(MCS)方案对circRNA的保守性进行表征,估计circRNA在物种、组织和个体三个水平上的保守性。将有关共表达网络、circRNA-miRNA和RBP结合位点的信息结合起来,对circRNA进行全面注释。使用GO和KEGG数据库预测这些circRNA的潜在功能。同时,将circad,circR2Disease和circRNADisease数据库数据整合到circAtlas中,以评估circRNA与各种疾病的相关性。

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