4月12日，Scientific Reports杂志在线发表了浙江大学附属第四医院夏肖萍和中山大学生命科学学院邓日强为共同通讯作者的文章，报道分析了新冠患者外周血非编码RNA，包括lncRNA和circRNA。
样品高通量芯片分析
作者收取了3例复发的新冠感染者外周血2mL，同步收取3例对照健康志愿者的外周血2mL。提取的总RNA进行芯片分析。数据分析后共得到差异表达circRNA 570个，其中上调的有155个。差异表达的lncRNA有898个，其中414个上调。特别的，ACE基因没有显著的变化。
图1 芯片分析新冠患者外周血总RNA（[1]）
数据深度分析
GO和KEGG分析：针对circRNA的母基因，lncRNA调控的基因以及mRNA进行了GO和KEGG通路分析。
图2差异基因进行GO通路分析（[1]）
图3 差异基因进行KEGG通路分析（[1]）
共表达分析：作者首先分析了与细胞周期和免疫炎症相关的共表达基因。选择相关性大于0.9，p<0.05的进行展示。通过共表达网络可以看出，NF-κB，IL1β，PI3K，TNFSF14基因相对比较重要。分别分析了lncRNA和circRNA的共表达网络。
图4 circRNA共表达网络分析（[1]）
图5 lncRNA共表达网络分析（[1]）
ceRNA网络分析：作者分析了与细胞周期和免疫炎症相关的基因ceRNA网络，分别分析了lncRNA和circRNA的ceRNA网络。
图6 lncRNA ceRNA网络分析 （[1]）
图7 circRNA ceRNA网络分析（[1]）
外泌体相关性分析：将差异表达的lncRNA和circRNA与外泌体RNA数据库进行比对分析，所使用的的数据库包括：
exoRBase：http://www.exorbase.org/
ExoCarta：http://www.exocarta.org/
参考文献：
1. Wu, Y., Zhao, T., Deng, R. et al. A study of differential circRNA and lncRNA expressions in COVID-19-infected peripheral blood. Sci Rep 11, 7991 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-86134-0