欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目,本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了43篇最新文献,涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐,共同洞悉科研前沿的最新动态!

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01 胆管癌合并胆道梗阻:用于诊断和监测早期复发的外泌体环状RNA特征

标题:Cholangiocarcinoma combined with biliary obstruction: an exosomal circRNA signature for diagnosis and early recurrence monitoring

杂志:Signal Transduct Target Ther

影响因子:39.3

通讯作者:李蓓副教授、卢炯副教授、程南生教授(四川大学华西医院)

DOI:https://doi.org/10.1038/s41392-024-01814-3

胆管癌(CCA)是一种高度恶性的胆道肿瘤,目前诊断和预后方法尚不理想。该研究提出了一种通过活检血清和胆液中外泌体环状RNA (circRNA)监测CCA的新系统。通过微阵列分析由CCA诱导的胆道梗阻(CCA-BO, n = 5)和良性胆道梗阻(BBO, n = 5)患者组成的数据,鉴定CCA诱导的外泌体环状RNA。一个发现队列(n = 20)进一步揭示了胆汁和血清外泌体中CCA特异性circRNA集合(hsa-circ-0000367, hsa-circ-0021647和hsa-circ-0000288)。体外和体内研究表明,这三种环状RNA是CCA侵袭性的启动因子。诊断和预后模型由两个独立队列(训练队列,n = 184;验证队列,n = 105)。与常规CA19-9 (AUROC = 0.759, RR = 2.08)相比,无解释器诊断模型揭示了利用胆汁(胆汁-DS, AUROC = 0.947, RR = 6.05)和血清(血清-DS, AUROC = 0.861, RR = 4.04)外泌体circRNA特征的诊断能力。通过计算早期复发评分建立CCA手术预后模型,并用胆汁标本(胆汁-ERS, C-index=0.783)和血清标本(血清-ERS, C-index= 0.782)进行验证。这些模型与COX-PH模型显示的其他预后因素相结合,建立了监测CCA复发的列线图。该研究表明,在胆汁和血清样本中发现的外泌体三种环状RNA面板可作为CCA临床管理的一种新的诊断和预后工具

02 TRIM29通过MEK/ERK途径促进吉西他滨耐药,并在PDAC中由circRPS29/miR-770-5p轴调控

标题:TRIM29 facilitates gemcitabine resistance via MEK/ERK pathway and is modulated by circRPS29/miR-770-5p axis in PDAC

杂志:Drug Resist Updat

影响因子:24.3

通讯作者:王平主任医师(广州医科大学附属第一医院)、崔春晖主任医师(南方医科大学珠江医院)、范应方主任医师(南方医科大学附属第三医院)

DOI:https://doi.org/10.1016/j.drup.2024.101079

目的:胰腺导管腺癌(PDAC)是一种高致死率疾病。吉西他滨(GEM)化疗仍然是晚期PDAC患者的一线药物。然而,GEM耐药性削弱了其治疗效果。因此,迫切需要确定有效的治疗靶点来克服GEM耐药性。

方法:通过检索GEO数据集和TCGA数据库,鉴定TRIM29 (Tripartite Motif Containing 29, TRIM29)的临床意义,并通过GSEA分析预测其潜在的生物学功能。通过生物信息学分析建立了调控轴,并进行了力学实验验证。然后,通过体外和体内实验验证TRIM29在PDAC GEM耐药中的作用。

结果:TRIM29高表达与PDAC预后不良相关,功能实验表明TRIM29促进PDAC GEM-resistant (GR)细胞对GEM的耐药。此外,研究发现circRPS29通过与miR-770-5p的竞争性相互作用促进TRIM29的表达,然后激活MEK/ERK信号通路。此外,体外和体内功能实验均表明,
circRPS29/miR-770-5p/TRIM29轴通过激活MEK/ERK信号通路促进PDAC GEM耐药。

结论:该研究结果确定了信号轴
circRPS29/miR-770-5p/TRIM29-MEK/ERK在PDAC GEM耐药中的重要意义,这将为PDAC治疗提供新的治疗靶点

03 小鼠海马体circAnk3缺失通过调节miR-7080-3p/IQGAP1通路导致焦虑样行为和社交缺陷

标题:Hippocampal circAnk3 Deficiency Causes Anxiety-like Behaviors and Social Deficits by Regulating the miR-7080-3p/IQGAP1 Pathway in Mice

杂志:Biol Psychiatry

影响因子:10.6

通讯作者:岑小波(四川大学华西医院)

DOI:https://doi.org/10.1016/j.biopsych.2023.10.017

背景:环状RNA在哺乳动物脑突触中高度富集,并作为microRNA的分子海绵在神经功能中发挥重要作用。circAnk3来源于锚蛋白-3基因的第11个内含子,锚蛋白-3是神经精神疾病的一个有较强遗传性的致病因子;然而,circAnk3的功能仍然未知。文章研究了小鼠海马中circAnk3及其下游靶基因调控网络的功能。

方法:利用CRISPR/Cas9技术对产生circAnk3的DNA序列进行编辑,并对circAnk3+/-小鼠进行神经行为测试(焦虑和抑郁样行为、社交行为)。通过一系列分子和生化分析,研究了circAnk3作为microRNA海绵的功能及其下游靶基因调控网络。

结果:circAnk3+/-小鼠表现出焦虑样行为和社交缺陷。circAnk3主要位于神经元细胞的细胞质中,作为miR-7080-3p海绵调节Iqgap1的表达。抑制miR-7080-3p或恢复海马中的Iqgap1可改善circAnk3+/-小鼠的行为缺陷。此外,circAnk3缺陷降低了NMDA受体亚基GluN2a的表达,损害了海马树突突触的结构可塑性。

结论:该研究结果揭示了
circAnk3/miR-7080-3p/IQGAP1轴在维持海马突触结构可塑性方面的重要作用
circAnk3可能为环状RNA在神经精神疾病中的作用提供新的见解。

04 一个独特的circ_0067716/EIF4A3双负反馈回路影响苯并(A)芘诱导的人支气管上皮细胞恶性转化

标题:A unique circ_0067716/EIF4A3 double-negative feedback loop impacts malignant transformation of human bronchial epithelial cells induced by benzo(a)pyrene

杂志:Sci Total Environ

影响因子:9.8

通讯作者:逯晓波教授(中国医科大学)

DOI:https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.171349

苯并(a)芘作为一种普遍存在的环境污染物,其特点是具有巨大的遗传毒性,流行病学调查已经确定了苯并(a)芘暴露与人类肺癌易感性之间的相关性。值得注意的是,许多研究都集中在表观遗传改变与化学物质诱导的肺癌之间的联系上,尽管环状RNA也被认为是苯并(a)芘致癌过程的相关者。在这项研究中,作者发现circ_0067716在应激损伤时显著上调,在苯并(a)芘-7,8-二醇-9,10-环氧化物(BPDE)诱导的人支气管上皮细胞恶性转化过程中下调。作者观察到circ_0067716在不同持续时间的BPDE处理细胞中的差异表达,表明这种circRNA与BPDE暴露之间存在很强的相关性。肺癌患者的组织样本也表明,较低的circ_0067716表达与BPDE-DNA加合物水平有关。

值得注意的是,研究证明了位于细胞核中的EIF4A3与circ_0067716的侧翼序列相互作用并抑制其生物发生。相反,circ_0067716能够将EIF4A3隔离在细胞质中,从而阻止其转运到细胞核中。EIF4A3和circ_0067716可形成双负反馈回路,该回路受BPDE影响。在BPDE暴露的初始阶段,circ_0067716在应激损伤下的表达增加,通过miR-324-5p/DRAM1/BAX轴的参与导致细胞凋亡。随后,随着细胞适应的进展,BPDE暴露引起的长期诱导导致EIF4A3升高和circ_0067716表达降低,从而通过稳定PI3K/AKT通路促进细胞增殖。该研究描述了circ_0067716对苯并(a)芘遗传毒性和致癌性的影响,并提出了可能对吸烟相关肺癌发生的调控机制,提供了基于表观遗传学的独特见解

05 环状RNA circTATDN3促进结直肠癌Warburg效应和增殖

标题:Circular RNA circTATDN3 promotes the Warburg effect and proliferation in colorectal cancer

杂志:Cancer Lett

影响因子:9.7

通讯作者:李勇主任医师(广东省人民医院) , Jun Zheng(中山大学附属第三医院),张建伟副主任医师(中国医学科学院肿瘤医院), Zihao Pan(广东省人民医院)

DOI:https://doi.org/10.1016/j.canlet.2024.216825

乳酸脱氢酶A (LDHA)作为糖酵解途径中的关键代谢酶之一,可能通过驱动Warburg效应与肿瘤增殖有关。环状RNA (circRNAs)广泛参与肿瘤进展。该研究报道了circTATDN3,一种与LDHA相互作用的环状RNA,在CRC的增殖和能量代谢中起关键作用。该研究发现circTATDN3在结直肠癌细胞和肿瘤组织中表达升高,且circTATDN3高表达与结直肠癌患者术后预后不良呈正相关。此外,circTATDN3在体内和体外均促进CRC细胞的增殖。从机制上讲,circTATDN3被证明是一个适配器分子,可以增强LDHA与FGFR1的结合,导致LDHA磷酸化增加,从而促进Warburg效应。此外,circTATDN3通过吸附miR-511-5p增加LDHA的表达,从而协同促进CRC的进展和Warburg效应总之,circTATDN3可能是治疗结直肠癌的靶点。

06 靶向肿瘤circ -E- cadherin编码的C-E-Cad抑制乳腺癌相关髓源性抑制细胞的募集和功能

标题:Targeting tumorous Circ-E-Cadherinencoded C-E-Cad inhibits the recruitment and function of breast cancer-associated myeloid-derived suppressor cells

杂志:Pharmacol Res

影响因子:9.3

通讯作者: Xinya Gao(广州市妇女儿童中心)

DOI:https://doi.org/10.1016/j.phrs.2024.107204

研究团队之前证明了circ-E-cadherin编码的C-E-cad蛋白促进胶质瘤干细胞的自我更新。C-E-cad在乳腺癌中的表达模式及其在肿瘤微环境中的潜在功能尚不清楚。检测乳腺癌标本中circ-E-cadherin和C-E-cad的表达。采用流式细胞术和体内肿瘤发生实验评估C-E-cad表达对MDSCs的影响。体内实验验证了anti-c-E-cad和anti-PD-1抗体的协同作用。circ-E- cadherin和编码蛋白C-E-cad在乳腺癌中与正常样本相比表达上调。C-E-cad促进MDSCs的募集,尤其是PMN-MDSCs。C-E-cad激活肿瘤细胞中的EGFR信号,促进CXCL8的转录;此外,C-E-cad与MDSCs结合并维持PMN-MDSCs中的糖酵解。靶向C-E-cad可提高anti-PD-1的效率。该研究数据表明,C-E-cad在乳腺癌中明显过表达,并促进MDSC的募集和生存。靶向C-E-cad可提高免疫检查点抑制剂治疗的疗效

07 环状RNA在调节癌症免疫治疗耐药性中的作用:机制和意义

标题:The role of circular RNAs in regulating resistance to cancer immunotherapy: mechanisms and implications

杂志:Cell Death Dis

影响因子:9.0

通讯作者:Fangyi Long(四川省妇幼保健院)

DOI:https://doi.org/10.1038/s41419-024-06698-3

癌症免疫疗法已经迅速改变了癌症治疗,但耐药性仍然是一个重大障碍,限制了它在许多患者中的疗效。环状RNA(circRNAs)是一类新型的非编码RNA,已成为基因表达和细胞过程的关键调节因子。越来越多的证据表明它们参与调节对癌症免疫治疗的耐药性。值得注意的是,某些circRNAs作为miRNA海绵或与蛋白质相互作用,影响免疫相关基因的表达,包括关键的免疫检查点分子。这反过来又塑造了肿瘤微环境,并显著影响了免疫治疗的反应。这篇全面的综述探讨了环状RNA在协调癌症免疫治疗耐药演变中的作用,并特别关注了它们影响免疫检查点基因表达的机制。此外,文章强调了环状RNA作为有希望的治疗靶点,可以增强癌症免疫治疗的有效性。了解环状RNA在癌症免疫治疗耐药中的作用可能有助于开发新的治疗策略来克服耐药并改善患者的预后。

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