欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计62篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

 

1.在缺氧微环境下,HIF1α-SP1相互作用破坏circ-0001875/miR-31-5p/SP1调控环,促进非小细胞肺癌进展

标题:HIF1α-SP1 interaction disrupts the circ-0001875/miR-31-5p/SP1 regulatory loop under a hypoxic microenvironment and promotes non-small cell lung cancer progression

杂志:J Exp Clin Cancer Res

影响因子:11.161

通讯作者:李丽霞副主任医师,吴斌主任医师和黎东明副主任医师(广东医科大学附属医院)

背景:环状RNAs(circRNAs)在非小细胞肺癌(NSCLC)的进展中发挥重要作用,特别是在肿瘤缺氧的情况下。然而,失调环状RNAs在非小细胞肺癌中的确切功能和潜在机制在很大程度上是未知的。

方法:通过高通量RNA测序鉴定NSCLC组织中显著表达的环状RNAs。研究circ-0001875在体内外非小细胞肺癌细胞中的作用。通过双荧光素酶报告基因检测和挽救实验检测circ-0001875、miR-31-5p和SP1的调控关系。western blot和免疫荧光染色分析上皮细胞向间充质细胞转化的信号通路及丝状足的形成。用RNA免疫共沉淀法检测SP1与Alu元素的结合,用共免疫共沉淀法检测HIF1α与SP1的相互作用。

结果:作者发现新的Has_circ_0001875在NSCLC组织和细胞系中是一个显著上调的circRNA。circ-0001875在体内外均促进了NSCLC的增殖和转移,并诱导NSCLC细胞延伸丝状足。在机制上,circ-0001875海绵化miR-31-5p调节SP1,通过TGFβ/Smad2信号通路影响上皮-间质转化。SP1通过一个依赖于AluSq的反馈环负调控circ-0001875的形成,在缺氧条件下,该反馈环被HIF1α与SP1竞争性结合所破坏。circ-0001875/miR-31-5p/SP1轴与NSCLC患者的临床特征和预后相关。

结论:研究结果显示circ-0001875/miR-31-5p/SP1轴和复杂的调控回路影响NSCLC进展。这些发现为肿瘤缺氧条件下环状RNAs形成的调控提供了新的见解。

缺氧诱导的HIF1α-SP1调控circ-0001875/miR-31-5p/SP1/AluSq的机制

 

2.脊髓韧带老化的表观遗传修饰

标题:Epigenetic modifications in spinal ligament aging

杂志:Ageing Res Rev

影响因子:10.895

通讯作者:李危石主任医师(北京大学第三医院)

椎管狭窄症是老年人常见的退行性脊柱疾病,脊髓韧带老化是导致这种慢性疾病的主要原因。然而,脊髓韧带衰老的潜在机制尚不清楚。表观遗传学是一门研究基因或基因组功能的可遗传和可逆变化的学科,这种变化发生在初级DNA序列没有任何改变的情况下。表观遗传改变已被证明在与年龄相关的疾病和条件中起着至关重要的作用,最近它们在癌症研究领域被作为生物标志物和治疗靶点进行研究。主要的表观遗传修饰,包括DNA甲基化改变、组蛋白修饰以及非编码RNA调控异常,都与脊髓韧带衰老性疾病有关。在脊髓韧带变性过程中,DNA甲基化调节包括WNT5A、GDNF、ACSM5、miR-497和miR-195在内的关键基因的表达。组蛋白修饰广泛影响基因表达,在脊髓韧带老化过程中发现了明显的组蛋白修饰异常。MicroRNAs (miRNAs)、长链非编码RNAs(lncRNAs)和环状RNAs(circRNAs)通过靶向各种骨源性或纤维源性分化相关基因,对脊髓韧带老化状况发挥重要的调控作用。据了解,目前尚无系统综述脊柱韧带衰老在退行性脊柱疾病中的表观遗传学机制。在本研究中,作者系统地讨论了不同的表观遗传修饰及其在脊髓韧带衰老过程中的潜在作用。

脊髓韧带老化过程中miRNAs、lncRNAs和circRNAs调控示意图

 

3. 长链非编码RNA和环状RNA在聚苯乙烯微塑料肺损伤中的作用研究

标题:A study on the roles of long non-coding RNA and circular RNA in the pulmonary injuries induced by polystyrene microplastics

杂志:Environ Int

影响因子:9.621

通讯作者:卞倩主任医师(江苏省疾病预防控制中心)

微塑料(MPs)污染与环境和人类健康密切相关,已成为全球关注的问题。近年来,越来越多的研究指出空气中存在MPs,但其潜在的吸入毒性尚不清楚。聚苯乙烯微塑料(PS-MPs)就是其中的代表。此外,非编码RNA在基因表达调控中发挥着重要作用。因此,本研究旨在为PS-MPs吸入的分子探索提供新的思路。在本研究中,SD大鼠分别被100 nm、500 nm、1 μm和2.5 μm PS-MPs处理3天。连续2周内,SD大鼠每2 d气管内灌注生理盐水或100 nm PS-MPs(0、0.5、1、2 mg/200 μL)。免疫荧光法观察PS-MPs的沉积。苏木精和伊红(H&E)染色切片可见肺组织学改变。采用酶联免疫吸附法(ELISA)和qPCR法定量检测促炎细胞因子的表达。大鼠肺内长非编码RNAs(lncRNAs)和环状RNA (circRNAs)的全基因组转录组分析通过清除核糖体RNA后的RNA测序完成,并通过qRT-PCR进行验证。结果表明,100 nm和1 μm PS-MPs可在肺内沉积。病理检查显示PS-MPs组肺泡破坏,支气管上皮杂乱排列。此外,在PS-MPs暴露的大鼠中,促炎细胞因子IL-6、TNF-α和IL-1β的表达上调。测序结果显示,生理盐水和PS-MPs暴露大鼠肺组织中有269个circRNAs和109个lncRNAs差异表达。qRT-PCR检测MPs组中lncRNA XLOC_031479、circRNA 014924、circRNA 006603表达上调,lncRNA XLOC_014188、circ003982表达下调。结果显示,发现的新型环状RNAs和lncRNAs可能在PS-MPs引起的肺部炎症的发生发展中发挥重要作用。

          

100 nm聚苯乙烯塑料微粒透射电镜结果图

 

文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 在缺氧微环境下,HIF1α-SP1相互作用破坏circ-0001875/miR-31-5p/SP1调控环,促进非小细胞肺癌进展 HIF1α-SP1 interaction disrupts the circ-0001875/miR-31-5p/SP1 regulatory loop under a hypoxic microenvironment and promotes non-small cell lung cancer progression J Exp Clin Cancer Res 11.161 广东医科大学附属医院
2 脊髓韧带老化的表观遗传修饰 Epigenetic modifications in spinal ligament aging Ageing Res Rev 10.895 北京大学第三医院骨科
3 长链非编码RNA和环状RNA在聚苯乙烯微塑料肺损伤中的作用研究 A study on the roles of long non-coding RNA and circular RNA in the pulmonary injuries induced by polystyrene microplastics Environ Int 9.621 江苏省疾病预防控制中心毒理学与风险评价研究所
4 circMbl在顺式和反式中发挥作用,以组织特异性的方式调节基因表达和生理机能 circMbl functions in cis and in trans to regulate gene expression and physiology in a tissue-specific fashion Cell Rep 9.423 布兰代斯大学生物系
5 在结直肠癌中,YAP衍生的circ-LECRC作为“刹车信号”抑制致癌YAP信号的过度激活 YAP derived circ-LECRC functions as a “brake signal” to suppress hyperactivation of oncogenic YAP signalling in colorectal cancer Cancer Lett 8.679 中国医科大学第一医院消化内科
6 在前列腺癌中,新型环状RNA circ_0086722通过调控miR-339-5p/STAT5A轴驱动肿瘤进展 Novel circular RNA circ_0086722 drives tumor progression by regulating the miR-339-5p/STAT5A axis in prostate cancer Cancer Lett 8.679 南昌大学第一附属医院泌尿科
7 关于“外泌体介导的circRNA CircNFIX转移增强胶质瘤对替莫唑胺的耐药性”的撤销通知[Cancer Lett. 479 (2020) 1-12] Retraction notice to “Exosome-mediated transfer of circRNA CircNFIX enhances temozolomide resistance in glioma” [Cancer Lett. 479 (2020) 1-12] Cancer Lett 8.679 郑州大学人民医院,福建医科大学第一附属医院
8 人乳头瘤病毒阳性和阴性外阴鳞状细胞癌在生物学上但在临床上不明显 Human Papillomavirus‒Positive and ‒Negative Vulvar Squamous Cell Carcinoma Are Biologically but Not Clinically Distinct J Invest Dermatol 8.551 德克萨斯大学西南医学中心皮肤科
9 PRKDC通过增强RNA Pol II与cccDNA的结合来促进乙肝病毒的转录 PRKDC promotes hepatitis B virus transcription through enhancing the binding of RNA Pol II to cccDNA Cell Death Dis 8.469 重庆医科大学
10 CircMAN1A2被幽门螺杆菌上调,促进胃癌的发生发展 CircMAN1A2 is upregulated by Helicobacter pylori and promotes development of gastric cancer Cell Death Dis 8.469 山东大学基础医学院病原生物学教研室
11 环状RNAs在宫颈癌发生中的作用角色和生物标志物潜能的综述 Circular RNAs as emerging players in cervical cancer tumorigenesis; A review to roles and biomarker potentials Int J Biol Macromol 6.953 伊朗德黑兰沙希德·贝赫什蒂医科大学
12 从short-read RNA-Seq中综合比较两种circRNA检测算法 Comprehensive comparison of two types of algorithm for circRNA detection from short-read RNA-Seq Bioinformatics 6.937 西北农林科技大学生命科学学院
13 hMSCs来源的外泌体circCDK13通过miR-17-5p/KAT2B调控MFGE8的表达,抑制肝纤维化 hMSCs-derived exosome circCDK13 inhibits liver fibrosis by regulating the expression of MFGE8 through miR-17-5p/KAT2B Cell Biol Toxicol 6.691 中南大学湘雅二医院传染病科
14 miR-411在癌症中的失调:发病机制、诊断和预后的致病因素 Dysregulation of miR-411 in cancer: Causative factor for pathogenesis, diagnosis and prognosis Biomed Pharmacother 6.529 浙江大学城市学院医学院临床医学系
15 环状RNAs与甲状腺癌:封闭分子,开放可能性 Circular RNAs and thyroid cancer: Closed molecules, open possibilities Crit Rev Oncol Hematol 6.312 俄罗斯莫斯科内分泌学研究中心
16 外周血环状RNA hsa_circ_0058493作为矽肺和特发性肺纤维化潜在的新生物标志物 Peripheral blood circular RNA hsa_circ_0058493 as a potential novel biomarker for silicosis and idiopathic pulmonary fibrosis Ecotoxicol Environ Saf 6.291 徐州医科大学,南通市第六人民医院,南通大学公共卫生学院
17 肝脏中外泌体来源的非编码RNAs的临床意义 Clinical implications of exosome-derived noncoding RNAs in liver Lab Invest 5.662 浙江省人民医院,蚌埠医学院,香港浸会大学
18 环状RNAs在不同类型人类癌症中的最新进展:技术前景、临床机会和挑战(综述) Recent progress of circular RNAs in different types of human cancer: Technological landscape, clinical opportunities and challenges (Review) Int J Oncol 5.650 翰林大学,阿达马斯大学
19 外泌体和外泌体含量调节实体肿瘤放射敏感性的机制和临床价值 Mechanism and clinical value of exosomes and exosomal contents in regulating solid tumor radiosensitivity J Transl Med 5.531 苏州大学第三附属医院放射肿瘤科
20 Nrf2通过circ-Vps41/miR-26a-5p/CaMKIV调控网络改善海马突触可塑性、学习和记忆 Nrf2 improves hippocampal synaptic plasticity, learning and memory through the circ-Vps41/miR-26a-5p/CaMKIV regulatory network Exp Neurol 5.330 河北医科大学人体解剖学教研室
21 腺苷A 2A受体拮抗剂与内源性竞争性rna的改变网络相关,保护视网膜线粒体损伤 The adenosine A 2A receptor antagonist protects against retinal mitochondrial injury in association with an altered network of competing endogenous RNAs Neuropharmacology 5.250 温州医科大学视光与眼科学学院
22 RNA甲基转移酶METTL3介导m6a环cdlc1甲基化在胶质瘤细胞恶性增殖中的分子机制 Molecular mechanism of m 6 A methylation of circDLC1 mediated by RNA methyltransferase METTL3 in the malignant proliferation of glioma cells Cell Death Discov 5.241 山西医科大学第二医院神经外科
23 CircRNA hsa_circ_0071336通过靶向miR-93-5p/GLUT4轴与2型糖尿病相关 CircRNA hsa_circ_0071336 is associated with type 2 diabetes through targeting the miR-93-5p/GLUT4 axis FASEB J 5.191 首都医科大学
24 下调mmu_circ_0000943可通过调节mmu-miR-377-3p/Egr2轴改善肾缺血再灌注触发的炎症和氧化应激 Downregulation of mmu_circ_0000943 ameliorates renal ischemia reperfusion-triggered inflammation and oxidative stress via regulating mmu-miR-377-3p/Egr2 axis Int Immunopharmacol 4.932 青岛大学附属医院
25 肿瘤来源或非肿瘤来源的外泌体非编码gRNA和肿瘤微环境中的信号通路 Tumor-derived or non-tumor-derived exosomal noncodingRNAs and signaling pathways in tumor microenvironment Int Immunopharmacol 4.932 华南大学衡阳医学院
26 雷公藤甲素通过调节hsa-circ-0003353/microRNA-31-5p/CDK1轴抑制类风湿性关节炎中成纤维细胞样滑膜细胞的细胞生长和炎症反应 Triptolide inhibits cell growth and inflammatory response of fibroblast-like synoviocytes by modulating hsa-circ-0003353/microRNA-31-5p/CDK1 axis in rheumatoid arthritis Int Immunopharmacol 4.932 安徽中医药大学第一附属医院风湿免疫科
27 circ_002172的促肿瘤作用与通过miR-296-5p/CXCL12轴诱导的乳腺癌免疫逃逸有关 Tumor promoting effect of circ_002172 associates with induced immune escape in breast cancer via the miR-296-5p/CXCL12 axis Int Immunopharmacol 4.932 扬州江都人民医院普外科
28 用于蜘蛛丝蛋白生产的环状mRNAs工程 Engineering Circularized mRNAs for the Production of Spider Silk Proteins Appl Environ Microbiol 4.792 天津市工业生物技术研究所
29 Hsa_circ_0007059通过靶向microRNA-378和microRNA-383促进心肌缺血时细胞凋亡和炎症反应 Hsa_circ_0007059 promotes apoptosis and inflammation in cardiomyocytes during ischemia by targeting microRNA-378 and microRNA-383 Cell Cycle 4.534 黑龙江省医院老年心内科
30 Circ_0020123通过miR-940上调KIAA1522的表达,促进非小细胞肺癌的发生 Circ_0020123 promotes NSCLC tumorigenesis via up-regulating KIAA1522 expression through miR-940 Cell Cycle 4.534 南通大学附属肿瘤医院
31 Circ_0008035通过调控miR-1256/CEACAM6轴促进胃癌进展 Circ_0008035 promotes the progression of gastric cancer via the regulation of miR-1256/CEACAM6 axis Cell Cycle 4.534 河南科技大学第一附属医院临床医学院胃肠外科
32 CircRNA OXCT1通过吸收miR-516b-5p和上调SLC1A5促进非小细胞肺癌的恶性进展和谷氨酰胺代谢 CircRNA OXCT1 promotes the malignant progression and glutamine metabolism of non-small cell lung cancer by absorbing miR-516b-5p and upregulating SLC1A5 Cell Cycle 4.534 湖南省长沙市中心医院胸外科
33 CircNUP98敲低可通过调节miR-151-3p/HMGA2轴来减轻高糖诱导的人肾小球系膜细胞的增殖、纤维化、炎症和氧化应激 CircNUP98 knockdown alleviates high glucose-induced proliferation, fibrosis, inflammation and oxidative stress in human glomerular mesangial cells by regulating miR-151-3p/HMGA2 axis J Diabetes Investig 4.232 陕西省人民医院肾病透析中心
34 Circular RNA circ-PLCD1在非小细胞肺癌中通过失活PI3K/AKT信号通路发挥抑癌作用 Circular RNA circ-PLCD1 functions as a tumor suppressor in non-small cell lung cancer by inactivation of PI3K/AKT signaling pathway Hum Cell 4.174 郑州大学第一附属医院呼吸科
35 CircFAM64A通过靶向miR-149-5p/CDT1轴增强三阴性乳腺癌中的细胞过程 CircFAM64A enhances cellular processes in triple-negative breast cancer by targeting the miR-149-5p/CDT1 axis Environ Toxicol 4.119 华中科技大学同济医学院协和医院
36 环状RNAs在食管鳞状细胞癌临床前体外和体内模型中的疗效 Circular RNAs With Efficacy in Preclinical In Vitro and In Vivo Models of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Cancer Genomics Proteomics 4.069 罗氏
37 鸡胚胎发育过程中骨骼肌中关键环状RNAs的鉴定 Identification of crucial circRNAs in skeletal muscle during chicken embryonic development BMC Genomics 3.969 扬州大学动物科学技术学院
38 Circular RNA_0061587与1型神经纤维瘤病的发生有关 Circular RNA_0061587 is associated with the tumorigenesis of neurofibromatosis type 1 Neurochem Int 3.921 西安交通大学第一附属医院整形美容颌面外科
39 沉默circ-CDK14通过miR-198/E2F2轴抑制骨肉瘤进展 Silencing of circ-CDK14 suppresses osteosarcoma progression through the miR-198/E2F2 axis Exp Cell Res 3.905 吉林大学第二医院骨科
40 癌症中VEGFA转录后调控的非编码RNA调控网络 Non-coding RNA regulatory networks in post-transcriptional regulation of VEGFA in cancer IUBMB Life 3.885 IRCCS Regina Elena国家癌症研究所
41 CircRNA_0040705促进肝细胞癌的进展 CircRNA_0040705 promotes the progression of hepatocellular carcinoma IUBMB Life 3.885 武汉大学人民医院消化内科
42 circ_0072088/miR-1261/PIK3CA通路的激活可加速肺腺癌的进展 Activation of circ_0072088/miR-1261/PIK3CA pathway accelerates lung adenocarcinoma progression Thorac Cancer 3.500 河北医科大学第四医院
43 综合分析阿霉素致小鼠心脏毒性的环状RNA和mRNA表达谱 Integrating analysis of circular RNA and mRNA expression profiles in doxorubicin induced cardiotoxicity mice J Appl Toxicol 3.446 河北医科大学
44 在喉鳞状细胞癌中,下调circMYOF通过miR-145-5p/OTX1调控轴抑制细胞生长、转移和糖酵解 Knockdown of circMYOF inhibits cell growth, metastasis, and glycolysis through miR-145-5p/OTX1 regulatory axis in laryngeal squamous cell carcinoma Funct Integr Genomics 3.410 玉溪市人民医院口腔颌面外科
45 非编码RNAs在肿瘤耐anoikis抵抗中的潜在作用和机制 The potential roles and mechanisms of non-coding RNAs in cancer anoikis resistance Mol Cell Biochem 3.396 苏州大学附属第一医院
46 circPSAP作为一种高效的miR-331-3p海绵,通过上调HDAC4调节人多发性骨髓瘤细胞的增殖、凋亡和硼替佐米敏感性 Circular RNA circPSAP functions as an efficient miR-331-3p sponge to regulate proliferation, apoptosis and bortezomib sensitivity of human multiple myeloma cells by upregulating HDAC4 J Pharmacol Sci 3.337 郑州大学第二附属医院血液科
47 类病毒模型在分子生物学和其他领域的新兴价值 Emerging value of the viroid model in molecular biology and beyond Virus Res 3.303 密西西比州立大学生物科学系
48 控制类病毒疾病的RNAi工具 RNAi tools for controlling viroid diseases Virus Res 3.303 CSIC
49 miR-153和相关上游/下游通路在癌症中的作用:从潜在的生物标志物到治疗肿瘤耐药性和治疗靶点 The role of miR-153 and related upstream/downstream pathways in cancers: from a potential biomarker to treatment of tumor resistance and a therapeutic target Med Oncol 3.064 设拉子医科大学
50 肺腺癌中潜在环状RNA生物标志物的鉴定:生物信息学分析和回顾性临床研究 Identification of potential circular RNA biomarkers in lung adenocarcinoma: A bioinformatics analysis and retrospective clinical study Oncol Lett 2.967 河北医科大学第四医院
51 竞争性内源RNAs网络的综合分析:由mRNA信号和miRNA信号组成的胃癌预测模型的鉴定和验证 Comprehensive analysis of competitive endogenous RNAs network: Identification and validation of prediction model composed of mRNA signature and miRNA signature in gastric cancer Oncol Lett 2.967 华南理工大学附属广州市第一人民医院医学院病理科
52 不同癌症类型中长链非编码rna和环状rna对ROCK1/2的调控 Regulation of ROCK1/2 by long non-coding RNAs and circular RNAs in different cancer types Oncol Lett 2.967 里法国际大学
53 环状RNAs与甲基化的相互作用:环状rna生物发生和功能的一个重要方面(综述) Interactions of circRNAs with methylation: An important aspect of circRNA biogenesis and function (Review) Mol Med Rep 2.952 联勤保障部队940医院
54 在哮喘中,环状RNA circ_0002594通过海绵化miR-139-5p/TRIM8调控pdgf – bb诱导的人气道平滑肌细胞增殖和迁移 Circular RNA circ_0002594 regulates PDGF-BB-induced proliferation and migration of human airway smooth muscle cells via sponging miR-139-5p/TRIM8 in asthma Autoimmunity 2.815 秦皇岛第一医院儿科
55 CircTRHDE敲低可以保护WI-38细胞免受lps诱导的炎症损伤 CircTRHDE knockdown protects WI-38 cells against LPS-induced inflammatory injury Autoimmunity 2.815 郑州大学郑州中心医院儿科
56 爱卡素升高的circ_0000190通过靶向miR-301a抑制多发性骨髓瘤的恶性进展 Icaritin-elevated circ_0000190 suppresses the malignant progression of multiple myeloma by targeting miR-301a Kaohsiung J Med Sci 2.744 吉林大学第二医院
57 hsa_circ_0000977上调通过海绵化miR-874-3p参与食管鳞癌的进展 Upregulation of hsa_circ_0000977 participates in esophageal squamous cancer progression by sponging miR-874-3p J Clin Lab Anal 2.352 宁波大学附属李惠利医院,浙江大学药学院
58 环状RNA线粒体翻译优化与胃癌淋巴结转移少、无病生存时间长、化疗敏感性高相关 Circular RNA mitochondrial translation optimization 1 correlates with less lymph node metastasis, longer disease-free survival, and higher chemotherapy sensitivity in gastric cancer J Clin Lab Anal 2.352 武汉中医医院,黄石市中心医院
59 非编码RNAs:健康和疾病的无声调控器 Non-coding RNAs: the silent regulators of health and diseases Mol Biol Rep 2.316 印度理工学院医学科学与技术学院
60 CircFOXM1作为ceRNA上调SMAD2,促进鼻咽癌的进展 CircFOXM1 acts as a ceRNA to upregulate SMAD2 and promote the progression of nasopharyngeal carcinoma Mol Genet Genomic Med 2.183 徐州医科大学,南京医科大学附属肿瘤医院
61 CircCRIM1通过miR-34c-5p/FOSL1轴促进鼻咽癌进展 CircCRIM1 promotes nasopharyngeal carcinoma progression via the miR-34c-5p/FOSL1 axis Eur J Med Res 2.175 南华大学附属南华医院肿瘤科,湖南省第二人民医院肿瘤科
62 Hsa_circ_0010729通过靶向miR-665/ING5参与氧葡萄糖剥夺/再氧诱导的人微血管内皮细胞剥夺 Hsa_circ_0010729 is Involved in Oxygen-Glucose Deprivation/Reoxygenation-Induced Human Microvascular Endothelial Cell Deprivation by Targeting miR-665/ING5 Biochem Genet 1.890 宁波大学医学院附属医院神经内科

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