欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.环状的ADAR招募的RNA提高了在体外和体内RNA编辑的效率和保真度
标题：Engineered circular ADAR-recruiting RNAs increase the efficiency and fidelity of RNA editing in vitro and in vivo
杂志：Nat Biotechnol
影响因子：54.908
通讯作者：魏文胜教授（北京大学生命科学学院）
目前使用内源性ADAR酶和工程ADAR招募的RNA (arRNAs)进行程序化RNA编辑的方法存在效率低和旁观者脱靶编辑的问题。在这里，作者描述了LEAPER 2.0，这是LEAPER的更新版本，它使用了共价封闭的环状arRNAs，称为circ-arRNAs。研究证明，在细胞中表达或在体外转录的环状RNA寡核苷酸中传递时，它们的编辑效率平均比线性同类高3.1倍。为了降低脱靶编辑，作者删除了尿苷与脱靶腺苷的配对，这几乎完全消除了其它脱靶腺苷编辑。工程circ-arRNAs提高了细胞培养中内源性CTNNB1和突变型TP53转录本编辑的效率和保真度。在Hurler综合征小鼠模型中使用腺相关病毒递送circ-arRNAs，可以纠正致病性点突变，恢复α-L-iduronidase催化活性，降低肝脏中糖胺聚糖的积累。LEAPER 2.0提供了一种新的arRNA设计，能够实现更精确、更高效的RNA编辑，在治疗和基础研究中具有广泛的适用性。
遗传编码的circ-arRNAs示意图
2. 利用环状引导RNA招募内源性ADARs，进行高效的体外和体内RNA编辑
标题：Efficient in vitro and in vivo RNA editing via recruitment of endogenous ADARs using circular guide RNAs
杂志：Nat Biotechnol
影响因子：54.908
通讯作者：Prashant Mali（加州大学圣地亚哥分校生物工程系）
利用外源引导RNA招募内源性腺苷脱氨酶编辑细胞RNA是一种很有前途的治疗策略，但当前的引导RNA设计在编辑效率和持久性方面仍然很低。如图1所示，在这项研究中作者设计了环状ADAR招募引导RNA (cadRNAs)，以实现更高效的腺苷-肌苷RNA编辑，而不需要任何外源性蛋白的共同传递。利用这些cadRNAs，作者观察到在多个位点和细胞系中，在RNA的非翻译区和编码区，稳健和持久的RNA编辑，以及转录组范围的高特异性。此外，作者通过在反义域中加入分散的环，增加了对目标腺苷的转录水平特异性，减少了bystander编辑。通过腺相关病毒在体内传递cadRNAs，可以在C57BL/6J小鼠肝脏中对mPCSK9转录本进行53%的RNA编辑，并在I-Hurler综合征的IDUA-W392X小鼠模型中对黄色无义突变进行12%的uag – ugg RNA校正。cadRNAs可以在体内进行高效的可编程RNA编辑，并具有多种蛋白调节和基因治疗应用。
图1. 荧光素的报告基因检测内源性ADAR1调控RNA编辑
3. circPTEN1是由PTEN生成的环状RNA，通过抑制TGF-β/Smad信号通路来抑制癌症进展
标题：circPTEN1, a circular RNA generated from PTEN, suppresses cancer progression through inhibition of TGF-β/Smad signaling
杂志：Mol Cancer
影响因子：27.401
通讯作者：尹玉新教授和Hui Liang（北京大学基础医学院）
背景:PTEN是人类癌症中最常见的突变基因之一。虽然典型PTEN蛋白和PTEN亚型的作用已被广泛探讨，但目前对PTEN家族成员的了解还不能充分说明它们在生物过程和肿瘤发展中的多样性。值得注意的是，由PTEN产生的非编码RNA的功能尚未被阐明。
方法:作者搜索circBase和circInteractome来分析PTEN生成环状RNA的潜力。然后通过Sanger测序、RNase R和放线菌素D检测对circPTEN1的环结构进行验证。原位杂交和qRT-PCR检测circPTEN1在结直肠癌(CRC)肿瘤周围和肿瘤组织中的表达水平。此外，通过Transwell实验、三维多细胞肿瘤球形侵袭实验、转移模型等功能实验，利用circPTEN1敲除和过表达细胞株进行体外和体内实验，研究circPTEN1对结直肠癌肿瘤转移的影响。机制上，荧光素酶报告基因测定、荧光原位杂交、电泳迁移率测定、RNA免疫沉淀、RNA下拉和质谱测定被执行。
结果:作者发现了一个由PTEN基因生成的环状RNA，命名为circPTEN1，该RNA在结直肠癌中经常下调，circPTEN1的表达降低预示着较差的生存期。在PDX模型中，circPTEN1低表达可促进体内癌细胞转移，并在体外加速癌细胞侵袭，而circPTEN1过表达则显示出相反的作用。机制上，作者发现circPTEN1能够结合Smad4的MH2结构域，从而破坏其与Smad2/3的物理相互作用，减少Smad复合物的形成和随后的核易位，从而抑制其下游与TGF-β刺激下上皮-间质转化相关的基因表达。此外，作者发现eIF4A3通过直接结合到circPTEN1的侧面区域，抑制了circPTEN1的环化作用。
结论:作者的研究发现了一种由PTEN基因生成的具有肿瘤抑制功能的新型环状RNA，进一步揭示了circPTEN1在TGF-β介导的CRC转移中的作用机制。circPTEN1的发现为PTEN的研究提供了一个新的方向，而阐明circPTEN1/TGF-β/Smad信号通路可能为开发一种潜在的抑制肿瘤进展的治疗策略铺平道路。
PTEN来源且表达量较高的circRNAs
文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | 影响因子 | 单位 |
| 1 | 利用环状引导RNA招募内源性ADARs，进行高效的体外和体内RNA编辑 | Efficient in vitro and in vivo RNA editing via recruitment of endogenous ADARs using circular guide RNAs | Nat Biotechnol | 54.908 | 加州大学圣地亚哥分校 |
| 2 | 设计的环状ADAR招募RNA提高了体外和体内RNA编辑的效率和保真度 | Engineered circular ADAR-recruiting RNAs increase the efficiency and fidelity of RNA editing in vitro and in vivo | Nat Biotechnol | 54.908 | 北京大学生命科学学院 |
| 3 | circPTEN1是由PTEN生成的环状RNA，通过抑制TGF-β/Smad信号通路来抑制癌症进展 | circPTEN1, a circular RNA generated from PTEN, suppresses cancer progression through inhibition of TGF-β/Smad signaling | Mol Cancer | 27.401 | 北京大学 |
| 4 | 环状RNAs作为非侵入性液体活检生物标志物对胃癌早期检测的诊断价值 | Diagnostic efficacy of circular RNAs as noninvasive, liquid biopsy biomarkers for early detection of gastric cancer | Mol Cancer | 27.401 | 贝克曼研究所分子诊断与实验治疗学系 |
| 5 | 抑制肿瘤的circRHOBTB3通过外泌体排出体外，以维持结直肠癌细胞的适应性 | Tumor-suppressive circRHOBTB3 is excreted out of cells via exosome to sustain colorectal cancer cell fitness | Mol Cancer | 27.401 | 浙江大学医学院 |
| 6 | circRNA景观和复杂性的准确识别揭示了其在人类少突胶质细胞分化中的关键作用 | Accurate identification of circRNA landscape and complexity reveals their pivotal roles in human oligodendroglia differentiation | Genome Biol | 13.583 | 埃默里大学 |
| 7 | 检测RNA-RNA interactome | Detecting RNA-RNA interactome | Wiley Interdiscip Rev RNA | 9.957 | Institute of Life Sciences, Nalco Square, Bhubaneswar, India |
| 8 | CircKDM4B通过miR-675/NEDD4L轴抑制乳腺癌进展 | CircKDM4B suppresses breast cancer progression via the miR-675/NEDD4L axis | Oncogene | 9.867 | 山东大学齐鲁医学院 |
| 9 | 非编码RNAs在KRAS调控中的新作用 | Emerging role of non-coding RNAs in the regulation of KRAS | Cancer Cell Int | 5.722 | Shahid Beheshti医学科学大学 |
| 10 | Nrf2通过circ-Vps41/miR-26a-5p/CaMKIV调控网络改善海马突触可塑性、学习和记忆 | Nrf2 improves hippocampal synaptic plasticity, learning and memory through the circ-Vps41/miR-26a-5p/CaMKIV regulatory network | Exp Neurol | 5.330 | 河北医科大学 |
| 11 | 腺苷A 2A受体拮抗剂与内源性竞争rna的改变网络有关，可保护视网膜线粒体损伤 | The adenosine A 2A receptor antagonist protects against retinal mitochondrial injury in association with an altered network of competing endogenous RNAs | Neuropharmacology | 5.250 | 温州医科大学眼科视光学与眼科学院 |
| 12 | Hsa_circ_0134111通过海绵吸光miR-578促进椎间盘退变 | Hsa_circ_0134111 promotes intervertebral disc degeneration via sponging miR-578 | Cell Death Discov | 5.241 | 青岛大学附属医院骨科 |
| 13 | circCELF1通过FTO/ m6A和miR-636调控DKK2的表达抑制心肌纤维化 | circCELF1 Inhibits Myocardial Fibrosis by Regulating the Expression of DKK2 Through FTO/m 6 A and miR-636 | J Cardiovasc Transl Res | 4.132 | 延安大学咸阳医院心内科 |
| 14 | 从单端RNA测序数据中检测环状RNAs的方法评价 | Evaluation of methods to detect circular RNAs from single-end RNA-sequencing data | BMC Genomics | 3.969 | 斯德哥尔摩卡罗林斯卡医学院 |
| 15 | 非编码RNAs在癌症耐药中的潜在作用及机制 | The potential roles and mechanisms of non-coding RNAs in cancer anoikis resistance | Mol Cell Biochem | 3.396 | 苏州大学第一附属医院 |
| 16 | 来自空泡atp酶组装因子VMA21的环状RNA通过降低成熟miR-103的产生来抑制骨关节炎(OA)中脂多糖诱导的软骨细胞凋亡 | Circular RNA Derived from Vacuolar ATPase Assembly Factor VMA21 Suppresses Lipopolysaccharide-Induced Apoptosis of Chondrocytes in Osteoarthritis (OA) by Decreasing Mature miR-103 Production | Mol Biotechnol | 2.695 | 萍乡市人民医院创伤中心创伤急诊科 |
| 17 | Circ_0120175通过海绵吸声miR-330-3p上调SLC7A11，促进喉部鳞状细胞癌的发展 | Circ_0120175 promotes laryngeal squamous cell carcinoma development through up-regulating SLC7A11 by sponging miR-330-3p | J Mol Histol | 2.611 | 华中科技大学同济医学院附属湖北肿瘤医院耳鼻咽喉头颈外科 |
| 18 | 射频消融术不足后，参与肝细胞癌发展的环状RNAs的识别 | Identification of circRNAs involved in the development of hepatocellular carcinoma after insufficient radiofrequency ablation | Neoplasma | 2.575 | 中山大学附属第三医院，南方医科大学茂名市人民医院 |
| 19 | 外泌体circTAOK1通过海绵吸除miR-520h来调节SMAD3的表达，从而促进糖尿病肾病的进展 | Exosomal circTAOK1 contributes to diabetic kidney disease progression through regulating SMAD3 expression by sponging miR-520h | Int Urol Nephrol | 2.370 | 天津医科大学第二医院 |
| 20 | vflip调控的竞争性内源性RNA (ceRNA)网络靶向kshv相关恶性肿瘤的裂解诱导 | vFLIP-regulated competing endogenous RNA (ceRNA) networks targeting lytic induction for KSHV-associated malignancies | J Med Virol | 2.327 | 南京医科大学 |
| 21 | 耗尽hsa_circ_0000567通过调节miR-377-3p / ZFX轴抑制肺腺癌细胞获得性吉非替尼耐药和增殖:一项体外和体内研究 | Depleting hsa_circ_0000567 suppresses acquired gefitinib resistance and proliferation of lung adenocarcinoma cells through regulating the miR-377-3p / ZFX axis: an in vitro and in vivo study | Histol Histopathol | 2.303 | 新乡医学院第一附属医院 |
| 22 | 外泌体circ_0001190通过miR-586/SOSTDC1轴调控胃癌的进展 | Exosomal circ_0001190 Regulates the Progression of Gastric Cancer via miR-586/SOSTDC1 Axis | Biochem Genet | 1.890 | 保定市第二医院 |
| 23 | 环状非编码RNA circ_0007865是一种竞争性内源性RNA，靶向miR-214-3p/FKBP5轴调控脑微血管内皮细胞缺氧诱导的损伤 | Circular noncoding RNA circ_0007865, serves as a competing endogenous RNA, targeting the miR-214-3p/FKBP5 axis to regulate oxygen-glucose deprivation-induced injury in brain microvascular endothelial cells | Neuroreport | 1.837 | 东营市第二人民医院 |
| 24 | [circ-SFMBT2靶向miR-7-5p/ADAM10轴对非小细胞肺癌细胞生物学行为的影响] | [Effect of circ-SFMBT2 on the biological behavior of non-small cell lung cancer cells by targeting the miR-7-5p/ADAM10 axis] | Zhonghua Yi Xue Yi Chuan Xue Za Zhi | Not Found | 南阳市中心医院肿瘤二科 |