欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计33篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.N6甲基腺苷修饰与环状RNA之间的串扰:当前理解和未来方向
标题:Crosstalk between N6-methyladenosine modification and circular RNAs: current understanding and future directions
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.400
通讯作者:史玉玲主任医师和Chunyuan Guo (同济大学医学院附属上海市皮肤病医院)
N6甲基腺苷(m6A)是真核RNA中一种普遍存在的内部修饰,受所谓的“写入者”、“擦除者”和“读取器”的调控。m6A已被证明在调节RNA成熟、定位、翻译和代谢方面发挥关键的分子功能,从而在细胞、发育和疾病过程中发挥重要作用。环状RNA(CircRNA)是一类非编码RNA,由反向剪接产生共价闭合的单链结构。CircRNA还通过独特的机制参与生理和病理过程。尽管m6A和circRNAs在几年前被发现,但由于近年来分子生物学技术的进步,它们引起了越来越多的研究兴趣。最近,一些学者研究了m6A和circRNAs之间的串扰。在这篇综述中,如图1所示作者概述了m6A和circRNAs的最新知识,并根据现有研究总结了这些分子之间的串扰。此外,作者对未来的研究前景提出了一些建议。
图1
2.CSCD2:肿瘤特异性环状RNA的综合相互作用数据库
标题:CSCD2: an integrated interactional database of cancer-specific circular RNAs
杂志:Nucleic Acids Research
影响因子:16.971
通讯作者:何春江教授(武汉大学基础医学院), Leng Han(华中农业大学生物医学与健康学院)
最近的研究已经认识到CircRNA在癌症中的重要作用,因此需要一个组织良好的资源来描述CircRNA与癌症中其他功能分子(如microRNA和RNA结合蛋白)之间的相互作用。作者之前开发了癌症特异性circRNA数据库(CSCD),这是一个癌症特异性circRNA的综合数据库,广泛用于circRNA研究。在此,作者将CSCD更新为CSCD2(http://geneyun. net/CSCD2orhttp://gb. 其中包括从大量人类癌症和正常组织/细胞系中鉴定出的更具癌症特异性的环状RNAs。CSCD2包含超过1000个样本(825个组织和288个细胞系),并识别了大量的CircRNA:1 013 461个癌症特异性CircRNAs,1 533 704个仅来自正常样本的CircRNAs,以及354 422个来自癌症和正常样本的CircRNA。此外,CSCD2利用>200个RBP和2000个microRNAs的结合基序预测潜在的miRNA–circRNA和RBP–circRNA相互作用。同时,还预测了这些环状RNAs可能的全长和开放阅读框序列。总的来说,如图2所示CSCD2为探索CircRNA在癌症中的功能和调节提供了一个显著增强的资源。
图 2
3.肥胖相关的环状RNA circTshz2-2在大脑中调节神经元细胞周期和空间记忆
标题:Obesity-linked circular RNA circTshz2-2 regulates the neuronal cell cycle and spatial memory in the brain
杂志:Mol Psychiatry
影响因子:15.994
通讯作者:Young-Kook Kim(全南大学)
包括肥胖在内的代谢综合征会引起大脑的神经病理生理变化,从而导致认知障碍。只有少数研究探讨了非编码基因在这些病理生理学中的作用。作者通过分析高脂肪喂养的肥胖小鼠的大脑皮层识别出与肥胖相关的环状RNAs(circRNAs)。在这项研究中,作者仔细观察了一个保守的和神经元特异性的circTshz2-2,它影响大脑中的神经元细胞周期和空间记忆。转录组学和细胞分析表明,circTshz2-2的异常调节改变了细胞分裂相关基因的表达,并诱导神经元的细胞周期阻滞在G2/M期。作者发现circTshz2-2与YY1转录复合物结合,抑制Bdnf的转录。circTshz2-2的抑制通过BDNF/TrkB信号通路增加BDNF的表达,减少G2/M checkpoint蛋白如Cyclin B2和CDK1,导致细胞周期阻滞和神经突伸长。相反,过表达circTshz2-2降低BDNF表达,诱导细胞周期蛋白,缩短神经突长度,表明circTshz2-2调控神经元细胞周期和结构。最后,作者发现circTshz2-2影响野生型和肥胖小鼠的空间记忆。作者的数据揭示了与肥胖相关的circTshz2-2在神经元细胞周期和记忆功能方面的潜在调节作用,为代谢综合征和认知缺陷之间提供了新的联系。
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | N6 -甲基腺苷修饰与环状RNAs之间的串扰:目前的认识和未来的方向 | Crosstalk between N6-methyladenosine modification and circular RNAs: current understanding and future directions | Mol Cancer | 27.402 | 同济大学医学院 |
2 | CSCD2:癌症特异性环状RNAs的整合相互作用数据库 | CSCD2: an integrated interactional database of cancer-specific circular RNAs | Nucleic Acids Res | 16.971 | 武汉大学基础医学院,华中农业大学生物医学与健康学院,德州农工大学 |
3 | 肥胖相关的环状RNA circTshz2-2在大脑中调节神经元细胞周期和空间记忆 | Obesity-linked circular RNA circTshz2-2 regulates the neuronal cell cycle and spatial memory in the brain | Mol Psychiatry | 15.990 | 全南大学医学院 |
4 | SRCP: circRNAs准确注释和定量的全面管道 | SRCP: a comprehensive pipeline for accurate annotation and quantification of circRNAs | Genome Biol | 13.580 | 耶路撒冷希伯来大学 |
5 | 多功能CRISPR-Cas13 RNA靶向系统的应用 | Applications of the versatile CRISPR-Cas13 RNA targeting system | Wiley Interdiscip Rev RNA | 9.954 | 波兰科学院生物有机化学研究所 |
6 | CircHAS2通过调控hsa-miR-944介导的PPM1E促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭 | CircHAS2 promotes the proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells by regulating PPM1E mediated by hsa-miR-944 | Cell Death Dis | 8.462 | 南通大学附属医院 |
7 | 灵长类环状RNAs的进化动力学 | Evolutionary dynamics of circular RNAs in primates | Elife | 8.14 | 加文医学研究所 |
8 | 环状RNA序列与进化上年轻的转座因子有关 | Circular RNA repertoires are associated with evolutionarily young transposable elements | Elife | 8.14 | 德国海德堡大学分子生物学中心,瑞士洛桑大学整合基因组学中心 |
9 | 啮齿动物慢性疼痛的表观遗传机制:一个小型综述 | The epigenetic mechanisms involved in chronic pain in rodents: A mini-review | Curr Neuropharmacol | 7.364 | 中山大学中山医学院生理学系 |
10 | 非编码RNAs在黑色素瘤中的生物学功能和潜在的临床应用 | Non-coding RNAs in melanoma: Biological functions and potential clinical applications | Mol Ther Oncolytics | 7.203 | 长治医学院免疫教研室 |
11 | 环状RNA SERPINE2通过调控mir – 3161 -3p/miR-324-5p/ BCL2信号通路促进胶质母细胞瘤的发展 | Circular RNA SERPINE2 promotes development of glioblastoma by regulating the miR-361-3p/miR-324-5p/ BCL2 signaling pathway | Mol Ther Oncolytics | 7.202 | 复旦大学附属上海医学院肿瘤科,复旦大学附属上海肿瘤中心 |
12 | 长链非编码RNAs和环状RNAs在肿瘤血管生成中的作用:从机制到临床意义 | Long non-coding RNAs and circular RNAs in tumor angiogenesis: From mechanisms to clinical significance | Mol Ther Oncolytics | 7.201 | 长江大学,中山大学,连江市人民医院 |
13 | 基于临床前和临床证据揭示miRNA-489作为一种新的抑癌因子在不同癌症中的作用 | Revealing the role of miRNA-489 as a new onco-suppressor factor in different cancers based on pre-clinical and clinical evidence | Int J Biol Macromol | 6.952 | 萨班奇大学,Neyshabur University of Medical Sciences |
14 | 胶质瘤中microRNAs与WNT通路的调控相互作用 | Regulatory interplay between microRNAs and WNT pathway in glioma | Biomed Pharmacother | 6.520 | 伊朗大不里士医学大学免疫学研究中心 |
15 | CircRNAs作为卵巢癌的有效生物标志物:一项系统的范围综述 | CircRNAs as potent biomarkers in ovarian cancer: a systematic scoping review | Cell Mol Biol Lett | 5.782 | 伊朗大不里士医学科学大学 |
16 | 环状RNA Foxo3可促进卵巢癌细胞的进展 | Circular RNA Foxo3 enhances progression of ovarian carcinoma cells | Aging (Albany NY) | 5.683 | 锦州医学院第一附属医院 |
17 | 在肺癌中,环状RNA WHSC1通过调控miR-7/TAB2发挥致癌特性 | Circular RNA WHSC1 exerts oncogenic properties by regulating miR-7/TAB2 in lung cancer | J Cell Mol Med | 5.314 | 华中科技大学同济医学院武汉中心医院老年病科 |
18 | 非编码RNAs在垂体腺瘤中的作用 | The role of noncoding RNAs in pituitary adenoma | Epigenomics | 4.772 | 德黑兰医科大学 |
19 | 使用长读测序技术鉴定全长环状核酸 | Identification of full-length circular nucleic acids using long-read sequencing technologies | Analyst | 4.610 | 东南大学 |
20 | 转录组分析揭示了杀沙门氏菌气单胞菌灭活疫苗诱导大菱鲆早期免疫应答的深刻认识 | Transcriptome analysis reveals deep insights into the early immune response of turbot (Scophthalmus maximus) induced by inactivated Aeromonas salmonicida vaccine | Fish Shellfish Immunol | 4.584 | 青岛农业大学海洋科学与工程学院, |
21 | Circ_0011058通过发挥miR-335-5p海绵的作用,正向调节YAP1,促进甲状腺乳头状癌细胞的增殖、血管生成和抗辐射能力 | Circ_0011058 facilitates proliferation, angiogenesis and radioresistance in papillary thyroid cancer cells by positively regulating YAP1 via acting as miR-335-5p sponge | Cell Signal | 4.311 | 河南省郑州市人民医院 |
22 | 通过MicroRNA 136-5p/丙酮酸脱氢酶激酶4轴,环状RNA circ-ERBB2提高Warburg效应,促进三阴性乳腺癌生长 | Circular RNA circ-ERBB2 Elevates the Warburg Effect and Facilitates Triple-Negative Breast Cancer Growth by the MicroRNA 136-5p/Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4 Axis | Mol Cell Biol | 4.274 | 厦门大学附属福州第二医院 |
23 | hsa_circ_0088212介导的miR-520 h/APOA1轴抑制骨肉瘤进展 | Hsa_circ_0088212-mediated miR-520 h/APOA1 axis inhibits osteosarcoma progression | Transl Oncol | 4.242 | 武汉大学人民医院骨科 |
24 | 胃癌中的环状RNAs:目前的研究和潜在的临床意义 | CircRNAs in gastric cancer: current research and potential clinical implications | FEBS Lett | 4.124 | 中国人民解放军总医院第一医学中心普外科研究所 |
25 | 微小隐孢子虫感染HCT-8细胞中环状RNAs的微阵列分析 | Microarray analysis of circular RNAs in HCT-8 cells infected with Cryptosporidium parvum | Parasit Vectors | 3.874 | 山东大学齐鲁医学院,山东大学附属生殖医院生殖医学中心 |
26 | 回复对文章(Yin YL et al., Parasit Vectors, 10.1186/s13071-021-04739-w)的评论 | Response to comments on our article (Yin YL et al., Parasit Vectors, 10.1186/s13071-021-04739-w) by Yuqing Wang and colleagues | Parasit Vectors | 3.871 | 西北农林科技大学动物医学院寄生虫学教研室 |
27 | Circ_0128846/miR-140-3p/JAK2网络在骨关节炎发展中的作用 | Circ_0128846/miR-140-3p/JAK2 Network in Osteoarthritis Development | Immunol Invest | 3.653 | 天津医科大学第二医院 |
28 | 在乳腺癌细胞中,环状RNA hsa_circ_0001598通过海绵吞噬miR-1184促进程序性死亡配体-1介导的免疫逃逸和曲妥珠单抗耐药 | Circular RNA hsa_circ_0001598 promotes programmed death-ligand-1-mediated immune escape and trastuzumab resistance via sponging miR-1184 in breast cancer cells | Immunol Res | 2.820 | 淄博市中心医院肿瘤科 |
29 | 环状RNA hsa_circ_0000730通过miR-942-5p/PTEN轴抑制宫颈癌细胞增殖、迁移和侵袭 | Circular RNA hsa_circ_0000730 restrains cell proliferation, migration, and invasion in cervical cancer through miR-942-5p/PTEN axis | Kaohsiung J Med Sci | 2.740 | 内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院妇产科 |
30 | CircSAMD11通过Wnt/β-catenin通路调控miR-503/SOX4轴促进宫颈癌的进展 | CircSAMD11 facilitates progression of cervical cancer via regulating miR-503/SOX4 axis through Wnt/β-catenin pathway | Clin Exp Pharmacol Physiol | 2.554 | 右江民族医学院河池医院 |
31 | 在骨肉瘤患者中,环状RNA MTO1与microRNA-630相关,两者都与Enneking分期和/或病理骨折以及预后有关 | Circular RNA MTO1 intercorrelates with microRNA-630, both associate with Enneking stage and/or pathological fracture as well as prognosis in osteosarcoma patients | J Clin Lab Anal | 2.354 | 湖北科技大学第一附属医院咸宁市中心医院 |
32 | Circ-FAF1/Circ-ELP3:一种新的潜在的乳腺癌诊断生物标志物 | Serum Circ-FAF1/Circ-ELP3: A novel potential biomarker for breast cancer diagnosis | J Clin Lab Anal | 2.353 | 伊朗萨南达伊库尔德斯坦医学科学大学 |
33 | CircRNA-1967通过海绵化miR-93-3p增强LEF1的表达,参与山羊SHF-SCs向毛囊的分化 | CircRNA-1967 participates in the differentiation of goat SHF-SCs into hair follicle lineage by sponging miR-93-3p to enhance LEF1 expression | Anim Biotechnol | 2.284 | 沈阳农业大学动物科学与兽医学院 |