欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计48,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、circRNA在膀胱癌中的表达谱、生物学功能和临床意义。

标题:Expression profiles, biological functions and clinical significance of circRNAs in bladder cancer.

杂志:Mol Cancer.Review;影响因子:15.302

通讯作者: Kun Tang(武汉同济医院)

环状RNA(circRNA)是缺少末端5’帽和3’poly(A)尾部的单链闭环RNA分子,由于其在各种疾病的发生和发展中的关键调控作用而受到越来越多的科学关注。随着高通量测序技术的飞速发展,通过探索膀胱癌(BCa)正常组织和细胞系的表达谱,已在BCa中鉴定出越来越多的差异表达circRNA。 CircRNA对BCa的生物学行为调控至关重要地,包括细胞增殖、肿瘤生长抑制、细胞周期停滞,凋亡,侵袭,迁移,血管生成和顺铂化疗耐药性。 Bca中大多数已研究的circRNA通过miRNA海绵调控机制来调控癌症的生物学行为。据报道,CircRNA与BCa的许多临床病理特征显著相关,包括肿瘤大小、分化和分级、淋巴结转移、肿瘤数目远处转移、入侵和复发。此外,circRNA表达水平可用于预测BCa患者的生存参数,例如总生存期(OS),无病生存期(DFS)和无进展生存期(PFS)。 circRNA的丰度、保守性、稳定性、特异性和可检测性使其成为BCa的潜在诊断和预后生物标志物。另外,circRNA在与BCa致癌和进展相关的各种信号通路上游起关键的调节作用,反映了它们作为BCa的治疗靶标的潜力。该综述文章概述了circRNA的表达谱,生物学功能和机制,以及这些分子在BCa诊断,预后和靶向治疗中的潜在临床应用。

图注:膀胱癌与circRNA的关系

2、表征和规避体外合成环状RNA的序列限制。

标题:Characterizing and circumventing sequence restrictions for synthesis of circular RNA in vitro.

杂志:Nucleic Acids Res.;影响因子:11.501

通讯作者:Jason W Rausch(美国国立卫生研究院)

就像真核环状RNA(circRNA)是细胞内剪接的产物一样,可以使用转录模板在体外合成定制的circRNA,其中转录组I内含子的转座一半位于要环化的RNA序列的侧面。这种排列的内含子-外显子(PIE)构建体已被用于生产circRNA版本的核酶,病毒RNA基序的模拟物,链霉亲和素适体以及用于基因工程和疫苗开发的蛋白质表达载体。这种方法的局限性是必须在末端连接位点将小RNA片段(E1和E2)强制整合到新生的circRNA中。这种限制可能会阻止合成对外部序列敏感的小型circRNA治疗剂和RNA纳米颗粒,以及较大的circRNA模拟物,这些模拟物的序列必须与在其上建模的天然物种的序列精确匹配。在这项工作中,研究者使用了连续诱变和体外选择来确定胸苷酸合酶(td)I组内含子PIE转录模板构建物中E1和E2序列的变化如何影响circRNA的合成产量。该研究提出了设计定制的PIE转录模板的指南,从中可以有效地合成几乎任何序列的合成circRNA。

3、环状RNA circDLC1通过与HuR互作抑制MMP1介导的肝癌进展。

标题:Circular RNA circDLC1 inhibits MMP1-mediated liver cancer progression via interaction with HuR.

杂志:Theranostics.;影响因子:8.579

通讯作者:Jiwei Huang、袁克非和曾勇教授(四川大学华西医院)

环状RNA(circRNA)已被证明在癌症进展中起关键作用。最近报道,KIAA1429是m6A甲基转移酶复合物的关键成分,可通过调节m6A甲基化来促进肝癌(HCC)进程。该研究主要聚焦在环状RNA在KIAA1429介导的HCC进展中的作用。研究者首先利用RNA测序(RNA-seq)和甲基化RNA免疫沉淀测序(m6A-seq)鉴定KIAA1429调控的circRNA。在体外和体内检查了circDLC1对肝癌细胞增殖和转移的影响。用RT-qPCR检测circDLC1在肝癌组织和肝癌细胞中的表达。 RNA FISH,RIP分析和生物素标记的RNApulldown用于研究circDLC1的下游效应子。使用RNA-seq鉴定circDLC1的下游靶标。研究结果表明,circDLC1在肝癌组织中下调,与良好的预后密切相关。 circDLC1的过表达在体内外抑制肝癌细胞的增殖和运动,而circDLC1的沉默则起相反的作用。机理研究表明,circDLC1可以与RNA结合蛋白HuR结合,从而减少HuR与MMP1 mRNA之间的相互作用,从而抑制MMP1的表达,最终有助于抑制HCC进程。研究结论表明,KIAA1429的下游靶标circDLC1是HCC患者有希望的预后标志物,而circDLC1-HuR-MMP1轴可作为HCC治疗的潜在治疗靶标。

图注:circDLC1是KIAA1429调控的circRNA且与肝癌患者预后相关

文献列表:

序号

主要内容

论文标题

杂志

影响因子

单位

1

circRNA在膀胱癌中的表达谱,生物学功能和临床意义。

Expression profiles, biological functions and clinical significance of circRNAs in bladder cancer.

Mol Cancer.Review

15.302

武汉同济医院等

2

表征和规避体外合成环状RNA的序列限制。

Characterizing and circumventing sequence restrictions for synthesis of circular RNA in vitro.

Nucleic Acids Res.

11.501

美国国立卫生研究院等

3

环状RNA circDLC1通过与HuR互作抑制MMP1介导的肝癌进展。

Circular RNA circDLC1 inhibits MMP1-mediated liver cancer progression via interaction with HuR.

Theranostics.

8.579

四川大学华西医院等

4

在神经变性过程中使用circRNA签名进行研究后,视网膜成为大脑功能障碍的窗口。

Retina as a window to cerebral dysfunction following studies with circRNA signature during neurodegeneration.

Theranostics.

8.579

复旦大学等

5

雌激素诱导的circRNA,circPGR,起ceRNA的作用,通过调节细胞周期相关基因来促进雌激素受体阳性乳腺癌细胞的生长。

Estrogen-induced circRNA, circPGR, functions as a ceRNA to promote estrogen receptor-positive breast cancer cell growth by regulating cell cycle-related genes.

Theranostics.

8.579

厦门大学药学院等

6

长细胞外RNA的综合分析揭示了肝癌非编码RNA的检测 panel。

Integrative analysis of long extracellular RNAs reveals a detection panel of noncoding RNAs for liver cancer.

Theranostics.

8.579

清华大学等

7

circHIPK3参与小鼠糖尿病性心肌病的发病机制。

Involvement of circHIPK3 in the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy in mice.

Diabetologia.

7.518

苏州大学第二附属医院等

8

非编码RNA调节癌症中的选择性剪接。

Noncoding RNAs regulate alternative splicing in Cancer.

J Exp Clin Cancer Res.Review

7.068

徐州医科大学附属医院等

9

环状RNA circLMO7充当microRNA-30a-3p海绵,通过WNT2 /β-catenin途径促进胃癌的进展。

Circular RNA circLMO7 acts as a microRNA-30a-3p sponge to promote gastric cancer progression via the WNT2/beta-catenin pathway.

J Exp Clin Cancer Res.

7.068

南京医科大学等

10

顺式和反式RNA调控元件在白血病中的作用。

The Role of cis- and trans-Acting RNA Regulatory Elements in Leukemia.

Cancers (Basel).Review

6.126

宾夕法尼亚大学等

11

CircNOL10通过海绵化miR-767-5p来调节SOCS2/JAK/STAT信号传导,从而抑制乳腺癌的进展。

CircNOL10 suppresses breast cancer progression by sponging miR-767-5p to regulate SOCS2/JAK/STAT signaling.

J Biomed Sci.

5.762

郑州大学第一附属医院等

12

Circ-ZDHHC5通过miR-217/ZEB1轴在体外加速食管鳞状细胞癌的进展。

Circ-ZDHHC5 Accelerates Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression in vitro via miR-217/ZEB1 Axis.

Front Cell Dev Biol.

5.201

南京市第一医院等

13

下调circ-TRPS1通过调节miR-124-3p/EZH2轴介导的干性,抑制前列腺癌的预后。

Downregulation of circ-TRPS1 suppressed prostatic cancer prognoses by regulating miR-124-3p/EZH2 axis-mediated stemness.

Am J Cancer Res.

5.177

上海华山医院等

14

CircARID1A通过充当miR-6368的海绵来调节小鼠骨骼肌的再生。

CircARID1A regulates mouse skeletal muscle regeneration by functioning as a sponge of miR-6368.

FASEB J.

4.966

江苏师范大学生命科学学院等

15

circIgf1r沉默在癫痫发作中通过调节星形胶质细胞极化在神经元损伤中起保护作用。

Silencing of circIgf1r plays a protective role in neuronal injury via regulating astrocyte polarization during epilepsy.

FASEB J.

4.966

武汉大学等

16

通过微阵列分析鉴定响应石墨烯量子点小胶质细胞的潜在circRNA-miRNA-mRNA调控网络。

Identification of potential circRNA-miRNA-mRNA regulatory networks in response to graphene quantum dots in microglia by microarray analysis.

Ecotoxicol Environ Saf.

4.872

东南大学公共卫生学院等

17

CircRNA ciRS-7:多种癌症中的新型致癌基因。

CircRNA ciRS-7: a Novel Oncogene in Multiple Cancers.

Int J Biol Sci.Review

4.858

中国医科大学附属盛京医院等

18

全转录组RNA测序揭示了甜菜(Beta vulgaris)对盐胁迫的响应,mRNA,lncRNA,miRNA和circRNA的全局分子响应和CeRNA调控网络。

Whole-Transcriptome RNA Sequencing Reveals the Global Molecular Responses and CeRNA Regulatory Network of mRNAs, lncRNAs, miRNAs and circRNAs in Response to Salt Stress in Sugar Beet (Beta vulgaris).

Int J Mol Sci.

4.556

哈尔滨工业大学等

19

小儿扩张型心肌病中环状RNA的差异表达谱和功能预测。

Differential Expression Profiles and Functional Prediction of Circular RNAs in Pediatric Dilated Cardiomyopathy.

Front Mol Biosci.

4.188

山东齐鲁医院等

20

涎腺腺样囊性癌的环状RNA表达谱和环状RNA-微小RNA网络的构建。

Expression profile of circular RNA and construction of circular RNA-Micro RNA network in salivary adenoid cystic carcinoma.

Cancer Cell Int.

4.175

上海第九人民医院等

21

CircRNA PIP5K1A通过上调miR-515-5p的TCF12/PI3K/AKT途径的上调来促进神经胶质瘤的发展。

CircRNA PIP5K1A promotes the progression of glioma through upregulation of the TCF12/PI3K/AKT pathway by sponging miR-515-5p.

Cancer Cell Int.

4.175

河北大学附属医院等

22

Circ-CCDC66通过抑制miR-452-5p上调REXO1表达,从而加剧宫颈癌的进展。

Circ-CCDC66 upregulates REXO1 expression to aggravate cervical cancer progression via restraining miR-452-5p.

Cancer Cell Int.

4.175

武汉大学人民医院等

23

Circ_ZFR通过海绵化miR-195-5p上调KPNA4来促进紫杉醇耐药性和非小细胞肺癌的进展。

Circ_ZFR contributes to the paclitaxel resistance and progression of non-small cell lung cancer by upregulating KPNA4 through sponging miR-195-5p.

Cancer Cell Int.

4.175

湖北医科大学附属太和医院等

24

癌症相关的环状RNA:多种生物学功能。

Cancer-related circular RNA: diverse biological functions.

Cancer Cell Int.Review

4.175

中美(河南)荷美尔癌症研究所等

25

环状RNA hsa_circ_0061395通过调节miR-877-5p/PIK3R3轴来加速肝细胞癌的进展。

Circular RNA hsa_circ_0061395 accelerates hepatocellular carcinoma progression via regulation of the miR-877-5p/PIK3R3 axis.

Cancer Cell Int.

4.175

吉林大学第二医院等

26

动脉粥样硬化进展过程中的差异性RNA表达谱和竞争性内源性RNA相关调控网络。

Differential RNA expression profiles and competing endogenous RNA-associated regulatory networks during the progression of atherosclerosis.

Epigenomics.

4.112

哈尔滨医科大学附属第二医院等

27

有氧运动可通过circRIMS2/miR-186/BDNF介导的神经元凋亡改善VCI。

Aerobic exercise improves VCI through circRIMS2/miR-186/BDNF-mediated neuronal apoptosis.

Mol Med.

4.096

天津医科大学总医院等

28

microRNA-338-3p在癌症中的作用:生长,侵袭,化学抗性和介体。

The role of microRNA-338-3p in cancer: growth, invasion, chemoresistance, and mediators.

Life Sci.Review

3.647

约翰内斯堡大学等

29

环状RNA作为早产中的新型调节剂和生物标志物的鉴定与表征。

Identification and Characterization of Circular RNA as a Novel Regulator and Biomarker in Preterm Birth.

Front Bioeng Biotechnol.

3.644

重庆医科大学附属第一医院等

30

血清外泌体hsa_circ_0026611的表达上调与食管鳞状细胞癌的淋巴结转移和预后不良有关。

Upregulated expression of serum exosomal hsa_circ_0026611 is associated with lymph node metastasis and poor prognosis of esophageal squamous cell carcinoma.

J Cancer.

3.565

福建医科大学等

31

CircPVT1通过miR-149-5p/FOXM1轴调节卵巢癌中的细胞增殖和侵袭。

Circular PVT1 regulates cell proliferation and invasion via miR-149-5p/FOXM1 axis in ovarian cancer.

J Cancer.

3.565

苏州大学附属第一医院等

32

CircWHSC1作为促进肝细胞癌进展的致癌基因。

CircWHSC1 serves as an oncogene to promote hepatocellular carcinoma progression.

Eur J Clin Invest.

3.481

山西白求恩医院

33

circHIPK3通过调节骨肉瘤细胞中的miR-637/HDAC4信号传导来促进增殖,迁移和侵袭。

circHIPK3 promotes proliferation and migration and invasion via regulation of miR-637/HDAC4 signaling in osteosarcoma cells.

Oncol Rep.

3.417

中国医科大学附属盛京医院等

34

系统地鉴定和表征与水稻剑叶衰老有关的环状RNA。

Systematic identification and characterization of circular RNAs involved in flag leaf senescence of rice.

Planta.

3.39

江西农业大学等

35

环状RNA circGSE1通过miR-138-5p /波形蛋白促进宫颈癌的进展。

Circular RNA circGSE1 Promotes Cervical Cancer Progression Through miR-138-5p/Vimentin.

Onco Targets Ther.

3.337

郑州大学第三附属医院等

36

基于胶囊网络架构,鉴定circRNA结合蛋白的序列特异性。

Identifying the sequence specificities of circRNA-binding proteins based on a capsule network architecture.

BMC Bioinformatics.

3.242

陕西师范大学等

37

PCirc:基于森林的随机植物circRNA识别软件。

PCirc: random forest-based plant circRNA identification software.

BMC Bioinformatics.

3.242

西北师范大学生命科学学院等

38

环状RNA CSNK1G1通过靶向miR-4428/FUT2轴来促进骨关节炎的发展。

Circular RNA CSNK1G1 promotes the progression of osteoarthritis by targeting the miR-4428/FUT2 axis.

Int J Mol Med.

3.098

深圳市福田区风湿病专科医院

39

食管鳞状细胞癌中差异环状RNA和长非编码RNA谱以及相关竞争性内源RNA网络的综合分析。

Integrative analysis of differential circular RNA and long non-coding RNA profiles and associated competing endogenous RNA networks in esophageal squamous cell carcinoma.

Funct Integr Genomics.

3.058

苏州大学附属第一医院等

40

牛皮癣中Circ_0061012通过的miR-194-5p/GAB1轴促进IL-22诱导的角质形成细胞增殖、迁移和侵袭。

Circ_0061012 contributes to IL-22-induced proliferation, migration and invasion in keratinocytes through miR-194-5p/GAB1 axis in psoriasis.

Biosci Rep.

2.942

湖北省中医院等

41

CircSKA3调节FOXM1以促进细胞增殖,迁移和侵袭,同时通过miR-383-5p在髓母细胞瘤中限制细胞凋亡。

CircSKA3 Modulates FOXM1 to Facilitate Cell Proliferation, Migration, and Invasion While Confine Apoptosis in Medulloblastoma via miR-383-5p.

Cancer Manag Res.

2.886

山东省立医院西院等

42

环状RNA RBM33通过调节miR-758-3p/PUM2轴促进宫颈癌的进展。

Circular RNA RBM33 contributes to cervical cancer progression via modulation of the miR-758-3p/PUM2 axis.

J Mol Histol.

2.531

江苏大学附属金坛医院等

43

通过高通量测序鉴定瘢痕loid和正常皮肤组织中差异表达的环状RNA。

Identification of Differentially Expressed Circular RNAs in Keloid and Normal Skin Tissue by High-throughput Sequencing.

Dermatol Ther.

2.327

复旦大学附属耳鼻咽喉医院等

44

circFOXO3保护心肌细胞免受辐射诱导的心脏毒性。

circFOXO3 protects cardiomyocytes against radiation鈥慽nduced cardiotoxicity.

Mol Med Rep.

2.1

福建龙岩人民医院等

45

Circ_0114876通过靶向miR-671/TRAF2轴促进了IL-1β诱导的软骨细胞损伤。

Circ_0114876 promoted IL-1尾-induced chondrocyte injury by targeting miR-671/TRAF2 axis.

Biotechnol Lett.

1.977

暨南大学附属第一医院等

46

环状RNA在囊性棘球co病囊周组织中的表达谱。

Expression profile of circular RNAs in cystic echinococcosis pericystic tissue.

J Clin Lab Anal.

1.54

新疆维吾尔自治区人民医院等

47

CircRNA DNA甲基转移酶1沉默通过调节micoRNA-485-3p /锌指E-box结合同源异型盒1轴来抑制乳腺癌的发展。

CircRNA DNA methyltransferase 1 silence inhibits breast cancer development by regulating micoRNA-485-3p/zinc finger E-box binding homeobox 1 axis.

J Obstet Gynaecol Res.

1.392

江西肿瘤医院等

48

肝细胞癌中circRNA-miRNA-mRNA调控网络的鉴定和分析。

Identification and analysis of circRNA-miRNA-mRNA regulatory network in hepatocellular carcinoma.

IET Syst Biol

1

重庆三峡学院等

 

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