欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布（1月15日-2月15日）的circRNA文献共计35篇，春节期间cell杂志同期连发2篇重磅级circRNA在肿瘤学中的研究，可谓开门红，为circRNA的研究提供了更丰富的资源和新视角，下面我们一起回顾下过去一个月circRNA有哪些进展。
1、局限性前列腺癌中环状RNA大规模功能研究
文献标题：Widespread and Functional RNA Circularization in Localized Prostate Cancer.
期刊：cell 影响因子：31.398
通讯作者单位：加拿大多伦多大学
该研究由加拿大多伦多大学Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授共同主导，利用高通量测序RNA-seq和大规模shRNA文库技术系统系探讨了circRNA在局限性前列腺癌中表达特征和生物功能。研究者首先对144例前列腺癌标本，进行高通量测序，鉴定到7千多个circRNA分子，结合临床资料统计分析发现，circRNA表达特征与前列腺癌侵袭转移密切关联，shRNA文库技术发现其中约11.3%circRNA是前列腺癌细胞增殖必需，而这些circRNA对应的线性mRNA则不影响细胞增殖，表明circRNA的功能是独立且重要的，最后研究者重点关注的circCSNK1G3可以结合miR-181发挥功能，该circRNA在前列腺癌中稳定了miR-181的活性，共同促进癌症发展，区别于大多数文献报道的circRNA吸附miRNA模式。该文献详细解读，请点击我们公众号历史文章：重磅！ Cell杂志同期发表两篇circRNA研究文章。
2、癌症circRNA全方位研究
文献标题：The Landscape of Circular RNA in Cancer
期刊：cell 影响因子：31.398
通讯作者单位：美国密歇根大学
美国密歇根大学的Arul M. Chinnaiyan教授团队，利用新型外显子捕获方法在2000例泛癌标本中检测外显子来源的circRNA，完整地获取了circRNA和对应线性RNA的表达量特征，并利用这些数据建立MiOncoCirc（https://mioncocirc.github.io/）数据库。同时该研究还发现了一类新的circRNA分子(rt-circRNA)—Read-through circRNA，即基因组中上游基因与下游基因的外显子反向拼接形成的circRNA，这与之前报道的融合基因来源的circRNA有所不同，rt-circRNA所对应的基因组并未发生任何序列变化。该文献也证实大部分circRNA表达模式与其来源线性mRNA没有必然联系，相对独立，提示circRNA的重要功能。Arul M. Chinnaiyan教授对circRNA作为无创生物标记物的潜力非常看好，circRNA的稳定性可以在癌症患者血液或尿液中检测到，提示对癌症诊断和预后的作用，同时他们在前列腺癌患者尿液中检测circRNAs分子的表达，将进一步探索这些circRNAs作为尿液或血液为基础的癌症生物标志物的价值。该文献详细解读，请点击我们公众号历史文章：重磅！ Cell杂志同期发表两篇circRNA研究文章。
3、RNA组学分子是癌症液体活检生物标记物的重要资源
文献标题：The circulating transcriptome as a source of cancer liquid biopsy biomarkers
期刊：Semin Cancer Biol 影响因子：10.198
通讯作者单位：牛津大学约翰拉德克利夫医院
该篇综述文章系统性总结介绍了RNA分子（mRNA，small RNA，lncRNA和circRNA等）作为癌症液体活检生物标记物的重要潜能，回顾了已报道的作为癌症液体活检标记物的相关重要RNA分子。非侵入性生物标志物或液体活组织检查有可能彻底改变癌症患者管理，该技术允许重复采样实时监测疾病进展和对治疗的反应，容易实现早期干预和动态治疗管理，是个性化医疗的基石。循环系统中转录组研究数据是寻找潜在的癌症生物标志物的丰富资源，随着RNA-seq技术的快速发展，循环系统中发现越来越多的RNA分子，其包括编码和非编码许多类型的RNA，如mRNA，snRNA，snoRNA，piRNA，YRNA，lncRNA和circRNA。在这篇综述中，作者还特别阐述了，RNA分子成为常规临床实践的一部分仍有待克服的障碍和限制，值得进一步细读。
- 原发性乳腺癌中circRNA组学研究
文献标题：The circular RNome of primary breast cancer
期刊：Genome Res. 影响因子：10.101
通讯作者单位：荷兰鹿特丹大学医学中心
该研究作者共分析了348个原发性乳腺癌的RNA-seq数据，并开发了一种不依赖于未映射读数或已知剪接点的识别circRNA的方法。共确定了95843个circRNA，其中20441个之前被报道发现。在匹配相同基因的外显子边界的circRNA中，668与线性基因的表达水平显示差或甚至负（R<0.2）相关性。生物信息分析表明，只有少数（8.5％）的circRNA可以用已知的剪接事件来解释。这些观察结果均表明circRNA存在特定调节过程。乳腺癌亚组相关的circRNA谱分析表明circRNA与乳腺癌淋巴细胞浸润量和增殖相关。研究者进一步证实了CNOT2，CREBBP和RERE来源的circRNA，siRNA敲低circCNOT2后可显著降低乳腺癌细胞系MCF-7和BT-474的增殖活力，此外，circCNOT2而非线性CNOT2表达水平可预测晚期乳腺癌患者芳香酶抑制剂（AI）治疗的无进展生存时间，并发现circCNOT2可在血浆中检测到。提示circCNOT2在乳腺癌治疗中的重要价值。
图注：A:circCNOT2表达与AI治疗患者Kaplan-Meier生存曲线临床评估;B:circCNOT2患者血浆样本中的表达
参考文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | 局限性前列腺癌中环状RNA大规模功能研究 | Widespread and Functional RNA Circularization in Localized Prostate Cancer. | cell | 31.398 | 加拿大多伦多大学 |
| 2 | 癌症circRNA全方位研究 | The Landscape of Circular RNA in Cancer | cell | 31.398 | 美国密歇根大学 |
| 3 | RNA组学分子是癌症液体活检生物标记物的重要资源 | The circulating transcriptome as a source of cancer liquid biopsy biomarkers | Semin Cancer Biol. | 10.198 | 牛津大学约翰拉德克利夫医院 |
| 4 | 原发性乳腺癌中circRNA组学研究 | The circular RNome of primary breast cancer | Genome Res. | 10.101 | 荷兰鹿特丹大学医学中心 |
| 5 | 重建全长环状RNA进行同种型水平定量。 | Reconstruction of full-length circular RNAs enables isoform-level quantification | Genome Med. | 8.898 | 中国科学院昆明 |
| 6 | 环状RNA 100146通过直接结合非小细胞肺癌中的miR-361-3p和miR-615-5p而作为致癌基因发挥作用 | Circular RNA 100146 functions as an oncogene through direct binding to miR-361-3p and miR-615-5p in non-small cell lung cancer | Mol Cancer. | 7.776 | 广州医科大学 |
| 7 | 环状RNA circNRIP1充当microRNA-149-5p海绵，通过AKT1 / mTOR途径促进胃癌进展 | Circular RNA circNRIP1 acts as a microRNA-149-5p sponge to promote gastric cancer progression via the AKT1/mTOR pathway | Mol Cancer. | 7.776 | 南京医科大学 |
| 8 | circKIF4A作为调节三阴性乳腺癌进展的预后因子和调控者 | circKIF4A acts as a prognostic factor and mediator to regulate the progression of triple-negative breast cancer | Mol Cancer. | 7.776 | 中山大学癌症中心 |
| 9 | circRNA.33186通过海绵miR-127-5p促进骨关节炎的发病机制 | circRNA.33186 Contributes to the Pathogenesis of Osteoarthritis by Sponging miR-127-5p | Mol Ther. | 7.008 | 第二军医大学 |
| 10 | 分析mRNA和ncRNAs的相互作用预测骨肉瘤耐药性中竞争性内源性RNA网络 | Analyzing the Interactions of mRNAs and ncRNAs to Predict Competing Endogenous RNA Networks in Osteosarcoma Chemo-Resistance. | Mol Ther. | 7.008 | 同济大学医学院 |
| 11 | Circ-ZNF609调节横纹肌肉瘤的G1-S进展 | Circ-ZNF609 regulates G1-S progression in rhabdomyosarcoma | Oncogene. | 6.854 | 意大利理工学院 |
| 12 | CircRNA circ_0000190通过调节miR-767-5p / MAPK4通路抑制多发性骨髓瘤的进展 | CircRNA circ_0000190 inhibits the progression of multiple myeloma through modulating miR-767-5p/MAPK4 pathway | J Exp Clin Cancer Res. | 6.217 | 中山大学附属第三医院 |
| 13 | Hsa_circRNA_0054633在妊娠期糖尿病中高表达，与糖基化指数密切相关 | Hsa_circRNA_0054633 is highly expressed in gestational diabetes mellitus and closely related to glycosylation index | Clin Epigenetics. | 6.091 | 宁波大学医学院 |
| 14 | 环状RNA-Filip11结合MicroRNA-1224通过靶向Ubr5调节慢性炎性疼痛。 | MicroRNA-1224 splicing circularRNA-Filip1l in an Ago2- dependent manner regulates chronic inflammatory pain via targeting Ubr5. | J Neurosci | 5.97 | 徐州医科大学附属医院 |
| 15 | CircOMA1介导的miR-145-5p通过靶向TPT1抑制非功能性垂体腺瘤的肿瘤生长 | CircOMA1 mediated miR-145-5p suppresses tumor growth of nonfunctioning pituitary adenomas by targeting TPT1 | J Clin Endocrinol Metab. | 5.789 | 中山大学癌症中心 |
| 16 | 大规模环状RNA分析揭示了玉米和拟南芥对干旱胁迫响应的通用分子机制 | A large-scale circular RNA profiling reveals universal molecular mechanisms responsive to drought stress in maize and Arabidopsis | Plant J. | 5.775 | 华中农业大学 |
| 17 | 在胚胎植入期间，ciR8073-miR181a-神经侵袭途径抑制子宫内膜上皮细胞凋亡。 | Endometrial Epithelial Cell Apoptosis Is Inhibited by a ciR8073-miR181a-Neurotensis Pathway during Embryo Implantation. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.66 | 西北农林科技大学 |
| 18 | 环状RNA hsa_circ_001783通过海绵miR-200c-3p调节乳腺癌进展。 | Circular RNA hsa_circ_001783 regulates breast cancer progression via sponging miR-200c-3p. | Cell Death Dis. | 5.638 | 中山大学孙中山纪念医院 |
| 19 | microRNA与11种植物中线性和环状RNA的可变剪接之间的相互作用 | The interplay between microRNA and alternative splicing of linear and circular RNAs in eleven plant species | Bioinformatics. | 5.481 | 加州大学 |
| 20 | circRNA-microRNA：对癌症诊断和治疗的新兴意义 | The circRNA-microRNA code: emerging implications for cancer diagnosis and treatment | Mol Oncol. | 5.264 | 以色列Weizmann科学研究所 |
| 21 | 大鼠创伤性脊髓损伤中circRNA的差异表达谱及功能预测 | Differential expression profiles and functional predication of circRNA in traumatic spinal cord injury of rats | J Neurotrauma. | 5.002 | 上海交大医学院 |
| 22 | 环状RNA circASS1在乳腺癌细胞MDA-MB-231中下调并抑制侵袭和迁移 | Circular RNA circASS1 is downregulated in breast cancer cells MDA-MB-231 and suppressed invasion and migration. | Epigenomics | 4.979 | 南京医科大学附属肿瘤医院 |
| 23 | 缺血后处理减轻肝脏缺血再灌注损伤的综合circRNA表达谱 | Comprehensive circRNA expression profile during ischemic postconditioning attenuating hepatic ischemia/reperfusion injury | Sci Rep. | 4.122 | 中南大学湘雅三医院 |
| 24 | CircFunBase：功能性环状RNA的数据库 | CircFunBase: a database for functional circular RNAs | Database (Oxford). | 3.978 | 山东农业大学 |
| 25 | 环状RNA在大鼠内膜增生中的表达谱及靶基因预测 | Expression profile of circular RNA in rat intimal hyperplasia and target gene prediction. | J Cell Physiol | 3.923 | 泸州西南医科大学 |
| 26 | 环状RNA circ_0001946作为竞争性内源性RNA，通过调节miR-671-5p和CDR1来抑制胶质母细胞瘤的进展。 | Circular RNA circ_0001946 acts as a competing endogenous RNA to inhibit glioblastoma progression by modulating miR-671-5p and CDR1 | J Cell Physiol | 3.923 | 中国医科大学附属盛京医院 |
| 27 | 环状RNA hsa_circ_0007059通过AKT/mTOR在口腔鳞状细胞癌中影响恶性行为 | Circular RNA hsa_circ_0007059 indicates prognosis and influences malignant behavior via AKT/mTOR in oral squamous cell carcinoma | J Cell Physiol | 3.923 | 北京大学深圳医院 |
| 28 | 斑马鱼生理发育过程中环状RNA表达谱分析 | Profiles analysis reveals circular RNAs involving zebrafish physiological development | J Cell Physiol | 3.923 | 南京市妇幼保健院 |
| 29 | 人脐带间充质干细胞向心肌样细胞分化过程中的环状RNA表达谱 | Circular RNA expression profiles during the differentiation of human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells into cardiomyocyte-like cells | J Cell Physiol | 3.923 | 江苏泰州人民医院 |
| 30 | 环状RNA hsa_circ_0079929抑制肝细胞癌中的肿瘤生长。 | A circular RNA hsa_circ_0079929 inhibits tumor growth in hepatocellular carcinoma. | Cancer Manag Res | 3.702 | 苏州大学附属第一医院 |
| 31 | 鉴定病毒编码的环状RNA | Identification of virus-encoded circular RNA | Virology. | 3.374 | 中山大学孙中山纪念医院 |
| 32 | Hsa_circ_0067997通过抑制miR-515-5p和激活X染色体连锁凋亡抑制因子（XIAP）促进胃癌的进展 | Hsa_circ_0067997 promotes the progression of gastric cancer by inhibition of miR-515-5p and activation of X chromosome-linked inhibitor of apoptosis (XIAP) | Artif Cells Nanomed Biotechnol. | 3.026 | 安阳市人民医院 |
| 33 | 从抗辐射胶质瘤细胞分离的细胞外囊泡中环状RNA的表达谱和潜在功能 | Expression profiles and potential functions of circular RNAs in extracellular vesicles isolated from radioresistant glioma cells | Oncol Rep. | 2.976 | 南京医科大学 |
| 34 | 环状RNA-PRKCI作为竞争性内源性RNA通过海绵状miR-3680-3p在食管鳞状细胞癌中调节AKT3表达起作用。 | Circular RNA circ-PRKCI functions as a competitive endogenous RNA to regulate AKT3 expression by sponging miR-3680-3p in esophageal squamous cell carcinoma | J Cell Biochem. | 2.959 | 南通大学南通市第三人民医院 |
| 35 | 银屑病皮损中的间充质干细胞通过环状RNA影响皮肤微环境 | Mesenchymal stem cells in psoriatic lesions affect the skin microenvironment through circular RNA | Exp Dermatol. | 2.608 | 第四军医大学西京医院 |