4月下旬发表circRNA文献共计23篇,大部分是研究论文,还发布了一个circRNA疾病相关数据,详解本公众号历史文章:疾病相关环形RNA数据库circRNA Disease发布;外泌体中circRNA研究论文2篇,其中一篇与肝癌相关,解读链接:外泌体研究之砷慢性中毒会通过外泌体诱发肝癌;下面我们一起详细了解下另外一篇胰腺癌细胞来源外泌体中circ-PDE8A的作用机制文章。

胰腺导管腺癌(PDAC)是胰腺癌中最常见的一种恶性疾病,5年生存率低于5%,致死率高于其他肿瘤,可谓癌症之王,大多数胰腺癌病人确诊后就是晚期,如何提高PDAC的早期诊断力,一直是癌症研究人员奋斗的方向之一。外泌体和circRNA是最近分子诊断标记物的研究热门,该论文的研究者在高侵袭性的PDAC细胞来源的外泌体中发现circ-PDE8A,并深入探讨了circ-PDE8A在PDAC发生发展中的作用,下面我们一起解读下这篇研究论文的结果。

图:外泌体中的circPDE8A参与PDAC侵袭过程中的作用机制模式图

1、证实PDAC肿瘤外泌体中circ-PDE8A的存在和特征

图1、A:实验研究技术路线,构建Hs766T低转移和Hs766T-L2高转移细胞模型,分离外泌体,提取RNA进行circRNA芯片筛选;B-C:Hs766T-L2高转移性细胞及外泌体中几个circRNA的qRT-PCR验证;D-F:circRNA过表达载体和siRNA及PCR引物设计示意图;

图2、G:BxPC-3细胞中验证circ-PDE8A的过表达和siRNA干扰效率;H-I:过表达circ-PDE8A后Hs766T细胞侵袭能力改变;J-M:qPCR验证circ-PDE8A在胰腺癌细胞Hs766T中表达特性;

2、胰腺癌患者样本中高表达的circ-PDE8A与癌症进展及预后相关

图3、A-C:circ-PDE8A及线性PDE8A基因在胰腺癌细胞和组织样本中的相对表达水平分析;D-F:5对淋巴结转移及非淋巴结转移PDAC患者样本中circ-PDE8A表达水平变化;

图4、G-H:87个PDAC患者中circ-PDE8A及线性PDE8A基因的KM生存曲线分析

  1. circ-PDE8A通过激活MET促进PDAC细胞侵袭

图5、划痕和transwell实验表明过表达circPDE8A显著促进PDAC细胞增殖、迁移和侵袭;

图6、过表达circ-PDE8A后,MET蛋白及相关EMT标志蛋白表达改变显著增高;

  1. 证实circ-PDE8A可吸附miR-338发挥作用

图7、A-B免疫荧光观测circPDE8A定位细胞质;C:circPDE8与mir-338表达负相关;D-F:S生物信息学和荧光素酶报告基因实验验证circPDE8与mir-338存在互作结合位点;G:RNA免疫共沉淀实验(RIP)验证circPDE8与mir-338互作;

图8、circRNA pull-down实验,分别设计circPDE8A和miR-338的生物素探针,验证是否可以互相拉取对方,足以证明circPDE8A和miR-338的直接相互作用;

  1. 示踪外泌体与PDAC细胞通讯

图9:外泌体电镜及WB鉴定,Dli标记外泌体和胰腺癌细胞共培养并激光共聚焦显微镜观测

图10、提取过表达circPDE8A的胰腺癌细胞来源的外泌体与BxPC3、Capan-1细胞共培养后,WB检测AKT通路相关蛋白表达变化,E-F体内实验表明exosmes共培养后的BxPC3细胞可形成原为瘤;

参考文献列表

序号 论文标题 杂志 IF 单位
1 205P RNA-seq analysis of lung adenocarcinomas reveals different circular RNA expression profiles between non-metastatic and metastatic patients

转录组测序分析circRNA在非小细胞肺癌非转移和转移组患者中差异变化

Journal of Thoracic Oncology 6.59 厦门第五医院
2 Tumor-released exosomal circular RNA PDE8A promotes invasive growth via the miR-338/MACC1/MET pathway in pancreatic cancer

外泌体中Circ-PDE8A通过miR-338/MACC1/MET途径促进胰腺癌增殖侵袭

Cancer Letters 6.38 重庆西南医院
3 circRNA disease: a manually curated database of experimentally supported circRNA-disease associations

实验支持的circRNA疾病相关数据库

Cell Death Dis 5.97 北京天坛医院
4 Exosomal circRNA_100284 from arsenite-transformed cells, via microRNA-217 regulation of EZH2, is involved in the malignant transformation of human hepatic cells by accelerating the cell cycle and promoting cell proliferation

亚砷酸盐致恶性转化细胞来源的外泌体中circRNA100284通过miR-217/EZH2促进细胞增殖

Cell Death Dis. 5.97 南京医科大学
5 CircRNA-Cdr1as Exerts Anti-Oncogenic Functions in Bladder Cancer by Sponging MicroRNA-135a

CircRNA-Cdr1as通过吸附miRNA-135a抑制膀胱癌功能

Cell Physiol Biochem 5.1 南京医科大学第一附属医院
6 Identifying circRNA-associated-ceRNA networks in the hippocampus of Aβ1-42-induced Alzheimer’s disease-like rats using microarray analysis

芯片技术分析大鼠海马Aβ1-42阿兹海默病中circRNA调控网络

Aging 4.87 中南大学湘雅二院
7 Circular RNA circSVIL promotes myoblast proliferation and differentiation by sponging miR-203 in chicken

circSVIL吸附miR-203促进鸡成肌细胞增殖和分行

Front. Genet 3.79 华南农业大学
8 Analysis of human ES cell differentiation establishes that the dominant isoforms of the lncRNAs RMST and FIRRE are circular

人胚胎干细胞分化过程中,lncRNA RMST和FIRRE产生分子亚型circRNA分析

BMC Genomics. 3.73 纽卡斯尔大学
9 Circular RNA expression profile and potential function of hsa_circ_0045272 in systemic lupus erythematosus

系统性红斑狼疮circRNA表达谱分析及hsa_circ_0045272潜在功能研究

Immunology 3.7 安徽医科大学
10 Noncoding RNA:RNA Regulatory Networks in Cancer.

综述:癌症中非编码RNA调控网络研究进展

Int J Mol Sci 3.23 新加坡国立大学
11 Differential Expression Profiles of Circular RNAs During Osteogenic Differentiation of Mouse Adipose-Derived Stromal Cells

小鼠脂肪来源的基质细胞成骨分化过程中circRNA表达谱分析

Calcif Tissue Int. 3.12 四川大学
12 circFADS2 regulates lung cancer cells proliferation and invasion via acting as a sponge of miR-498

circFADS2 通过吸附miR-398调控肺癌细胞增殖和侵袭

Biosci Rep. 2.9 新乡医学院
13 Changes in circular RNA expression patterns during human foetal brain development

人类胎儿大脑发育期间环状RNA表达模式的变化

Genomics 2.8 莱比锡大学
14 Screening potential biomarkers for colorectal cancer based on circular RNA chips.

基于circRNA芯片筛选结肠直肠癌的潜在生物标志物。

Oncol Rep. 2.67 南开大学附属医院
15 Profiling and Bioinformatic Analyses Indicate Differential circRNA and miRNA/isomiR Expression and Interactions

表达谱及生物信息学分析circRNA和miRNA / isomiR表达和互作关系

Biomed Res Int 2.48 南京邮电大学
16 Circular RNA expression profiles in hippocampus from mice with perinatal glyphosate exposure

草甘膦暴露的围产期小鼠的海马circRNA表达谱分析

BBRC 2.47 杭州医学院
17 Circular RNA hsa_circRNA_103809 promotes lung cancer progression via facilitating ZNF121-dependent MYC expression by sequestering miR-4302

hsa_circRNA_103809通过miR-4302/ZNF121/MYC途径促进肺癌发展

BBRC 2.47 徐州中心医院
18 circRNA expression analysis in lung adenocarcinoma: comparison of paired fresh frozen and formalin-fixed paraffin-embedded specimens

肺腺癌新鲜冷冻和石蜡标本中circRNA表达分析比较

BBRC 2.47 汕头大学医学院
19 Circular RNA circNASP modulates the malignant behaviors in osteosarcoma via miR-1253/FOXF1 pathway

环状RNA circNASP通过miR-1253 / FOXF1通路调控骨肉瘤的恶性行为

BBRC 2.47 温州医科大学
20 Human circular RNA-0054633 regulates high glucose-induced vascular endothelial cell dysfunction through the microRNA-218/roundabout 1 and microRNA-218/heme oxygenase-1 axes

circular RNA-0054633通过miR-218/roundabout 1 及血红色加氧酶1调节高葡萄糖诱导的血管内皮细胞功能障碍

International Journal of Molecular Medicine 2.34 上海第十人民医院
21 Circular RNA hsa_circ_0008344 regulates glioblastoma cell proliferation, migration, invasion, and apoptosis

hsa_circ_0008344调控胶质瘤细胞增殖、迁移侵袭和凋亡

J Clin Lab Anal 1.52 安徽医科大学
22 Identification of Potentially Functional CircRNA-miRNA-mRNA Regulatory Network in Hepatocellular Carcinoma by Integrated Microarray Analysis

基因芯片技术鉴定肝细胞癌中潜在的功能性CircRNA-miRNA-mRNA调控网络

Med Sci Monit Basic Res * 汕头大学医学院
23 Circular RNA hsa-circ-0012129 Promotes Cell Proliferation and Invasion in 30 Cases of Human Glioma and Human Glioma Cell Lines U373, A172, and SHG44, by Targeting MicroRNA-661 (miR-661)

hsa-circ-0012129通过靶向MicroRNA-661促进脑胶质瘤细胞增殖和侵袭

Med Sci Monit. * 安徽蚌埠医学院第三附属医院

 

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