欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目，本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了18篇最新文献，涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐，共同洞悉科研前沿的最新动态！
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR circular RNA[Title/Abstract]
01 环状RNA翻译的分子机制
标题：Molecular mechanisms of circular RNA translation
杂志：Exp Mol Med
影响因子：12.8
通讯作者：Yoon Ki Kim（韩国科学技术院）
DOI: 10.1038/s12276-024-01220-3
环状RNA (circRNAs)是共价封闭的单链RNA，没有典型真核细胞mRNA中的5’帽结构和3′ poly(a)尾。环状RNA主要通过细胞核内的反向剪接过程产生。circRNA长期以来被认为是非编码RNA，似乎没有蛋白质编码潜力。然而，最近的许多研究反驳了这一观点，并提供了大量证据表明，circRNA的一个子集与多聚体相关，且确实可以进行翻译。因此，在这篇综述主要强调了发生在环状RNA上不依赖于5’帽的内部翻译起始。环状RNA的一些对其高效的内部翻译起着关键作用的分子特征，包括内部核糖体进入位点、N6 -甲基腺苷修饰以及在反剪接事件后在反剪接连接处周围形成的外显子连接复合体。该文章还提出了circRNA的可翻译性与其稳定性之间的可能关系，重点关注无义介导的mRNA衰变和nonstop衰变，这两种机制都是有效的mRNA监控机制。对circRNA翻译的深入理解将重塑和扩展我们目前对蛋白质组学的认识。
02 环状RNA合成的优化设计
标题：Optimal design of synthetic circular RNAs
杂志：Exp Mol Med
影响因子：12.8
通讯作者：Jin-Wu Nam（韩国汉阳大学）
DOI: 10.1038/s12276-024-01251-w
环状RNA是一类不寻常的单链RNA，其末端通过反剪接共价连接。由于它们的多功能性，在体内和体外表达环状RNA的需求不断增加。人们一直在努力高效、精确地合成环状RNA。然而，对环状RNA设计、合成和传递过程的优化研究尚缺乏综述。该综述强调了在产生最佳环状RNA时所考虑的多方面，并总结了外源性环状RNA设计和合成的每个步骤的不同方案，包括环状化策略。此外，该文还介绍了环状RNA的几种潜在应用。
03 自噬相关的CircDHX8促进ATG2B与RNF5结合，提高ATG2B的稳定和人胃癌的进展
标题：Human gastric cancer progression and stabilization of ATG2B through RNF5 binding facilitated by autophagy-associated CircDHX8
杂志：Cell Death Dis
影响因子：9.0
通讯作者：吴川清副教授（华中科技大学同济医学院附属协和医院）
DOI: 10.1038/s41419-024-06782-8
circDHX8在自噬和胃癌(GC)进展之间的相互作用中的作用尚不清楚。该研究阐述了hsa_circ_003899 (circDHX8)在GC恶性肿瘤中的作用机制。使用circle-seq和微阵列数据集(GSE83521)测定GC和正常组织中circRNAs的差异表达。使用qPCR和Sanger测序对这些环状RNA进行验证。通过干扰circDHX8在体外和体内的表达实验研究circDHX8的功能。Western blotting、免疫荧光和透射电镜检测circDHX8是否促进GC细胞自噬。为了阐明circdhx8介导的自噬调节机制，该研究进行了生物信息学分析、RNA pull-down、质谱(MS)、RNA免疫沉淀(RIP)和其他western Blot相关实验。Hsa_circ_0003899 (circDHX8)被鉴定为上调，并显示通过促进细胞自噬从而促进GC细胞的恶性进展。从机制上讲，circDHX8通过阻止泛素介导的降解，提高ATG2B蛋白水平，从而促进GC细胞的增殖和侵袭。此外，circDHX8直接与E3泛素蛋白连接酶RNF5相互作用，抑制RNF5介导的ATG2B降解。同时，乙酰化蛋白ATG2B经过SIRT1介导的去乙酰化，增强其与RNF5的结合。该研究建立了circDHX8在GC恶性进展中作用的新机制。
04 CircR-loop:一种新的RNA:DNA相互作用对基因组不稳定性的影响
标题：CircR-loop: a novel RNA:DNA interaction on genome instability
杂志：Cell Mol Biol Lett
影响因子：8.3
通讯作者：段世伟教授（浙大城市学院）
DOI: 10.1186/s11658-024-00606-5
CircR-loop是最近在环状RNA和DNA相互作用的调控机制中发现，是R-loop的一个子集。在动物和植物系统中，CircR-loop在关键调控功能中发挥着至关重要的作用。该研究领域始于circR-loop在人类线粒体基因组中的发现，circR-loop是线粒体DNA复制的关键。在植物界，circR-loop调控可变剪接和着丝粒分配等过程，分别影响着花发育的复杂性和基因组的稳定性。它们在动物领域也同样重要，circR-loop在癌症中与转录控制、染色质结构和对DNA损伤的协调反应有关，因此备受关注。此外，它们参与核输出异常进一步强调了其在细胞调节中的突出作用。该文综述了circR-loop在植物和动物中的重要调控机制和生理作用，并对circR-loop的鉴定、表征和功能分析方法进行了全面的探讨，强调了迫切需要创新的方法将其与线性RNA对应物有效地区分开，同时阐明其准确的功能。最后，文章阐明了circR-loop研究领域面临的挑战和机遇，强调了继续研究以揭示其在生物学领域的调节作用和潜在应用的重要性。综上所述，circR-loop代表了一种有趣的新型调控机制，在遗传学、表观遗传学和疾病生物学领域具有广泛的意义。对circR-loop的研究为理解基因调控开辟了新的途径，并为未来的治疗干预提供了重要的希望。
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