欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计28篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1.环状RNAs:特性、细胞作用和应用

标题:Circular RNAs: Characterization, cellular roles, and applications

杂志:Cell

影响因子:41.582

通讯作者:陈玲玲教授(中科院分子细胞科学卓越创新中心)

大多数环状RNAs是由前体mRNAs外显子的反向剪接产生的。最近的技术进步部分克服了它们的环状构象和序列与线性同源mRNAs重叠的问题,从而更好地理解了它们的细胞作用。根据其定位和与DNA、RNA和蛋白质的特定相互作用,环状RNAs可以调节转录和剪接,调节细胞质mRNAs的稳定性和翻译,干扰信号通路,并在不同的生物学和病理生理学背景下作为翻译模板。RNA环在干扰细胞过程、调节免疫反应和直接翻译成蛋白质方面的新兴应用为生物医学研究带来了新的曙光。在这篇综述中,作者讨论了环状RNAs研究中使用的方法,以及目前对其调节作用和潜在应用的理解

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2.CircVAPA通过调节miR‑377‑3p和miR‑494‑3p/IGF1R/AKT轴促进小细胞肺癌的进展

标题:CircVAPA promotes small cell lung cancer progression by modulating the miR‑377‑3p and miR‑494‑3p/IGF1R/AKT axis

杂志:Molecular Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:林文楚研究员(中国科学院合肥物质科学研究院强磁场实验室)

背景:多种证据表明,环状RNAs(circRNAs)在各种人类癌症中发挥致癌或抑瘤作用。然而,小细胞肺癌(SCLC)中circRNAs的生物学功能仍不清楚。

方法:通过挖掘6对SCLC组织的circRNA图谱数据集和36例SCLC患者和118例健康对照血清样本的RNA序列数据,识别CircVAPA(注释为hsa_circ_0006990)。采用实时定量PCR技术检测circVAPA在SCLC细胞和组织中的表达水平。通过细胞活力、集落形成、细胞周期和凋亡分析以及体内肿瘤发生来揭示circVAPA的生物学作用。通过Western-blot、RNA下拉、RNA免疫沉淀、双荧光素酶报告子分析和解救实验,探讨了circVAPA的潜在机制。

结果:研究发现,来源于囊泡相关膜蛋白相关蛋白A(VAPA)基因外显子2-4的circVAPA在SCLC细胞系、临床组织和SCLC患者血清中的表达水平高于对照组,并在体外和体内促进了SCLC的进展。在机制上,circVAPA通过调节miR-377-3p和miR-494-3p/胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)轴激活磷酸肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路,加速SCLC的进展。此外,circVAPA缺失显著增强了细胞和异种移植小鼠模型中IGF1R激酶抑制剂BMS-536924的抑制作用。

结论:CircVAPA通过miR-377-3p和miR-494-3p/IGF1R/AKT轴促进SCLC的进展。有希望开发circVAPA抑制和BMS-536924联合治疗伴有circVAPA上调的SCLC的临床方案。

circVAPA促进SCLC增殖的机制

 

3.利用全长单细胞RNA测序探索环状RNAs的表达谱

标题:Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing

杂志:Nat Commun

影响因子:14.919

通讯作者:赵方庆研究员(中国科学院北京生命科学研究院)

先前的研究已经证明了环状RNAs(circRNAs)在不同组织和生物体中的高度特异性表达,但circRNA的细胞结构尚未完全确定。在这里,作者收集了171个全长单细胞RNA序列数据集,以探索人类和小鼠组织中CircRNA的细胞内表达谱。通过大规模整合分析,作者在这些scRNA序列文库中共鉴定出139643个人类和214747个小鼠circRNAs。作者团队通过整合11个基于大量RNA序列的资源来验证检测到的circRNAs,其中216602个高置信度circRNAs是在单细胞队列中唯一检测到的。揭示了脑样本、发育中胚胎和乳腺肿瘤中circRNAs的细胞类型特异性表达模式。鉴定了不同细胞类型中唯一表达的circRNAs,并验证了它们在肿瘤过滤免疫细胞成分反褶积中的性能。这项研究将对circRNA表达的认识扩展到单细胞水平,并为以前所未有的分辨率探索circRNAs提供了有用的资源。

circRNAs单细胞表达图谱及数据平台—circSC

 

文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 环状RNAs:特性、细胞作用和应用 Circular RNAs: Characterization, cellular roles, and applications Cell 41.582 中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室
2 CircVAPA通过调节miR-377-3p和miR-494-3p/IGF1R/AKT轴促进小细胞肺癌进展 CircVAPA promotes small cell lung cancer progression by modulating the miR-377-3p and miR-494-3p/IGF1R/AKT axis Mol Cancer 27.401 中国科学院合肥物质科学研究院
3 环状RNAs在肺动脉高压中的作用 The role of circular RNAs in pulmonary hypertension Eur Respir J 16.671 悉尼科技大学,斯坦福大学
4 利用全长单细胞RNAs测序探索环状RNA的细胞景观 Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing Nat Commun 14.919 中国科学院大学
5 EIF4A3诱导的circFIP1L1抑制miR-1253并促进鼻咽癌的放射敏感性 EIF4A3-induced circFIP1L1 represses miR-1253 and promotes radiosensitivity of nasopharyngeal carcinoma Cell Mol Life Sci 9.261 华南大学第一附属医院,南华大学附属南华医院肿瘤科
6 宫颈涂片靶向RNA下一代测序分析可以预测hrhpv诱导的宫颈病变的存在 Targeted RNA next generation sequencing analysis of cervical smears can predict the presence of hrHPV-induced cervical lesions BMC Med 8.775 St Radbound大学Nijmegen医疗中心
7 外泌体环状RNAs在肿瘤免疫和癌症进展中的作用 Roles of exosomal circRNAs in tumour immunity and cancer progression Cell Death Dis 8.469 郑州大学第一附属医院结直肠外科
8 环状RNAs在食管鳞状细胞癌中的功能作用和临床意义的最新进展和未来展望:比预期的更有影响 Current advances and future perspectives on the functional roles and clinical implications of circular RNAs in esophageal squamous cell carcinoma: more influential than expected Biomark Res 6.148 郑州大学第一附属医院,郑州大学附属肿瘤医院
9 慢性阻塞性肺疾病RNA转录本的综合鉴定及RNA网络的构建 Comprehensive identification of RNA transcripts and construction of RNA network in chronic obstructive pulmonary disease Respir Res 5.631 中国科学技术大学,安徽医科大学附属第二医院
10 CircRNA分析揭示CircPPARγ通过海绵介导miR-92a-3p调节成脂分化 CircRNA Profiling Reveals CircPPARγ Modulates Adipogenic Differentiation via Sponging miR-92a-3p J Agric Food Chem 5.279 西南民族大学,西北农林科技大学
11 CircRFWD3通过调控miR-27a/b/PPARγ信号促进HNSCC转移 CircRFWD3 promotes HNSCC metastasis by modulating miR-27a/b/PPARγ signaling Cell Death Discov 5.241 四川大学华西口腔医院
12 NMOSD患者外周血单个核细胞非编码RNA谱的改变和潜在的疾病标志物鉴定 Altered non-coding RNA profiles and potential disease marker identification in peripheral blood mononuclear cells of patients with NMOSD Int Immunopharmacol 4.932 河北医科大学第二医院神经内科
13 骨质疏松症竞争性内源性RNA调控网络的综合分析 The integrative analysis of competitive endogenous RNA regulatory networks in osteoporosis Sci Rep 4.379 大连医科大学
14 非编码RNAs和NRF2在不同癌症中的相互作用:聚焦miRNAs和长链非编码RNAs Interplay between Non-coding RNAs and NRF2 in Different Cancers: Spotlight on miRNAs and Long non-coding RNAs J Pharmacol Exp Ther 4.03 罗马大学
15 CircVIS: circRNA可视化展示平台 CircVIS: a platform for circRNA visual presentation BMC Genomics 3.969 台湾省国立中兴大学
16 Circ-HUWE1敲低通过miR-433-3p释放介导的FGF7下调缓解淀粉样蛋白-β-诱导的SK-N-SH细胞神经元损伤 Circ-HUWE1 Knockdown Alleviates Amyloid-β-Induced Neuronal Injury in SK-N-SH Cells via miR-433-3p Release-Mediated FGF7 Downregulation Neurotox Res 3.911 丰都县人民医院神经内科
17 Circ_UTRN通过miR-320-3p/PTK2轴减少炎症反应和促进凋亡,在体外改善青绿蛋白诱导的急性胰腺炎 Circ_UTRN ameliorates caerulein-induced acute pancreatitis in vitro via reducing inflammation and promoting apoptosis through miR-320-3p/PTK2 axis J Pharm Pharmacol 3.765 淄博市中心医院西院消化内科,济南市第三医院
18 CircPCNX通过调控miR-1278/DNMT1轴促进PDGF-BB诱导的人主动脉血管平滑肌细胞增殖和迁移 CircPCNX Promotes PDGF-BB-Induced Proliferation and Migration of Human Aortic Vascular Smooth Muscle Cells Through Regulating miR-1278/DNMT1 Axis Cardiovasc Drugs Ther 3.727 齐齐哈尔市第一医院
19 exRNAdisease:人类疾病中的细胞外RNA转录组图谱 exRNAdisease: An extracellular RNA transcriptome atlas in human diseases Gene 3.688 同济大学医学院上海杨智康复医院
20 环状RNA circ_0021001通过调控miR-148b-3p/GREM1轴调控血管平滑肌细胞增殖和凋亡 Circular RNA circ_0021001 regulates miR-148b-3p/GREM1 axis to modulate proliferation and apoptosis of vascular smooth muscle cells Metab Brain Dis 3.584 恩施州中心医院
21 circRNA_0075932 shRNA对肥胖大鼠烫伤相关感染有治疗作用 Administration of circRNA_0075932 shRNA exhibits a therapeutic effect on burn-associated infection in obese rats Biochem Biophys Res Commun 3.575 黄冈市疾病预防控制中心
22 circ-Ncam2 (mmu_circ_0006413)通过TLR4/NF-κB通路参与lps诱导的小胶质细胞活化和神经元凋亡 circ-Ncam2 (mmu_circ_0006413) Participates in LPS-Induced Microglia Activation and Neuronal Apoptosis via the TLR4/NF-κB Pathway J Mol Neurosci 3.444 山东中医药大学实验中心
23 CircPrimer 2.0:一款用于环状RNAs注释和预测环状RNAs翻译潜能的软件 CircPrimer 2.0: a software for annotating circRNAs and predicting translation potential of circRNAs BMC Bioinformatics 3.169 南京医科大学附属肿瘤医院
24 在糖尿病肾病细胞模型中,Circ_0000064敲低通过miR-424-5p介导的WNT2B抑制,减轻高糖诱导的系膜细胞增殖、炎症和细胞外基质沉积 Circ_0000064 knockdown attenuates high glucose-induced proliferation, inflammation and extracellular matrix deposition of mesangial cells through miR-424-5p-mediated WNT2B inhibition in cell models of diabetic nephropathy Clin Exp Nephrol 2.801 柳州市人民医院老年科
25 牛脂肪沉积与肌肉发育的环状RNA调控 Circular RNA regulation of fat deposition and muscle development in cattle Vet Med Sci 1.950 宁夏大学农学院
26 CircCERS6通过介导miR-630/RASSF8抑制上皮性卵巢癌的发展 CircCERS6 Suppresses the Development of Epithelial Ovarian Cancer Through Mediating miR-630/RASSF8 Biochem Genet 1.89 天山区人民医院检验科
27 在多囊卵巢综合征中,Circ_0005925通过靶向MiR-324-3p上调MAP2K6促进颗粒细胞生长 Circ_0005925 Promotes Granulosa Cell Growth by Targeting MiR-324-3p to Upregulate MAP2K6 in Polycystic Ovary Syndrome Biochem Genet 1.890 荆门市第一人民医院生殖医学科
28 结合K最近邻和非负矩阵分解预测环状RNA-疾病关联 Combining K Nearest Neighbor With Nonnegative Matrix Factorization for Predicting Circrna-Disease Associations IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform Not Found 中国科学院,西北工业大学,宜春学院

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