欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计19篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.环状RNA研究的最佳实践标准
标题:Best practice standards for circular RNA research
杂志:Nat Methods
影响因子:28.547
通讯作者: Jørgen Kjems(奥胡斯大学分子生物学与遗传学系)
环状RNAs (circRNAs)在生命的所有领域中通过不同的机制形成。近年来,circRNA的论文数量出现了爆炸式增长;然而,作为一个相对年轻的领域,环状RNAs生物学迫切需要分离、分析、表达和降解环状RNAs的通用实验标准。在此,根据作者的经验提出了一套环状RNAs研究指南。本展望将专门研究真核生物中由剪接体催化的反向剪接事件产生的主要环状RNAs,环状RNAs研究的最佳实践原则的实施将有助于推动该领域的发展,并让人们更好地理解这一迷人的环状RNAs的功能。
环状RNAs的过表达策略
2.PIK3CA突变介导的circLHFPL2下调通过上调PTEN抑制结直肠癌进展
标题:PIK3CA mutations-mediated downregulation of circLHFPL2 inhibits colorectal cancer progression via upregulating PTEN
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:高勇教授(同济大学医学院),Yangyang Zhan(海军军医大学),Zhe-Sheng Chen(圣约翰大学药学院药学系)和权明(主治医师)
背景:PIK3CA突变和PTEN抑制导致结直肠癌(CRC)的发生和耐药。环状RNAs (circular RNAs, circRNAs)在CRC中调控PIK3CA突变和MEK抑制剂耐药中的作用,目前尚无研究。
方法:采用RNAs测序和qRT-PCR技术检测PIK3CA突变型和野生型细胞和组织中circLHFPL2的表达。采用CCK-8法和菌落形成法评价细胞活力。Annexin V/PI染色观察细胞凋亡情况。采用荧光素酶检测、生物素偶联miRNAs捕获和RIP检测来验证潜在靶标之间的相互作用。通过Western blotting和qRT-PCR检测评估相关靶点的表达。裸鼠移植瘤模型用于探索环状RNAs在体内的作用。
结果:RNA测序发现,在PIK3CAH1047R (HCT116)和PIK3CAE545K (DLD1)细胞中circLHFPL2均表达下调。在PIK3CA突变的CRC原代细胞和组织中,CircLHFPL2也表达下调,与预后不良相关。CircLHFPL2主要定位于细胞质,其下调与磷酸化Foxo3a激活PI3K/AKT信号通路有关。在体外和体内,CircLHFPL2抑制PI3KCA-Mut CRC的进展。此外,研究表明,circLHFPL2作为一种ceRNA,在CRC细胞中海绵化miR-556-5p和miR-1322,进而调节PTEN的表达。重要的是,circLHFPL2能够克服CRC细胞中pik3ca介导的MEK抑制剂耐药性。
结论:在PIK3CA突变的CRC中,circLHFPL2的下调通过正反馈环维持PI3K/AKT信号通路的激活。此外,circLHFPL2下调导致CRC中MEK抑制剂耐药。因此,靶向circLHFPL2可能是治疗携带癌源性PIK3CA突变的CRC患者的有效方法。
PIK3CA突变介导的circLHFPL2下调参与结直肠癌的作用机制
3. circSPON2/miR-331-3p轴调控CAMK2N1转录和前列腺癌进展的表观遗传学调控因子PRMT5
标题:The circSPON2/miR-331-3p axis regulates PRMT5, an epigenetic regulator of CAMK2N1 transcription and prostate cancer progression
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:冯宁翰教授(无锡二院),秦超副主任医师(南京医科大学第一附属医院泌尿外科)和赵善超主任医师(南方医科大学南方医院)
背景:前列腺癌(PCa)是男性最常见的恶性肿瘤,其发病机制仍不清楚。因此,迫切需要发现潜在的新型诊断生物标志物和治疗靶点,从而可能促进高效抗癌策略的发展。
方法:通过一系列体外和体内功能实验评价PCa细胞的生物学行为。RNA pulldown, Western blot,荧光素酶报告,免疫组织化学和染色质免疫沉淀分析被应用于详细的潜在机制。通过高通量测序筛选PCa和邻近正常组织中差异表达的环状RNAs。
结果:蛋白精氨酸甲基转移酶5 (PRMT5)的上调与PCa中较差的无进展生存和多个信号通路的激活有关。PRMT5通过在CAMK2N1近端启动子区沉积抑制组蛋白标记H4R3me2s和H3R8me2s来抑制CAMK2N1的转录,从而导致体外和体内PCa的恶性进展。此外,通过RNA-seq鉴定出的PCa组织中的候选circRNA circSPON2的表达与PCa患者的不良临床结果相关。进一步的结果表明,circSPON2诱导PCa细胞增殖和迁移,miR-331-3p抵消了circSPON2诱导的作用。特别是circSPON2作为miR-331-3p的竞争性内源性RNA (ceRNA),以减弱miR-331-3p对其下游靶点PRMT5的抑制作用。
结论:研究结果表明,表观遗传调控因子PRMT5通过抑制CAMK2N1的转录而加重PCa的进展,并受circSPON2/miR-331-3p轴的调控,这可能成为侵袭性PCa患者的潜在治疗靶点。
PRMT5通过抑制CAMK2N1的转录而加重PCa进展的机制
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 环状RNA研究的最佳实践标准 | Best practice standards for circular RNA research | Nat Methods | 28.547 | 奥胡斯大学分子生物学与遗传学系 |
2 | PIK3CA突变介导的circLHFPL2下调通过上调PTEN抑制结直肠癌进展 | PIK3CA mutations-mediated downregulation of circLHFPL2 inhibits colorectal cancer progression via upregulating PTEN | Mol Cancer | 27.401 | 同济大学医学院上海东方医院,圣约翰大学,海军军医大学 |
3 | circSPON2/miR-331-3p轴调控CAMK2N1转录和前列腺癌进展的表观遗传学调控因子PRMT5 | The circSPON2/miR-331-3p axis regulates PRMT5, an epigenetic regulator of CAMK2N1 transcription and prostate cancer progression | Mol Cancer | 27.401 | 南通大学,南京医科大学,南方医科大学 |
4 | 环状RNAs的生物发生和调控作用 | Biogenesis and Regulatory Roles of Circular RNAs | Annu Rev Cell Dev Biol | 13.827 | 中国科学院分子细胞科学卓越研究中心 |
5 | “环状RNA MYLK作为一种竞争性内源性RNA,通过调节VEGFA/VEGFR2信号通路促进膀胱癌进展”的勘误[cancer Letter 403(2017) 305-317] | Corrigendum to “Circular RNA MYLK as a competing endogenous RNA promotes bladder cancer progression through modulating VEGFA/VEGFR2 signaling pathway” [Cancer Letter 403(2017) 305-317] | Cancer Lett | 8.679 | 重庆医科大学细胞生物学与遗传学系 |
6 | 环状RNAs代表了一类新的人类巨细胞病毒转录本 | Circular RNAs Represent a Novel Class of Human Cytomegalovirus Transcripts | Microbiol Spectr | 7.171 | 罗格斯大学新泽西医学院微生物学与分子遗传学教研室 |
7 | 外泌体相关环状RNAs是癌症EMT的关键调控因子 | Exosome-Associated circRNAs as Key Regulators of EMT in Cancer | Cells | 6.6 | 罗马Sapienza大学分子医学系 |
8 | CircRNA:胶质瘤进展中的一颗新星 | CircRNA: An emerging star in the progression of glioma | Biomed Pharmacother | 6.529 | 郑州大学第一附属医院神经外科,天津医科大学总医院 |
9 | CircRNA分析揭示CircPPARγ通过海绵介导miR-92a-3p调节成脂分化 | CircRNA Profiling Reveals CircPPARγ Modulates Adipogenic Differentiation via Sponging miR-92a-3p | J Agric Food Chem | 5.279 | 西北农林科技大学动物科技学院 |
10 | 可翻译环状RNAs的功能和机制 | The functions and mechanisms of translatable circRNAs | J Pharmacol Exp Ther | 4.03 | 上海大学生命科学学院,美国麻省总医院和哈佛医学院心血管科 |
11 | CircPVT1通过MAPK信号通路调控miR-143-3p/SLC7A11轴,促进口腔鳞状细胞癌的进展 | CircPVT1 facilitates the progression of oral squamous cell carcinoma by regulating miR-143-3p/SLC7A11 axis through MAPK signaling pathway | Funct Integr Genomics | 3.41 | 郑州大学第一附属医院 |
12 | CircRNA-miRNA在动脉粥样硬化形成中的相互作用 | CircRNA-miRNA interactions in atherogenesis | Mol Cell Biochem | 3.396 | 马来亚大学医学院药学系 |
13 | Hsa_circ_0006732通过miR-127-5p/RAB3D轴调控结直肠癌细胞增殖、侵袭和EMT | Hsa_circ_0006732 regulates colorectal cancer cell proliferation, invasion and EMT by miR-127-5p/RAB3D axis | Mol Cell Biochem | 3.396 | 暨南大学第一附属医院,锦州医科大学附属第一医院骨科 |
14 | 磷酸二酯酶4D的环状RNA通过circPDE4D/miR-4306/SOX9级联介导IL-1β诱导OA环境下软骨细胞凋亡和基质降解 | Circular RNA from phosphodiesterase 4D can attenuate chondrocyte apoptosis and matrix degradation under OA milieu induced by IL-1β via circPDE4D/miR-4306/SOX9 Cascade | Immunopharmacol Immunotoxicol | 2.73 | 武汉市中西医结合医院康复医学科 |
15 | 衣原体感染HeLa细胞中CircRNA、LncRNA和mRNA表达谱筛选及生物信息学分析 | Expression profile screening and bioinformatics analysis of CircRNA, LncRNA, and mRNA in HeLa cells infected with Chlamydia muridarum | Arch Microbiol | 2.552 | 天津医科大学 |
16 | CircRNF220通过海绵化miR-330-5p诱导SOX4上调,在体外发挥致病作用,促进AML细胞进展 | CircRNF220 plays a pathogenic role to facilitate cell progression of AML in vitro via sponging miR-330-5p to induce upregulation of SOX4 | Histol Histopathol | 2.303 | 汕头大学医学院附属第二医院血液科 |
17 | 血浆环状RNAs面板预测妊娠期糖尿病女性巨大儿的风险 | Plasmatic circRNAs Panel to Predict the Risk of Macrosomia in Women with Gestational Diabetes Mellitus | Gynecol Obstet Invest | 2.031 | 青海省红十字会医院妇产科 |
18 | 【植物环状RNAs研究进展】 | [Progress in circular RNAs of plants] | Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao | Not Found | 西南大学柑橘研究所 |
19 | 糖尿病心肌病小鼠心肌中环状rna差异表达的研究 | [Investigation on the differentially expressed circular RNAs in myocardium of mice with diabetic cardiomyopathy] | Zhonghua Xin Xue Guan Bing Za Zhi | Not Found | 苏州大学附属第二医院心内科 |