欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.RNMFLP:基于鲁棒非负矩阵分解和标签传播预测环状RNA与疾病的关联
标题：RNMFLP: Predicting circRNA-disease associations based on robust nonnegative matrix factorization and label propagation
杂志：Brief Bioinform
影响因子：11.622
通讯作者：陈向（湖南科技大学计算机科学与工程学院）和刘炜副教授（湘潭大学信息工程学院）
环状RNAs (Circular RNAs, circRNAs)是一类结构稳定的内源性非编码RNA分子。越来越多的研究表明，环状RNAs在人类疾病中发挥着重要作用。然而，在体内验证疾病相关的环状RNAs是昂贵和耗时的。值得进一步研究一种可靠有效的计算方法来识别环状RNAs与疾病的关联。在这项研究中，作者提出了一种名为RNMFLP的计算方法，该方法结合了鲁棒非负矩阵分解(RNMF)和标签传播算法(LP)来预测环状RNAs与疾病的关联。首先，为了减少假阴性数据的影响，利用综合的环状RNAs相似性和疾病相似性信息，通过矩阵乘法更新原始的环状RNAs -疾病邻接矩阵。随后，使用RNMF算法获取受限的潜在空间，从关联矩阵中捕获潜在的环状RNAs -疾病对。最后，利用LP算法分别从综合环状RNAs相似度网络和综合疾病相似度网络中预测更准确的环状RNAs -疾病关联。4个数据集的5次交叉验证表明，RNMFLP方法优于目前最先进的方法。此外，肺癌、肝细胞癌和结直肠癌的病例研究进一步证明了该方法发现疾病相关环状RNAs的可靠性。
2.FMRP配体circZNF609使RAC1 mRNA失稳，从而减少肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤的转移
标题：FMRP ligand circZNF609 destabilizes RAC1 mRNA to reduce metastasis in acral melanoma and cutaneous melanoma
杂志：J Exp Clin Cancer Res
影响因子：11.161
通讯作者：郭军主任医师和孔燕副教授（北京大学肿瘤医院肿瘤研究所）
背景:黑色素瘤是一种侵袭性高、预后差的恶性肿瘤。目前，黑色素瘤的转移仍然是黑色素瘤患者死亡的重要原因。然而，大多数环状RNAs(circRNAs)在黑色素瘤转移中的潜在功能和分子机制尚不清楚。
方法:根据基于重复Transwell试验的筛选模型，使用circRNA阵列识别具有不同转移能力的黑色素瘤细胞亚群中的circRNA失调。采用qRT-PCR、核质分离法和荧光原位杂交法检测circZNF609在皮肤皮肤黑素瘤和肢端黑素瘤细胞和组织中的表达及预后意义。体外创伤愈合、Transwell和3D侵袭实验用于分析黑色素瘤细胞转移能力。采用尾静脉注射和脾内注射分别对肺转移和肝转移进行体内研究。通过RNA免疫沉淀、RNA下拉、银染色和免疫荧光共定位等方法进一步评估circZNF609的作用机制。
结果:circZNF609在黑色素瘤组织和细胞中稳定低水平表达，与黑色素瘤患者的皮肤黑色素瘤的肿瘤厚度、临床分期和预后呈负相关。circZNF609在体内外抑制肢端和皮肤黑色素瘤的转移。机制上circZNF609促进了FMRP蛋白与RAC1 mRNA的结合，从而增强了FMRP蛋白对RAC1 mRNA稳定性的抑制作用，最终抑制黑色素瘤转移。
结论:研究结果显示,circZNF609起着至关重要的作用在肢端的和皮肤黑色素瘤的转移通过circRNF609-FMRP-RAC1轴和表明circZNF609调节RAC1 mRNA结合FMRP的稳定,这可能提供洞察黑色素瘤发病机制和治疗黑色素瘤的新的潜在目标。
circZNF609在黑色素瘤转移中的作用及机制
3. 一个由ZCRB1诱导的circHEATR5B编码的新蛋白通过磷酸化JMJD5抑制GBM的有氧糖酵解
标题：A novel protein encoded by ZCRB1-induced circHEATR5B suppresses aerobic glycolysis of GBM through phosphorylation of JMJD5
杂志：J Exp Clin Cancer Res
影响因子：11.161
通讯作者：刘云会主任医师（中国医科大学附属盛京医院神经外科）
背景:RNA结合蛋白(RBPs)和环状RNA(circRNAs)在多形胶质母细胞瘤(GBM)中发挥重要作用。有氧糖酵解是GBM的一个代谢特征。然而，RBP和环状RNAs在GBM有氧糖酵解中的作用尚不清楚。本研究的目的是探索RBP和环状RNAs调节GBM细胞有氧糖酵解的机制。
方法:通过RNA测序和环状RNA芯片分析，鉴定RBP和环状RNAs，为进一步研究奠定基础。质谱分析验证了编码蛋白及其相互作用蛋白的有效性。定量反转录PCR和western blot分别测定其mRNA和蛋白表达。免疫荧光法和荧光原位杂交法分别测定蛋白和RNA的定位。通过葡萄糖和乳酸测定、XF糖酵解压力测试和细胞活力测定，研究了糖酵解对GBM细胞增殖的影响。
结果:ZCRB1和circHEATR5B在GBM组织和细胞中低水平表达。ZCRB1和circHEATR5B过表达均可抑制GBM细胞的有氧糖酵解和增殖。ZCRB1过表达促进Alu元素介导的circHEATR5B的形成。此外，circHEATR5B编码了一个新的蛋白HEATR5B-881aa，该蛋白直接与JMJD5相互作用，并通过磷酸化S361降低其稳定性。JMJD5基因的敲除增加了丙酮酸激酶M2 (PKM2)酶活性，抑制了GBM细胞的糖酵解和增殖。最后，过表达ZCRB1、circHEATR5B和HEATR5 -881aa可抑制GBM异种移植瘤的生长，延长裸鼠的生存时间。
结论:本研究揭示了一种通过ZCRB1/circHEATR5B/HEATR5B -881aa/JMJD5/PKM2通路调控GBM细胞有氧糖酵解和增殖的新机制，为GBM治疗提供了新的策略和潜在靶点。
ZCRB1/circHEATR5B/HEATR5B -881aa/JMJD5/PKM2调控GBM糖酵解和增殖机制
文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | RNMFLP:基于鲁棒非负矩阵分解和标签传播预测环状RNA与疾病的关联 | RNMFLP: Predicting circRNA-disease associations based on robust nonnegative matrix factorization and label propagation | Brief Bioinform | 11.622 | 湖南科技大学，湘潭大学 |
| 2 | FMRP配体circZNF609使RAC1 mRNA失稳，从而减少肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤的转移 | FMRP ligand circZNF609 destabilizes RAC1 mRNA to reduce metastasis in acral melanoma and cutaneous melanoma | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 北京大学肿瘤医院 |
| 3 | 一个由zcrb1诱导的circHEATR5B编码的新蛋白通过磷酸化JMJD5抑制GBM的有氧糖酵解 | A novel protein encoded by ZCRB1-induced circHEATR5B suppresses aerobic glycolysis of GBM through phosphorylation of JMJD5 | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 中国医科大学附属盛京医院神经外科 |
| 4 | CircZNF609通过miR-1200/CDC25B通路促进膀胱癌进展并抑制顺铂敏感性 | CircZNF609 promotes bladder cancer progression and inhibits cisplatin sensitivity via miR-1200/CDC25B pathway | Cell Biol Toxicol | 6.691 | 南京医科大学第一附属医院泌尿外科 |
| 5 | 非编码RNAs在人胎盘中的作用 | The Role of Non-Coding RNAs in the Human Placenta | Cells | 6.6 | 耶拿大学 |
| 6 | CircUSP36通过miR-139-3p/SMAD3/Bcl2信号轴减轻缺血性卒中损伤 | CircUSP36 attenuates ischemic stroke injury through the miR-139-3p/SMAD3/Bcl2 signal axis | Clin Sci (Lond) | 6.124 | 广西医科大学 |
| 7 | Hsa_circ_0000497和hsa_circ_0000918通过腹水参与了卵巢癌腹膜转移 | Hsa_circ_0000497 and hsa_circ_0000918 contributed to peritoneal metastasis of ovarian cancer via ascites | J Transl Med | 5.531 | 同济大学 |
| 8 | CircEIF3H-IGF2BP2-HuR支架复合物通过稳定HSPD1/RBM8A/G3BP1 mRNA来促进TNBC的进展 | CircEIF3H-IGF2BP2-HuR scaffold complex promotes TNBC progression via stabilizing HSPD1/RBM8A/G3BP1 mRNA | Cell Death Discov | 5.241 | 山东大学 |
| 9 | 环状RNA circ_0006089通过靶向miR-143-3p调控IGF1R的表达，促进胃癌增殖、迁移和侵袭 | Circular RNA circ_0006089 regulates the IGF1R expression by targeting miR-143-3p to promote gastric cancer proliferation, migration and invasion | Cell Cycle | 4.534 | 中国人民解放军总医院 |
| 10 | 人胰岛ANRIL环状RNA亚型的高通量分析 | High-throughput analysis of ANRIL circRNA isoforms in human pancreatic islets | Sci Rep | 4.379 | 威尔康奈尔医学院，马萨诸塞大学 |
| 11 | 等离子体环状RNA芯片识别用于卵巢癌诊断的新型环状RNA生物标志物 | Plasma circRNA microarray profiling identifies novel circRNA biomarkers for the diagnosis of ovarian cancer | J Ovarian Res | 4.234 | 南京医科大学附属妇产医院 |
| 12 | 弱光条件改变水稻籽粒灌浆过程中环状RNAs的全基因组谱 | Low Light Conditions Alter Genome-Wide Profiles of Circular RNAs in Rice Grains during Grain Filling | Plants (Basel) | 3.935 | 四川农业大学,西南科技大学 |
| 13 | Circ_0000518通过FUS/CaMKKβ/AMPK通路促进巨噬细胞/小胶质细胞M1极化，加重多发性硬化 | Circ_0000518 Promotes Macrophage/Microglia M1 Polarization via the FUS/CaMKKβ/AMPK Pathway to Aggravate Multiple Sclerosis | Neuroscience | 3.59 | 陕西省人民医院神经内科 |
| 14 | Circ_0001665通过靶向miR-302a-3p/Adam9/EGFR信号通路参与前庭神经鞘瘤的发生 | Circ_0001665 Contributes to the Occurrence of Vestibular Schwannoma via Targeting miR-302a-3p/Adam9/EGFR Signaling Pathway | Neuroscience | 3.59 | 福建医科大学附属福建省医院 |
| 15 | Circ_0001273下调通过靶向miR-622/SLC1A5信号轴抑制食管癌细胞的生长、迁移和谷氨酰胺代谢 | Circ_0001273 downregulation inhibits the growth, migration and glutamine metabolism of esophageal cancer cells via targeting the miR-622/SLC1A5 signaling axis | Thorac Cancer | 3.5 | 广东省高州市人民医院胸外科 |
| 16 | 全转录组测序鉴定了精神分裂症患者的环状RNA谱和相关网络 | Whole Transcriptome Sequencing Identified CircRNA Profiles and the Related Networks in Schizophrenia | J Mol Neurosci | 3.444 | 广西医科大学公共卫生学院 |
| 17 | 环状RNAs在肾细胞癌中的功能、致癌作用及临床意义 | The functions, oncogenic roles, and clinical significance of circular RNAs in renal cell carcinoma | Med Oncol | 3.064 | 徐州医科大学，开州区人民医院 |
| 18 | 外泌体环状RNA和ceRNA网络分布在不同的ANA血清中 | Exosome circRNAs and ceRNA network profiles in different ANA sera | Immunol Res | 2.829 | 公利医院，复旦大学上海医学院 |
| 19 | 种新型环状RNA circRACGAP1通过mir -22-3p介导的AKT信号通路阻碍系统性红斑狼疮的进展 | A novel circRNA, circRACGAP1, hampers the progression of systemic lupus erythematosus via miR-22-3p-mediated AKT signalling | Autoimmunity | 2.815 | 南昌大学 |
| 20 | 来自磷酸二酯酶4D的环状RNA可以通过circPDE4D/miR-4306/SOX9级联减少IL-1β诱导的OA环境下软骨细胞的凋亡和基质降解 | Circular RNA from phosphodiesterase 4D can attenuate chondrocyte apoptosis and matrix degradation under OA milieu induced by IL-1β via circPDE4D/miR-4306/SOX9 cascade | Immunopharmacol Immunotoxicol | 2.73 | 武汉市第一医院康复医学科 |
| 21 | 通过16S rRNA基因将唾液微生物组整合到法医工具箱中:在体液鉴定和生物地理推断中的潜在应用 | Integrating the salivary microbiome in the forensic toolkit by 16S rRNA gene: potential application in body fluid identification and biogeographic inference | Int J Legal Med | 2.686 | 南方医科大学法医学学院，广州市法医学研究所 |
| 22 | Hsa_circ_0000285通过抑制miR-1278上调FN1促进胃癌进展 | Hsa_circ_0000285 contributes to gastric cancer progression by upregulating FN1 through the inhibition of miR-1278 | J Clin Lab Anal | 2.352 | 成都市第五人民医院普外科 |
| 23 | Hsa_circ_0003748通过海绵吸收miR-577促进风湿性心瓣膜病的疾病进展 | Hsa_circ_0003748 promotes disease progression in rheumatic valvular heart disease by sponging miR-577 | J Clin Lab Anal | 2.352 | 宁波市第一医院心血管外科 |
| 24 | Circ_FOXP1通过调控miR-508-3p/SMAD家族成员2通路促进高糖处理的人滋养细胞的生长和生存 | Circ_FOXP1 promotes the growth and survival of high glucose-treated human trophoblast cells through the regulation of miR-508-3p/SMAD family member 2 pathway | Endocr J | 2.349 | 湖北医科大学附属襄阳第一医院 |
| 25 | 外泌体环状RNAs在乳腺癌中的应用前景:现在和未来 | Prospect of exosomal circular RNAs in breast Cancer: presents and future | Mol Biol Rep | 2.316 | 德黑兰医科大学 |
| 26 | 循环RNAs作为三阴性乳腺癌的新生物标志物:系统综述 | Circular RNAs as novel biomarkers in triple-negative breast cancer: a systematic review | Mol Biol Rep | 2.316 | 伊朗医科大学 |
| 27 | 与自噬相关的非编码RNAs及其在癌症治疗中的调节作用 | Non-coding RNAs associated with autophagy and their regulatory role in cancer therapeutics | Mol Biol Rep | 2.316 | 韦洛尔理工学院生物科学与技术学院 |
| 28 | CircKCNQ5通过调节miR-335-5p/BRD4轴控制多发性骨髓瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、凋亡和糖酵解 | CircKCNQ5 controls proliferation, migration, invasion, apoptosis, and glycolysis of multiple myeloma cells by modulating miR-335-5p/BRD4 axis | Histol Histopathol | 2.303 | 天津市第四中心医院，南开大学附属第四中心医院 |
| 29 | 下调circRNA circEBF1通过调控miR-1247-5p/CSF3轴抑制皮肤鳞状细胞癌的进展 | Knockdown of circRNA circEBF1 inhibits cutaneous squamous cell carcinoma progression by regulating the miR-1247-5p/CSF3 axis | Histol Histopathol | 2.303 | 山西省人民医院皮肤科 |
| 30 | Circ-TLR4通过招募FUS稳定TLR4 mRNA来促进心肌肥厚 | Circ-TLR4 promotes cardiac hypertrophy through recruiting FUS to stabilize TLR4 mRNA | J Interv Card Electrophysiol | 1.9 | 安徽医科大学 |
| 31 | 【环状RNAs与白内障关系的研究进展】 | [Research progress on the relationship between circular RNAs and cataract] | Zhonghua Yan Ke Za Zhi | Not Found | 复旦大学 |