欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计35篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.CircOGDH是急性缺血性中风的半暗带生物标志物和治疗靶点
标题:CircOGDH Is a Penumbra Biomarker and Therapeutic Target in Acute Ischemic Stroke
杂志:Circ Res
影响因子:17.367
通讯作者: Dan Lu,徐安定主任医师和Chi Kwan Tsang(暨南大学第一附属医院神经内科与脑卒中中心)
背景:
急性缺血性中风(AIS)是世界范围内致残和死亡的主要原因。预测AIS后半暗区是否存在是决定再灌注治疗的关键。然而,一种快速、廉价、简单、无创的具有临床转译潜力的中风后半暗区预测生物标志物仍然缺乏。本课题的目的是研究CircOGDH(源自氧戊二酸脱氢酶的环状RNA)是否是AIS患者半暗带的潜在生物标志物,以及其在缺血性神经元损伤中的作用。
方法:
从大脑中动脉闭塞小鼠的半暗区中筛选CircOGDH,采用定量聚合酶链反应(quantitative polymerase chain reaction)检测AIS患者血浆中的CircOGDH。磁共振成像用于检查半影体积。通过荧光原位杂交、RNA免疫沉淀和荧光素酶报告试验检测初级皮层神经元中CircOGDH与miR-5112 (microRNA-5112)相互作用。腺病毒介导的CircOGDH敲除可改善COL4A4(鸡胶原,IV型,α IV)过表达诱导的神经元凋亡。透射电镜、纳米颗粒跟踪分析和Western blot检测外泌体。
结果:
CircOGDH表达在大脑中动脉闭塞小鼠的半影组织和45例AIS患者的血浆中显著和选择性地上调,AIS患者的血浆比非脑血管疾病对照组增强54倍。部分回归分析显示,AIS患者CircOGDH表达与半暗区大小呈正相关。通过CircOGDH隔离miR-5112可增强COL4A4的表达,从而提高神经元损伤。此外,在缺血条件下,CircOGDH的下调显著提高了神经元细胞的生存能力。此外,CircOGDH在脑组织中的表达与大脑中动脉闭塞小鼠血清中的表达密切相关。最后,作者发现,与非脑血管疾病患者相比,AIS患者血浆外泌体中CircOGDH高表达。
结论:
这些结果表明,CircOGDH是调节缺血神经元活力的潜在治疗靶点,在外周血中富含神经元来源的外泌体,在AIS患者中显示出半暗带的预测性生物标志物。
外泌体circOGDH参与AIS作用机制
2.癌症中Pumilio蛋白的调节和功能
标题:Modulation and function of Pumilio proteins in cancer
杂志:Semin Cancer Biol
影响因子:15.707
通讯作者:Patrícia Shiguno(LABCET)
转录后调节参与肿瘤的发生,在这一控制中,RNA结合蛋白是主要的主角。Pumilio蛋白是高度保守的RNA结合蛋白,调控RNA加工的许多方面。Pumilio表达异常与不同类型的癌症相关。本文综述了Pumilio 1和Pumilio 2在癌症中的作用,并讨论了其不同生物学功能的影响因素。在某些类型的肿瘤,如肺癌、胰腺癌、前列腺癌和宫颈癌中,Pumilio水平似乎与肿瘤进展和不良预后有关。Pumilio 1与癌症的增殖、迁移和侵袭有关,Pumilio 2也是如此,尽管关于后者的报道相互矛盾。此外,环状RNA circPUM1被描述为miRNA海绵,调节参与细胞周期的miRNA。Pumilio蛋白的表达和功能依赖于一系列调控因子的精细调节,包括miRNA、lncRNA和circRNA;这表明Pumilio通过多种调控轴在肿瘤发生中发挥重要作用。
与RNA相互作用的Pumilio同源结构域的晶体结构
3. CircRPN2抑制肝细胞癌的有氧糖酵解和转移
标题:CircRPN2 Inhibits Aerobic Glycolysis and Metastasis in Hepatocellular Carcinoma
杂志:Cancer Res
影响因子:12.701
通讯作者:黄晓武主任医师和Shao-Lai Zhou(复旦大学附属中山医院)
虽然已知环状RNAs (circRNAs)可以调节肿瘤的起始和进展,但其在肝细胞癌(HCC)转移中的作用仍不清楚。在这里,在先前的一项环状RNA测序研究中发现的三个转移相关环状RNAs在两个HCC队列中被筛选和验证。CircRPN2在高转移的HCC细胞株和有转移的HCC组织中下调。circRPN2水平较低的HCC患者的总生存期较短,累积复发率较高。体外和体内机制研究表明,circRPN2结合烯醇化酶1 (ENO1)并加速其降解,通过AKT/mTOR通路促进糖酵解重编程,从而抑制肝癌转移。CircRPN2也作为miR-183-5p的竞争性内源性RNA,增加叉头盒蛋白O1 (FOXO1)的表达,抑制糖代谢和肿瘤进展。在临床样本中,circRPN2表达与ENO1呈负相关,与FOXO1呈正相关,circRPN2的表达,无论是单独表达还是与ENO1、FOXO1联合表达,都是HCC预后的新指标。这些数据支持circRPN2通过加速ENO1降解和调控miR-183-5p /FOXO1轴来抑制肝癌有氧糖酵解和转移的模型,提示circRPN2可能是肝癌的治疗靶点。
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | CircOGDH是急性缺血性中风的半暗带生物标志物和治疗靶点 | CircOGDH Is a Penumbra Biomarker and Therapeutic Target in Acute Ischemic Stroke | Circ Res | 17.367 | 暨南大学第一附属医院 |
2 | 癌症中Pumilio蛋白的调节和功能 | Modulation and function of Pumilio proteins in cancer | Semin Cancer Biol | 15.707 | Carlos Chagas – FIOCRUZ-PR研究所 |
3 | CircRPN2抑制肝细胞癌的有氧糖酵解和转移 | CircRPN2 Inhibits Aerobic Glycolysis and Metastasis in Hepatocellular Carcinoma | Cancer Res | 12.701 | 复旦大学附属中山医院 |
4 | 修正:为环状RNA功能定制预测的生物信息学软件 | Correction to: CRAFT a bioinformatics software for custom prediction of circular RNA functions | Brief Bioinform | 11.622 | 帕多瓦大学 |
5 | 作为结直肠癌预测和预后的生物标志物的动态液体活检成分 | Dynamic liquid biopsy components as predictive and prognostic biomarkers in colorectal cancer | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 哈马德医疗公司 |
6 | ebv-circRPMS1通过sam68依赖的METTL3激活促进ebv相关胃癌的进展 | ebv-circRPMS1 promotes the progression of EBV-associated gastric carcinoma via Sam68-dependent activation of METTL3 | Cancer Lett | 8.679 | 中山大学附属第三医院 |
7 | “圆形RNA MYLK作为竞争性内源性RNA,通过调节VEGFA/VEGFR2信号通路促进膀胱癌进展”的勘误[cancer Letter 403(2017) 305-317] | Corrigendum to “Circular RNA MYLK as a competing endogenous RNA promotes bladder cancer progression through modulating VEGFA/VEGFR2 signaling pathway” [Cancer Letter 403(2017) 305-317] | Cancer Lett | 8.679 | 重庆医科大学 |
8 | SARS-CoV-2 Nsp14介导病毒感染对宿主细胞转录组的影响 | SARS-CoV-2 Nsp14 mediates the effects of viral infection on the host cell transcriptome | Elife | 8.14 | 美国沃尔瑟姆布兰代斯大学生物系 |
9 | 不同来源的外泌体携带的核酸和蛋白质作为妇科癌症的潜在生物标志物 | Nucleic acids and proteins carried by exosomes of different origins as potential biomarkers for gynecologic cancers | Mol Ther Oncolytics | 7.2 | 温州医科大学附属第二医院妇产科 |
10 | 非编码RNAs和胶质母细胞瘤:深入了解它们在转移中的作用 | Non-coding RNAs and glioblastoma: Insight into their roles in metastasis | Mol Ther Oncolytics | 7.2 | 伊朗医科大学 |
11 | 外泌体circSHKBP1通过pkm2介导的糖酵解参与非小细胞肺癌进展 | Exosomal circSHKBP1 participates in non-small cell lung cancer progression through PKM2-mediated glycolysis | Mol Ther Oncolytics | 7.2 | 南方医科大学附属医院龙华人民医院,南方科技大学第一附属医院,暨南大学第二临床医学院 |
12 | Hsa_circ_0001666通过miR-1184/miR-548I/AGO1轴促进非小细胞肺癌的迁移和侵袭 | Hsa_circ_0001666 promotes non-small cell lung cancer migration and invasion through miR-1184/miR-548I/AGO1 axis | Mol Ther Oncolytics | 7.2 | 青岛大学,华中科技大学同济医学院附属协和医院 |
13 | 基于环状RNA的斑马鱼脑中高效氯氰菊酯和毒死蜱急性中毒的生物标志物候选 | circRNA-based biomarker candidates for acute cypermethrin and chlorpyrifos toxication in the brain of Zebrafish (Danio rerio) | Chemosphere | 7.086 | Atatürk土耳其埃尔祖鲁姆大学 |
14 | CMTM6作为PD-L1的主调节器 | CMTM6 as a master regulator of PD-L1 | Cancer Immunol Immunother | 6.968 | 约旦科技大学文理学院生物技术与基因工程系 |
15 | 食管癌或前体病变患者组织和血浆的综合RNA数据集 | Comprehensive RNA dataset of tissue and plasma from patients with esophageal cancer or precursor lesions | Sci Data | 6.444 | 比利时根特大学 |
16 | 有明显病因的人类终末期心力衰竭的转录组景观变化 | Changes in transcriptomic landscape in human end-stage heart failure with distinct etiology | iScience | 5.458 | 华中科技大学,南开大学 |
17 | circ_0000831过表达足以通过mir -16-5p依赖机制抑制脑缺血神经炎症和眩晕 | Overexpressing circ_0000831 is sufficient to inhibit neuroinflammation and vertigo in cerebral ischemia through a miR-16-5p-dependent mechanism | Exp Neurol | 5.33 | 中国医科大学附属盛京医院 |
18 | circRNA DMNT1/p53/JAK/STAT在妊娠期糖尿病和子痫前期的可能作用 | The possible involvement of circRNA DMNT1/p53/JAK/STAT in gestational diabetes mellitus and preeclampsia | Cell Death Discov | 5.241 | 徐州医科大学附属沭阳医院 |
19 | klf2诱导的circZKSCAN1通过靶向miR-1294/PIM1轴增强透明细胞肾细胞癌的致瘤性 | KLF2-induced circZKSCAN1 potentiates the tumorigenic properties of clear cell renal cell carcinoma by targeting the miR-1294/PIM1 axis | Cell Cycle | 4.534 | 上海交通大学医学院附属上海总医院泌尿外科 |
20 | Circ_0064288通过抑制miR-335-5p的表达,促进ROCK1的表达,成为肝细胞癌细胞的癌基因 | Circ_0064288 acts as an oncogene of hepatocellular carcinoma cells by inhibiting miR-335-5p expression and promoting ROCK1 expression | BMC Cancer | 4.43 | 佳木斯市中医院消化内科 |
21 | 环状RNA circ-PLCD1通过失活PI3K/AKT信号通路在非小细胞肺癌中发挥抑癌作用 | Circular RNA circ-PLCD1 functions as a tumor suppressor in non-small cell lung cancer by inactivation of PI3K/AKT signaling pathway | Hum Cell | 4.174 | 郑州大学第一附属医院 |
22 | miR-218-5p抑制circ_0036176翻译的Myo9a-208对心脏成纤维细胞增殖的抑制作用 | Suppression of the Inhibitory Effect of circ_0036176-Translated Myo9a-208 on Cardiac Fibroblast Proliferation by miR-218-5p | J Cardiovasc Transl Res | 4.132 | 广东省人民医院 |
23 | Circ_0014130通过miR-197-3p/PFKFB3轴参与结直肠癌的药物敏感性 | Circ_0014130 is involved in the drug sensitivity of colorectal cancer through miR-197-3p/PFKFB3 axis | J Gastroenterol Hepatol | 4.029 | 中国医科大学肿瘤医院 |
24 | CircEIF5通过p-NFκB和p-STAT3信号通路参与银屑病角质形成细胞的增殖和炎症 | CircEIF5 contributes to hyperproliferation and inflammation of keratinocytes in psoriasis via p-NFκB and p-STAT3 signaling pathway | Exp Dermatol | 3.96 | 山东大学齐鲁医学院齐鲁医院皮肤科 |
25 | 环状RNAs表达在口腔鳞状细胞癌中的预后意义 | Prognostic Significance of CircRNAs Expression in Oral Squamous Cell Carcinoma | Oral Dis | 3.511 | 青岛大学 |
26 | Circ_0003340下调可通过靶向miR-940/PRKAA1轴减轻食管鳞状细胞癌进展 | Circ_0003340 downregulation mitigates esophageal squamous cell carcinoma progression by targeting miR-940/PRKAA1 axis | Thorac Cancer | 3.5 | 吉林北华大学附属医院消化内科 |
27 | Hsa_circ_0017639通过作为miR-1296-5p分子海绵和调节sine oculis homeobox 1在非小细胞肺癌中的表达,调控顺铂耐药和肿瘤生长 | Hsa_circ_0017639 regulates cisplatin resistance and tumor growth via acting as a miR-1296-5p molecular sponge and modulating sine oculis homeobox 1 expression in non-small cell lung cancer | Bioengineered | 3.269 | 山西医科大学附属肿瘤医院 |
28 | 环状RNA circ_0002360通过microrna -585- 3k依赖调控G蛋白调控的神经突生长诱导子1调控紫杉醇耐药和紫杉醇耐药非小细胞肺癌细胞的恶性行为 | Circular RNA circ_0002360 regulates the Taxol resistance and malignant behaviors of Taxol-resistant non-small cell lung cancer cells by microRNA-585-3p-dependent modulation of G protein regulated inducer of neurite outgrowth 1 | Bioengineered | 3.269 | 西安交通大学第一附属医院 |
29 | Hsa_circ_0037128通过介导miR-31-5p/KLF9加重糖尿病肾病中高糖诱导的足细胞损伤 | Hsa_circ_0037128 aggravates high glucose-induced podocytes injury in diabetic nephropathy through mediating miR-31-5p/KLF9 | Autoimmunity | 2.815 | 惠州市中心人民医院手足外科 |
30 | Circ_0060531敲低可通过结合miR-330-5p降低GAB1的表达,从而改善il -22诱导的角质形成细胞损伤 | Circ_0060531 knockdown ameliorates IL-22-induced keratinocyte damage by binding to miR-330-5p to decrease GAB1 expression | Autoimmunity | 2.815 | 湖北省中医院皮肤科 |
31 | Circ_0000064通过miR-532-3p/ROCK1轴促进高糖诱导的肾小管上皮细胞损伤,促进糖尿病肾病进展 | Circ_0000064 promotes high glucose-induced renal tubular epithelial cells injury to facilitate diabetic nephropathy progression through miR-532-3p/ROCK1 axis | BMC Endocr Disord | 2.763 | 宝鸡市中心医院 |
32 | 血清hsa_circ_0079480是急性髓系白血病新的预后标志物 | Serum hsa_circ_0079480 is a novel prognostic marker for acute myeloid leukemia | J Clin Lab Anal | 2.352 | 西安市中心医院 |
33 | Hsa_circRNA_0017620通过miR-520a-5p/KRT5轴调控非小细胞肺癌的细胞进展 | Hsa_circRNA_0017620 regulated cell progression of non-small-cell lung cancer via miR-520a-5p/KRT5 axis | J Clin Lab Anal | 2.352 | 恩施土家族苗族自治州中心医院 |
34 | Circ_0062558通过靶向miR-876-3p/SLC1A5轴促进三阴性乳腺癌的生长、迁移和谷氨酰胺代谢 | Circ_0062558 promotes growth, migration, and glutamine metabolism in triple-negative breast cancer by targeting the miR-876-3p/SLC1A5 axis | Arch Gynecol Obstet | 2.344 | 成都市第三人民医院 |
35 | Circ_0048856与ABCC1竞争miR-193a-5p/miR-98-5p结合位点,促进肺癌顺铂耐药和肿瘤发生 | Circ_0048856 competes with ABCC1 for miR-193a-5p/miR-98-5p binding sites to promote the cisplatin resistance and tumorigenesis in lung cancer | J Chemother | 1.714 | 乐山市人民医院胸外科 |