欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计30篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.CircIKBKB通过维持NF-κB信号促进乳腺癌骨转移
标题:Circular RNA circIKBKB promotes breast cancer bone metastasis through sustaining NF-κB/bone remodeling factors signaling
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.402
通讯作者:李隽(中山大学医学院)和宋立兵(华南肿瘤学国家重点实验室)
在乳腺癌发展过程中有明显的扩散到骨骼的趋势,导致严重的骨骼并发症和死亡率。最近,多个circRNA分子被报道有助于癌症的发生和发展。然而,circRNA在骨转移中的作用和机制尚不清楚。使用环状RNA深度测序筛选与骨转移相关的circRNAs,并使用原位杂交技术在有或没有骨转移的乳腺癌组织中进行验证。使用破骨细胞生成、免疫荧光实验等确定circIKBKB在诱导骨转移前的合成和骨转移中的作用。使用RNA pull-down、双荧光素酶报告基因实验、通过RNA纯化后的染色质分离和酶联免疫吸附试验研究了circIKBKB介导的NF-κB信号的激活和EIF4A3诱导的circIKBKB合成的潜在机制。如图1所示,本研究揭示了circIKBKB介导的NF-κB在骨转移乳腺癌中高活化的可能机制,这可能代表一种治疗乳腺癌骨转移的潜在策略。
图1
2.CircBART2.2结合RIG-I解旋酶结构域,激活转录因子IRF3和NF-κB,促进PD-L1的转录和肿瘤免疫逃逸
标题:Epstein-Barr virus-encoded circular RNA circBART2.2 promotes immune escape of nasopharyngeal carcinoma by regulating PD-L1
杂志:Cancer Res
影响因子:12.701
通讯作者:曾朝阳(中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院)
EBV病毒感染是鼻咽癌 (NPC)的确定病因,并参与多种恶性表型,包括肿瘤免疫和逃逸。EBV可以编码多种circRNAs,然而关于这些环状核糖核酸在NPC中的生物学功能却知之甚少。在这项研究中,作者发现EBV编码的circBART2.2在NPC中高表达,它上调PD-L1的表达,并抑制体内外的T细胞功能。如图2所示circBART2.2通过结合RIG-I的解旋酶结构域,激活转录因子IRF3和NF-κB,促进PD-L1的转录,导致肿瘤免疫逃逸。这些结果阐明了circBART2.2的生物学功能,解释了EBV感染引起免疫逃逸的新机制,并为治疗NPC提供新的免疫治疗靶点。
意义:这篇文章证明与RIG-I结合的circBART2.2对鼻咽癌中PD-L1的转录调控和随后的免疫逃逸是必不可少的。
图2
3.CircRNAs与复杂疾病:从实验结果到计算模型
标题:Circular RNAs and complex diseases: from experimental results to computational models杂志:Brief Bioinform
影响因子:11.623
通讯作者:陈兴(中国矿业大学信息与控制工程学院)和赵琦(辽宁科技大学计算机科学与软件工程学院)
CircRNAs是一类具有多种生物学功能的单链共价封闭RNA分子。研究表明,circRNAs参与多种生物学过程,在各种复杂疾病的发生发展中发挥重要作用,因此识别circRNAs与疾病的相关性将有助于疾病的诊断和治疗。在本研究中,作者综述了circRNAs的发现、分类和功能,并介绍了与circRNAs相关的四种重要疾病。然后,作者列出一些重要的、公开可访问的数据库。接下来,作者介绍一些用于预测新的circRNAs和疾病关联的最新计算模型,并将它们分为两类,即基于网络算法的模型和基于机器学习的模型。随后,总结了几种评价这些计算模型预测性能的方法。最后,作者分析不同类型计算模型的优缺点,并从构建新的计算模型和积累circRNAs相关数据的角度,为促进circRNAs与疾病关联识别的发展提出了一些建议。
4.Cis-HOX-HOXC10信号通路是APC野生型的结直肠癌潜在治疗靶点
标题:Identification of cis-HOX-HOXC10 axis as a therapeutic target for colorectal tumor-initiating cells without APC mutations
杂志:Cell Reports
影响因子:9.424
通讯作者:朱平平、陈珍珍(郑州大学)和范祖森(中国科学院生物物理研究所)
结直肠癌是世界上最常见的癌症之一,其中大肠腺瘤性息肉病(APC)突变频繁且独特。在这里,作者发现cis-HOX(环状RNA稳定HOXC10)在结肠直肠肿瘤起始细胞(TICs)中强有力地表达。Cis-HOX敲除降低TICs数量,并损害TICs的自我更新、肿瘤发生和转移能力,而cis-HOX过表达可以驱动TICs自我更新和转移。从机制上讲,如图3所示cisHOX与HOXC10 mRNA结合,通过阻断HOXC10的3’UTR区域的KSRP蛋白结合序列来减弱其衰减。HOXC10在结直肠肿瘤和TICs中高表达,通过激活FZD3表达触发Wnt/β-catenin激活。HOXC10抑制剂盐霉素在APC野生型结直肠肿瘤中发挥有效的治疗效果,但在APC无义突变的肿瘤中没有。因此,cis-HOX-HOXC10途径驱动结肠直肠肿瘤的发生、发展和转移,并作为APC野生型结肠直肠肿瘤的潜在治疗靶点。
图3
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | CircIKBKB通过 维持NF-κB信号脱落促进乳腺癌骨转移 | Circular RNA circIKBKB promotes breast cancer bone metastasis through sustaining NF-κB/bone remodeling factors signaling | Mol Cancer | 27.402 | 广州市肿瘤研究所 |
2 | CircBART2.2通过结合RIG-I解旋酶结构域,激活转录因子IRF3和NF-κB,促进PD-L1的转录,导致肿瘤免疫逃逸。 | Epstein-Barr virus-encoded circular RNA circBART2.2 promotes immune escape of nasopharyngeal carcinoma by regulating PD-L1 | Cancer Res | 12.701 | 中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院 |
3 | CircRNA与复杂疾病:从实验结果到计算模型 | Circular RNAs and complex diseases: from experimental results to computational models | Brief Bioinform | 11.621 | 中国矿业大学 |
4 | circRNA在黑色素瘤中的作用 | Squaring the circle: circRNAs in melanoma | Oncogene | 9.864 | 美国H. Lee Moffitt癌症中心和研究所分子肿瘤科 |
5 | Cis-HOX-HOXC10信号通路是APC野生型的结直肠癌潜在治疗靶点 | Identification of cis-HOX-HOXC10 axis as a therapeutic target for colorectal tumor-initiating cells without APC mutations | Cell Rep | 9.424 | 郑州大学生命科学院 |
6 | 哺乳动物的circRNA来源于剪切错误 | Mammalian circular RNAs result largely from splicing errors | Cell Rep | 9.424 | 美国密歇根大学生态与进化生物学学院 |
7 | Circ_0000143通过miR-142-3p下游靶点GRα调控T-ALL发展 | Down-regulation of circRNA_0000143 regulates miR-142-3p/GRα axis to facilitate the progression of T-ALL | Cancer Sci | 6.714 | 中国科学技术大学第一附属医院血液科 |
8 | CircSPIDR通过海绵结合miR-431-5p并调节SORCS1和CUBN的表达,在宫颈腺癌中发挥肿瘤抑制因子的作用 | CircSPIDR acts as a tumour suppressor in cervical adenocarcinoma by sponging miR-431-5p and regulating SORCS1 and CUBN expression | Aging (Albany NY) | 5.684 | 浙江大学医学院附属女子医院妇科肿瘤科 |
9 | CircFOXK2通过IGF2BP3/miR-370轴促进乳腺癌的发生 | CircRNA circFOXK2 facilitates oncogenesis in breast cancer via IGF2BP3/miR-370 axis | Aging (Albany NY) | 5.684 | 河北省青县人民医院普外科 |
10 | CircSP3结合miR-198,通过上调cyclin-dependent kinase 4发挥促癌作用 | Circular RNA circSP3 promotes hepatocellular carcinoma growth by sponging microRNA-198 and upregulating cyclin-dependent kinase 4 | Aging (Albany NY) | 5.684 | 重庆医科大学附属第一医院肝胆外科 |
11 | CircN4BP2L2通过调控miR-340-5p/CXCR4轴促进结直肠癌生长和转移 | CircN4BP2L2 promotes colorectal cancer growth and metastasis through regulation of the miR-340-5p/CXCR4 axis | Lab Invest | 5.661 | 中南大学湘雅医院国家老年疾病临床研究中心 |
12 | CircPVT1海绵作用miR-339-3p调节MCL-1的表达,进而影响GBC细胞内的肿瘤进展 | CircPVT1 promotes gallbladder cancer growth by sponging miR-339-3p and regulates MCL-1 expression | Cell Death Discov | 5.243 | 上海交通大学医学院附属新华医院普外科 |
13 | CircRNA UBAP2结合miR-1294,通过调节c-Myc的表达增加促进肝癌发生 | CircRNA UBAP2 serves as a sponge of miR-1294 to increase tumorigenesis in hepatocellular carcinoma through regulating c-Myc expression | Carcinogenesis | 4.941 | 复旦大学附属中山医院肝癌研究所肝脏外科 |
14 | CircRNA对癌症精准医学的功能性诊断和预防具有重要作用和应用前景 | The power and the promise of circRNAs for cancer precision medicine with functional diagnostics and prognostic prediction | Carcinogenesis | 4.940 | 上海交通大学医学院瑞金医院胰腺疾病研究所 |
15 | CircRNA circ_SEC24A通过海绵作用miR-26b-5p上调DNMT3A表达,从而加重骨关节炎进展 | CircRNA circ_SEC24A upregulates DNMT3A expression by sponging miR-26b-5p to aggravate osteoarthritis progression | Int Immunopharmacol | 4.930 | 南华大学附属南华医院运动医学科 |
16 | hsa_circ_0051488与mir-6717-5p结合,从而调节肺癌抑制基因SATB2的表达 | Benzo[a]pyrene diol epoxide-induced transformed cells identify the significance of hsa_circ_0051488, a ERCC1-derived circular RNA in pulmonary squamous cell carcinoma | Carcinog | 4.781 | 中国医科大学公共卫生学院毒理学教研室 |
17 | kras驱动的肿瘤内异质性通过circHIPK3/PTK2免疫抑制回路触发M2巨噬细胞浸润 | Kras-driven intratumoral heterogeneity triggers infiltration of M2 polarized macrophages via the circHIPK3/PTK2 immunosuppressive circuit | Sci Rep | 4.371 | 希腊塞萨洛尼基亚里斯多德大学医学系 |
18 | Circular RNA与人类疾病:基础研究和翻译意义 | Circular RNA and human diseases: Basic research and translational implications | Cell Signal | 4.312 | 南京医科大学附属南京医科大学第一医院普外科 |
19 | CircZFR通过miR-16/MAPK1轴调控甲状腺癌进展 | CircZFR regulates thyroid cancer progression by the miR-16/MAPK1 axis | Environ Toxicol | 4.114 | 中国南阳市第一人民医院甲状腺乳腺外科 |
20 | Circ_0003972通过调控miR-654-5p/FZD4轴促进类风湿性关节炎中成纤维细胞样滑膜细胞的增殖和炎症 | Circ_0003972 Promotes the Proliferation and Inflammation of Fibroblast-like Synovial Cells in Rheumatoid Arthritis through Regulation of the miR-654-5p/FZD4 Axis | Immunol Invest | 3.651 | 西安市第五医院风湿免疫科 |
21 | Circ_0000520通过介导miR-1296/ZFX轴促进三阴性乳腺癌进展 | Circ_0000520 contributes to triple-negative breast cancer progression through mediating the miR-1296/ZFX axis | Thorac Cancer | 3.500 | 中国恩施市恩施土家族苗族自治州中心医院乳腺外科 |
22 | CircFAT1在EC细胞中高表达,通过抑制miR-21甲基化保持癌细胞干性 | Overexpression of circRNA circFAT1 in Endometrial Cancer Cells Increases Their Stemness by Upregulating miR-21 Through Methylation | Cancer Biother Radiopharm | 3.094 | 嘉兴市妇幼保健院 |
23 | 敲低circ – PVT1可通过miR – 429/FOXK1信号轴抑制肺腺癌的进展并增强对顺铂的敏感性 | Knockdown of circPVT1 inhibits the progression of lung adenocarcinoma and enhances the sensitivity to cisplatin via the miR429/FOXK1 signaling axis | Mol Med Rep | 2.950 | 南通大学附属医院肿瘤科 |
24 | CircWHSC1是miR-296-3p的ceRNA,通过上调AKT3促进NSCLC细胞生长和转移 | CircRNA WHSC1 promotes non-small cell lung cancer progression via sponging microRNA-296-3p and up-regulating expression of AKT serine/threonine kinase 3 | J Clin Lab Anal | 2.352 | 慈溪市人民医院胸外科 |
25 | CircRNAs作为诊断乳腺癌的有前途的生物标志物:一项最新的meta分析 | CircRNAs as promising biomarker in diagnosis of breast cancer: An updated meta-analysis | J Clin Lab Anal | 2.352 | 南京医科大学医学遗传学教研室 |
26 | 在类风湿性关节炎中circ_0025908通过miR-137/HIPK2轴调控细胞活力和增殖 | Circ_0025908 regulates cell vitality and proliferation via miR-137/HIPK2 axis of rheumatic arthritis | J Orthop Surg Res | 2.351 | 惠州市中心人民医院骨科研究所创伤骨科 |
27 | Circ_0008673通过海绵化miR-153-3p上调CFL2表达促进乳腺癌进展 | Circ_0008673 regulates breast cancer malignancy by miR-153-3p/CFL2 axis | Arch Gynecol Obstet | 2.344 | 湖北医科大学人民医院肿瘤科 |
28 | 姜黄素通过调控circ-FNDC3B/miR-138-5p/IGF2信号机制抑制肾癌的发生 | Curcumin suppresses renal carcinoma tumorigenesis by regulating circ-FNDC3B/miR-138-5p/IGF2 axis | Anticancer Drugs | 2.241 | 南通市中医院泌尿外科 |
29 | Circ_0001017通过miR-543/PHLPP2轴降低胃癌细胞对顺铂的化疗耐药性 | Circular RNA circ_0001017 Sensitizes Cisplatin-Resistant Gastric Cancer Cells to Chemotherapy by the miR-543/PHLPP2 Axis | Biochem Genet | 1.894 | 苏州大学附属第一医院普外科 |
30 | 沉默Circ_0007031通过miR -485-3p依赖的途径下调MELK,抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡 | Circ_0007031 Silencing Inhibits Cell Proliferation and Induces Cell Apoptosis via Downregulating MELK at a miR-485-3p-Dependent Way in Colorectal Cancer | Biochem Genet | 1.894 | 长江大学附属第一人民医院 |