欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计38篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

 

1、 尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器用于前列腺特异性抗原 2-10 ng/mL 患者的高级别前列腺癌初始活检(Letter)

标题:A urine extracellular vesicle circRNA classifier for detection of high-grade prostate cancer in patients with prostate-specific antigen 2-10 ng/mL at initial biopsy

杂志:Mol Cancer.

影响因子:27.404

通讯作者:李辽源教授(中山大学附属第三医院)

 

本研究的目的是确定一种尿液细胞外囊泡环状 RNA (circRNA) 分类器,该分类器可以检测等级组 (GG) 2 或更高级别前列腺癌 (PCa)。为此,我们使用 RNA 测序从 11 名高级别前列腺癌患者和 11 名匹配的良性前列腺增生患者的尿细胞外囊泡中鉴定候选 circRNA。在训练队列(n = 263)中使用 ddPCR,我们构建了一个尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器(Ccirc,包含 circPDLIM5、circSCAF8、circPLXDC2、circSCAMP1 和 circCCNT2),在两个独立的队列(n = 497, n = 505)。 Ccirc 在训练队列和验证队列中均显示出比两种标准护理风险计算器 (RC)(PCPT-RC 2.0 和 ERSPC-RC)更高的准确性。在所有三个队列中,这种新型尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器加上 RC 在预测 ≥ GG2 PCa 方面比单独的 RC 在统计学上更具预测性。这种检测不需要预先收集直肠指检或特殊处理,是可重复的、无创的,并且可以作为基本临床工作流程的一部分轻松实施。

 

 

2、 基于网状杂交链反应的CircRNA特异性和灵敏检测

标题:Specific and sensitive detection of CircRNA based on netlike hybridization chain reaction

杂志:Biosens Bioelectron.

影响因子:10.613

通讯作者:朱曲波副教授(中南大学湘雅药学院)

环状RNA(circRNA)作为一类新的生物标志物,在癌症的发生发展中起着重要作用。然而,近年来检测方法的局限性严重制约了circRNA的相关研究。在这里,我们开发了一种基于恒温网状杂交链反应 (HCR) 的 circRNA 有效检测方法。它将逆转录-滚环扩增(RT-RCA)与精心设计的网状HCR相结合,实现双选择和双信号放大,可消除线性异构体的干扰。这种二维网状HCR由一个巧妙设计的触发链和两个发夹式fuel探针组成,可以在恒温下与含有多组重复的RT-RCA产物形成稳定的网络结构,从而产生增强的荧光信号。系统研究表明,优化后的网状 HCR 系统对含有多组重复序列的 DNA 链具有更高的检测效率,可检测低至 0.1 pM 的 circRNA,并且具有优异的选择性。通过使用人类肿瘤细胞系和组织,已经验证了基于网状HCR的方法可以在没有RNase R富集的情况下准确检测真实生物样品中的特定circRNA,为检测低丰度circRNA提供了一个简单而有用的平台。此外,所提出的策略也是检测一些含有重复序列的基因的潜在方法,如端粒 DNA、着丝粒 DNA 和核糖体 DNA (rDNA)。

 

 

 

3、 用于肝细胞癌诊断的超灵敏circRNA检测的集成电化学POCT平台

标题:An integrated electrochemical POCT platform for ultrasensitive circRNA detection towards hepatocellular carcinoma diagnosis

杂志:Biosens Bioelectron.

影响因子:10.613

通讯作者:梁波、叶学松教授(浙江大学)和蔡秀军教授(浙江大学医学院附属邵逸夫医院)

 

肝细胞癌 (HCC) 是癌症相关死亡的第四大原因。 Circ-CDYL 是环状 RNA(circRNA)之一,被认为是 HCC 早期诊断的独立标志物。 circRNA 的即时检测 (POCT) 是必不可少的,并且对临床应用有很大的需求。在此,我们报告了一个集成电化学 POCT 平台,基于 AuNFs/PNA修饰的碳纤维微电极(CFME)检测 circRNA 。 PNA 用作识别元件,高度指定用于 circRNA 的反向剪接连接。 AuNFs 增加了 PNA 探针的活性位点,在超低水平上提高了目标捕获效率。该平台提供 10 fM 至 1 μM 的线性范围,检测限低至 3.29 fM。这种生物传感器对单碱基错配表现出高度的特异性,并且可以稳定长达 24 天。分析性能也已在人血清样品中得到验证,证明了其在 HCC 临床 POCT 应用中的潜在效用。

 

 

文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器用于前列腺特异性抗原 2-10 ng/mL 患者的高级别前列腺癌初始活检 A urine extracellular vesicle circRNA classifier for detection of high-grade prostate cancer in patients with prostate-specific antigen 2-10 ng/mL at initial biopsy Mol Cancer. 27.404 中山大学附属第三医院等
2 2、基于网状杂交链反应的CircRNA特异性和灵敏检测 Specific and sensitive detection of CircRNA based on netlike hybridization chain reaction Biosens Bioelectron. 10.613 中南大学湘雅药学院等
3 用于肝细胞癌诊断的超灵敏circRNA检测的集成电化学POCT平台 An integrated electrochemical POCT platform for ultrasensitive circRNA detection towards hepatocellular carcinoma diagnosis Biosens Bioelectron. 10.613 浙江大学等
4 低氧外泌体HIF-1α-稳定circZNF91通过增强糖酵解促进常氧胰腺癌细胞的化疗抗性 Hypoxic exosomal HIF-1α-stabilizing circZNF91 promotes chemoresistance of normoxic pancreatic cancer cells via enhancing glycolysis Oncogene. 9.861 武汉协和医院等
5 自噬相关的circRNA评估显示hsa_circ_0001747是前列腺癌患者生化复发的潜在有利预后因素 Autophagy-related circRNA evaluation reveals hsa_circ_0001747 as a potential favorable prognostic factor for biochemical recurrence in patients with prostate cancer Cell Death Dis. 8.461 南方医科大学珠江医院等
6 高通量测序鉴定环状 RNA circUBE2K 通过调控 miR-516b-5p/ARHGAP5 轴介导 RhoA 相关膀胱癌表型 High-throughput sequencing identified circular RNA circUBE2K mediating RhoA associated bladder cancer phenotype via regulation of miR-516b-5p/ARHGAP5 axis Cell Death Dis. 8.46 复旦大学等
7 一种新型内含子环状 RNA 通过吸收降解 CREBBP 和加速 IFN-β 产生的 microRNA 来拮抗流感病毒 A Novel Intronic Circular RNA Antagonizes Influenza Virus by Absorbing a microRNA That Degrades CREBBP and Accelerating IFN-尾 Production mBio. 7.862 中国农业科学院等
8 肺癌中的环状 RNA:最新进展和未来展望 Circular RNAs in Lung Cancer: Recent Advances and Future Perspectives Front Oncol.Review 6.241 中国医科大学附属盛京医院等
9 环状 RNA circ-MMP11 通过调节 miR-153-3p/ANLN 轴促进乳腺癌细胞的拉帕替尼耐药 Circular RNA circ-MMP11 Contributes to Lapatinib Resistance of Breast Cancer Cells by Regulating the miR-153-3p/ANLN Axis Front Oncol. 6.241 淮安第一人民医院等
10 胃癌中表达异常的非编码RNA及其诊断价值 Aberrant Non-Coding RNA Expressed in Gastric Cancer and Its Diagnostic Value Front Oncol. 6.241 上海市第一人民医院等
11 侵袭性伪足中的非编码 RNA:癌症转移的新见解 Non-Coding RNAs in Invadopodia: New Insights Into Cancer Metastasis Front Oncol.Review 6.24 加拿大多伦多大学等
12 鉴定影响肝细胞癌中环状 RNA 表达的新型 RNA 结合蛋白 Identification of Novel RNA Binding Proteins Influencing Circular RNA Expression in Hepatocellular Carcinoma Int J Mol Sci. 5.922 卢布尔雅那大学等
13 环状RNA在鱼类中的作用及其作为生物标志物的潜在应用 Function of Circular RNAs in Fish and Their Potential Application as Biomarkers Int J Mol Sci.Review 5.921 诺德大学等
14 CircFBXL5通过调节miR-216b/HMGA2轴促进乳腺癌5-FU耐药 CircFBXL5 promotes the 5-FU resistance of breast cancer via modulating miR-216b/HMGA2 axis Cancer Cell Int. 5.724 郑州大学第一附属医院等
15 环状 RNA Circ_0067934 通过 miR-545-3p/SLC7A11 信号途径减弱甲状腺癌细胞的铁死亡 Circular RNA Circ_0067934 Attenuates Ferroptosis of Thyroid Cancer Cells by miR-545-3p/SLC7A11 Signaling Front Endocrinol (Lausanne). 5.552 齐齐哈尔市第一医院等
16 Hsa_circ_0000520过表达通过miR-1296增加CDK2表达促进宫颈癌细胞增殖 Hsa_circ_0000520 overexpression increases CDK2 expression via miR-1296 to facilitate cervical cancer cell proliferation J Transl Med. 5.534 苏州科技城医院等
17 单克隆 EL4 细胞系中Zbtb1 基因敲除的 MicroRNA 和 circRNA 表达分析 MicroRNA and circRNA Expression Analysis in a Zbtb1 Gene Knockout Monoclonal EL4 Cell Line Front Cell Infect Microbiol. 5.29 吉林农业大学等
18 环状 RNA circSETD3 通过吸附 miR-641 上调 PTEN 阻碍膀胱癌中的细胞生长、迁移和干细胞特性 Circular RNA circSETD3 hampers cell growth, migration, and stem cell properties in bladder cancer through sponging miR-641 to upregulate PTEN Cell Cycle. 4.533 成都中医药大学附属医院等
19 环状RNA MAT2B通过吸附miR-431促进非小细胞肺癌细胞的迁移、侵袭和上皮间质转化 Circular RNA MAT2B promotes migration, invasion and epithelial-mesenchymal transition of non-small cell lung cancer cells by sponging miR-431 Cell Cycle. 4.533 成都中医药大学附属医院等
20 ceRNA网络的构建和综合分析以揭示肺腺癌的潜在预后生物标志物 Construction and comprehensive analysis of a ceRNA network to reveal potential prognostic biomarkers for lung adenocarcinoma BMC Cancer. 4.43 安徽医科大学第一附属医院等
21 环状非编码 RNA hsa_circ_0005986 作为肝细胞癌的预后生物标志物 Circular noncoding RNA hsa_circ_0005986 as a prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma Sci Rep. 4.37 韩国庆北国立大学医学院等
22 Circ-SHPRH 在癌症中的新兴作用 The Emerging Role of Circ-SHPRH in Cancer Onco Targets Ther.Review 4.143 吉林大学白求恩医学院等
23 circHIPK3的沉默通过靶向miR-1286调节HK2使紫杉醇抗性乳腺癌细胞对化疗敏感 Silencing of circHIPK3 Sensitizes Paclitaxel-Resistant Breast Cancer Cells to Chemotherapy by Regulating HK2 Through Targeting miR-1286 Cancer Manag Res. 3.983 赣州市人民医院等
24 大脑健康和疾病中的非编码 RNA 串扰 Noncoding RNA crosstalk in brain health and diseases Neurochem Int. 3.921 美国威斯康星大学等
25 性染色体来源的尿液外泌体环状RNA与IgA肾病患者临床病理特征的性别相关风险差异相关 Urinary exosomal circular RNAs of sex chromosome origin are associated with gender-related risk differences of clinicopathological features in patients with IgA nephropathy J Nephrol. 3.903 吉林大学第二医院等
26 环状RNA TADA2A通过调节miR-638/KIAA0101信号促进非小细胞肺癌增殖和迁移 Circular RNA TADA2A promotes proliferation and migration via modulating of miR638/KIAA0101 signal in nonsmall cell lung cancer Oncol Rep. 3.901 辽宁省肿瘤医院等
27 circExp 数据库:癌症中人类 circRNA 表达的在线转录组平台 circExp database: an online transcriptome platform for human circRNA expressions in cancers Database (Oxford). 3.451 北京大学生命科学学院等
28 葡萄糖剥夺诱导的人髓核细胞变性中差异表达的circRNA的综合概况分析 Comprehensive Profile Analysis of Differentially Expressed circRNAs in Glucose Deprivation-Induced Human Nucleus Pulposus Cell Degeneration Biomed Res Int. 3.413 同济大学医学院等
29 在 16HBE 细胞中Circ-RBMS1 敲低通过 miR-197-3p 上调 FBXO11 减轻 CSE 诱导的细胞凋亡、炎症和氧化应激 Circ-RBMS1 Knockdown Alleviates CSE-Induced Apoptosis, Inflammation and Oxidative Stress via Up-Regulating FBXO11 Through miR-197-3p in 16HBE Cells Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. 3.352 成都军区昆明总医院等
30 circFAT1/microRNA-525-5p/spindle和动粒相关复合亚基1(SKA1)轴通过激活notch和Wnt信号通路调节乳腺癌的奥沙利铂耐药性 Circular RNA FAT atypical cadherin 1 (circFAT1)/microRNA-525-5p/spindle and kinetochore-associated complex subunit 1 (SKA1) axis regulates oxaliplatin resistance in breast cancer by activating the notch and Wnt signaling pathway Bioengineered. 3.263 常州市第二人民医院等
31 环状RNA circRNA_0082835通过吸附 miRNA-429促进原发性黑色素瘤的进展和淋巴转移 Circular RNA circRNA_0082835 promotes progression and lymphatic metastasis of primary melanoma by sponging microRNA miRNA-429 Bioengineered. 3.263 江苏省人民医院等
32 环状 RNA hsa_circ_0033144 (CircBCL11B) 通过 miR-579/LASP1 轴调节口腔鳞状细胞癌进展 Circular RNA hsa_circ_0033144 (CircBCL11B) regulates oral squamous cell carcinoma progression via the miR-579/LASP1 axis Bioengineered. 3.263 梅州市人民医院等
33 CircFADS2在骨关节炎中下调并通过调节miR-195-5p甲基化抑制LPS诱导的软骨细胞凋亡 CircFADS2 is downregulated in osteoarthritis and suppresses LPS-induced apoptosis of chondrocytes by regulating miR-195-5p methylation Arch Gerontol Geriatr. 3.251 西南医科大学附属医院等
34 循环环状 RNA (hsa_circ_0013587) 水平升高可作为胰腺癌的新型生物标志物 Increased levels of circulating circular RNA (hsa_circ_0013587) may serve as a novel biomarker for pancreatic cancer Biomark Med. 2.852 宁波大学医学院附属医院等
35 Circ_0000317/microRNA-520g/HOXD10轴对结直肠癌生物学特性的影响 Circ_0000317/microRNA-520g/HOXD10 axis affects the biological characteristics of colorectal cancer Kaohsiung J Med Sci. 2.741 中国科学院大学华美医院等
36 致癌circDHTKD1通过上调miR-326介导的GAB1在体外和体内促进口腔鳞状细胞癌的肿瘤生长和转移 Oncogenic circDHTKD1 promotes tumor growth and metastasis of oral squamous cell carcinoma in vitro and in vivo via upregulating miR-326-mediated GAB1 Braz J Med Biol Res. 2.594 海南医学院第二附属医院等
37 Hsa_circRNA_102682在与肌酐呈负相关的糖尿病高同型半胱氨酸血症中的低表达与TGF-β和CTGF相关 Lower expression of Hsa_circRNA_102682 in diabetic hyperhomocysteinemia negatively related to creatinemia is associated with TGF-尾 and CTGF J Clin Lab Anal. 2.353 宁波大学医学院等
38 环状RNA circβ-catenin通过编码肽加重非小细胞肺癌的恶性表型 Circular RNA circβ-catenin aggravates the malignant phenotype of non-small-cell lung cancer via encoding a peptide J Clin Lab Anal. 2.353 宁波大学医学院等

 

发表评论