欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计57篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、体液中的环状RNA作为癌症生物标记物:液体活检的新领域。

标题:Circular RNAs in body fluids as cancer biomarkers: the new frontier of liquid biopsies.

杂志:Mol Cancer.Review;影响因子:15.302

通讯作者:王美林、刘凌翔和杜牧龙(南京医科大学)

癌症是世界范围内主要的死亡原因,尤其是在癌症晚期被诊断出的患者死亡率很高。源自血液的常规生物标志物被广泛用于癌症诊断,但是它们的低灵敏度和特异性限制了它们在普通人群中进行癌症筛查的广泛应用。当前,新兴的研究希望在人体液中开发利用新颖,高精度的生物标记物,这些标记物可通过微创技术(定义为液体活检)获得。环状RNA(circRNA)是一类新发现的非编码RNA,主要通过mRNA前体剪接产生。随着高通量转录组分析技术的迅速发展,人们已经认识到许多circRNA在血浆,血清,外泌体和尿液等体液中稳定且高水平存在。 CircRNA的表达方式在癌症患者和健康对照者之间表现出明显的差异,这表明体液中的circRNA可能代表了监测癌症发展和进展的新型生物标记。在这项研究中,作者总结了泛癌数据集中circRNAs在体液中的表达,并表征了其在液体活检中的临床应用,以进行癌症的诊断和预后。此外,研究人员还开发了用户友好的Web界面来轻松地浏览和搜索与疾病相关的circRNA。

网址:https://mulongdu.shinyapps.io/circrnas_in_fluids/

 

2、isoCirc对人类转录组中的全长环状RNA同工型进行了分类。

标题:isoCirc catalogs full-length circular RNA isoforms in human transcriptomes.

杂志:Nat Commun;影响因子:12.121

通讯作者: 邢毅博士(宾夕法尼亚大学费城儿童医院)

环状RNA(circRNA)已经成为一类重要的功能RNA分子。短读长RNA测序(RNA-seq)是识别circRNA广泛使用的策略。但是,短读长RNA-seq的固有局限性在于它不能通过实验确定circRNA的全长序列和确切的外显子组成。在这里,研究者开发了isoCirc,一种用于测序全长circRNA亚型的策略,使用滚环扩增,然后进行纳米孔长读长测序,利用isoCirc数据分析流程可靠地表征全长circRNA亚型。使用isoCirc,作者生成了涵盖12种人类组织和一种人类细胞系(HEK293)的107,147个全长circRNA亚型的综合目录,其中包括40,628个长度≥500 nt的亚型,该研究确定了circRNAs内部内部广泛的可变剪接事件,包括720个保留的内含子事件,对应于一类外显子-内含子circRNA(EIciRNAs)。总的来说,isoCirc和伴随数据集为研究人类转录组中circRNA提供了有用的策略和资源。

图注:IsoCirc技术流程

3、circNDUFB2通过使IGF2BP不稳定并激活抗肿瘤免疫力来抑制非小细胞肺癌的进展。

标题:circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity.

杂志:Nat Commun;影响因子:12.121

通讯作者:覃文新研究员(上海仁济医院)和姜丽岩教授(上海市胸科医院)

环状RNA(circRNA)是一类共价闭合的单链RNA,与癌症发展相关。该研究确定circNDUFB2在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中被下调,并与NSCLC恶性特征负相关。升高的circNDUFB2可抑制NSCLC细胞的生长和转移。从机制上讲,circNDUFB2充当支架来增强TRIM25和IGF2BPs(肿瘤进展和转移的阳性调节剂)之间的相互作用。此TRIM25 / circNDUFB2 / IGF2BPs三元复合物促进IGF2BPs的泛素化和降解,并通过circNDUFB2的N6-甲基腺苷(m6A)修饰增强了这一作用。此外,RIG-I还识别circNDUFB2,以激活RIG-I-MAVS信号级联并将免疫细胞募集到肿瘤微环境(TME)中。因此,该研究数据提供了证据,表明circNDUFB2通过调节蛋白泛素化和降解以及细胞免疫应答,参与了NSCLC进展过程中IGF2BPs的降解和抗肿瘤免疫的激活。

图注:circNDUFB2抑制非小细胞肺癌进展的机制模式图

文献列表:

序号

主要内容

论文标题

杂志

影响因子

单位

1

蜜蜂的寄生螨Varroa中环状RNA的研究。

Investigation of circular RNAs in an ectoparasitic mite Varroa destructor (Acarina: Varroidae) of the honey bee.

Parasitol Res.

1.641

扬州大学动物科技学院等

2

血浆外泌体CircNEK9通过miR-409-3p/MAP7轴促进胃癌的进展。

Plasma Exosomal CircNEK9 Accelerates the Progression of Gastric Cancer via miR-409-3p/MAP7 Axis.

Dig Dis Sci.

2.751

北京301医院等

3

Circ_0004104通过调节miR-539-3p/RNF2轴来加速胃癌的进展。

Circ_0004104 Accelerates the Progression of Gastric Cancer by Regulating the miR-539-3p/RNF2 Axis.

Dig Dis Sci.

2.751

重庆三峡中心医院等

4

hsa_circ_0043278的表达下降及其与乳腺癌临床病理特征的关系。

The decreased expression of hsa_circ_0043278 and its relationship with clinicopathological features of breast cancer.

Gland Surg.

2.19

中国医科大学附属第一医院等

5

circRNAnov_circ_0005280的表达降低及其在非小细胞肺癌诊断中的临床价值。

Reduced expression of circRNA novel_circ_0005280 and its clinical value in the diagnosis of non-small cell lung cancer.

J Thorac Dis.

2.046

中国医科大学附属盛京医院等

6

环状SMO RNA编码的新型蛋白质对于Hedgehog信号激活和胶质母细胞瘤致瘤性至关重要。

A novel protein encoded by circular SMO RNA is essential for Hedgehog signaling activation and glioblastoma tumorigenicity.

Genome Biol.

10.806

中山大学附属第一医院等

7

敲低circRNA_0007534可以通过miR-206/GREM1轴抑制子宫颈癌的发生。

Knockdown of circRNA_0007534 suppresses the tumorigenesis of cervical cancer via miR-206/GREM1 axis.

Cancer Cell Int.

4.175

山东中医药大学等

8

多囊卵巢综合征中的非编码RNA:系统评价和荟萃分析。

Non-coding RNAs in polycystic ovary syndrome: a systematic review and meta-analysis.

Reprod Biol Endocrinol.Review

3.235

浙江省妇女医院等

9

青春期母猪发病时下丘脑环状RNA的鉴定。

Identification of Circular RNAs in Hypothalamus of Gilts during the Onset of Puberty.

Genes (Basel).

3.759

广东省实验动物监测所等

10

敲低cir_RNA PVT1可通过海绵化miR-152-3p增强胃癌顺铂的敏感性。

Knockdown of cir_RNA PVT1 Elevates Gastric Cancer Cisplatin Sensitivity via Sponging miR-152-3p.

J Surg Res.

1.841

山东东营市人民医院等

11

环状RNA circ_0020123通过miR-384/TRIM44轴促进非小细胞肺癌的进展。

Circular RNA circ_0020123 Promotes Non-Small Cell Lung Cancer Progression Through miR-384/TRIM44 Axis.

Cancer Manag Res.

2.886

临沂市人民医院等

12

Circ_0006404通过调节miR-1299/CFL2信号传导加速前列腺癌的进展。

Circ_0006404 Accelerates Prostate Cancer Progression Through Regulating miR-1299/CFL2 Signaling.

Onco Targets Ther.

3.337

郑州大学第一附属医院等

13

高度保守的环状RNA circRasGEF1B通过调节低等脊椎动物中的miR-21-3p/MITA途径增强抗病毒免疫性。

A Highly Conserved Circular RNA circRasGEF1B Enhances Antiviral Immunity by Regulating miR-21-3p/MITA Pathway in Lower Vertebrates.

J Virol.

4.501

上海海洋大学等

14

CircRNA hsa_circ_0030018通过调节miR-1297/RAB21轴来调节神经胶质瘤的发展。

CircRNA hsa_circ_0030018 regulates the development of glioma via regulating the miR-1297/RAB21 axis.

Neoplasma.

1.721

胶州市人民医院等

15

CRISPR-Cas9有效删除了多个环RNA基因座,揭示出Os06circ02797是水稻中OsMIR408的推定海绵。

Efficient deletion of multiple circle RNA loci by CRISPR-Cas9 reveals Os06circ02797 as a putative sponge for OsMIR408 in rice.

Plant Biotechnol J.

8.154

电子科技大学生命科学与技术学院等

16

LncRNA CCDC26与CELF2蛋白相互作用,通过circRNA_ANKIB1/miR-195-5p/PRR11轴增强髓样白血病细胞的增殖和侵袭。

LncRNA CCDC26 Interacts with CELF2 Protein to Enhance Myeloid Leukemia Cell Proliferation and Invasion via the circRNA_ANKIB1/miR-195-5p/PRR11 Axis.

Cell Transplant.

3.341

西安交通大学第一附属医院等

17

hsa_circ_0023409通过调节IRS4/PI3K/AKT途径加速胃癌细胞的生长和转移。

hsa_circ_0023409 Accelerates Gastric Cancer Cell Growth and Metastasis Through Regulating the IRS4/PI3K/AKT Pathway.

Cell Transplant.

3.341

吉林省肿瘤医院等

18

黄芪甲苷IV通过体外靶向AS细胞模型中的circ_0000231/miR-135a-5p/CLIC4轴减轻动脉粥样硬化。

Astragaloside IV alleviates atherosclerosis through targeting circ_0000231/miR-135a-5p/CLIC4 axis in AS cell model in vitro.

Mol Cell Biochem.

2.795

长春中医药大学附属医院等

19

CircRNA_0084043可作为竞争性内源RNA,通过刺激miR-153促进骨肉瘤的进展。

CircRNA_0084043 acts as a competitive endogenous RNA promotes osteosarcoma progression by sponging miR-153.

Minerva Med.

3.031

山东章丘区人民医院等

20

鉴定circ-FAM169A海绵miR-583参与了椎间盘退变的调节。

Identification of circ-FAM169A sponges miR-583 involved in the regulation of intervertebral disc degeneration.

J Orthop Translat.

3.986

天津医科大学总医院等

21

Circ_USP36/miR-182-5p/KLF5轴可调节ox-LDL诱导的人脐静脉平滑肌细胞损伤。

Circ_USP36/miR-182-5p/KLF5 axis regulates the ox-LDL-induced injury in human umbilical vein smooth muscle cells.

Am J Transl Res.

3.375

天津医科大学等

22

全髋关节置换术后无菌性松动的发病机制中circRNA表达模式和ceRNA网络。

circRNA expression pattern and ceRNA network in the pathogenesis of aseptic loosening after total hip arthroplasty.

Int J Med Sci.

2.523

河南省胸科医院等

23

克罗恩病中CircRNA_103765通过miR-30家族起促炎因子作用。

CircRNA_103765 acts as a proinflammatory factor via sponging miR-30 family in Crohn’s disease.

Sci Rep.

3.998

中国医科大学附属第一医院等

24

isoCirc对人类转录组中的全长环状RNA同工型进行了分类。

isoCirc catalogs full-length circular RNA isoforms in human transcriptomes.

Nat Commun.

12.121

苏州大学附属第一医院等

25

circNDUFB2通过使IGF2BP不稳定并激活抗肿瘤免疫力来抑制非小细胞肺癌的进展。

circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity.

Nat Commun.

12.121

宾夕法尼亚大学等

26

Hsa_circ_0005273通过调节YAP1-hippo信号通路促进乳腺癌的发生。

Hsa_circ_0005273 facilitates breast cancer tumorigenesis by regulating YAP1-hippo signaling pathway.

J Exp Clin Cancer Res.

7.068

上海仁济医院等

27

Hsa_circ_0123190作为竞争性内源RNA,通过在狼疮性肾炎中海绵化hsa-miR-483-3p来调节APLNR表达。

Hsa_circ_0123190 acts as a competitive endogenous RNA to regulate APLNR expression by sponging hsa-miR-483-3p in lupus nephritis.

Arthritis Res Ther.

4.103

上海第十人民医院等

28

环状RNA circ_0081001敲低可通过调节miR-494-3p/TGM2轴增强骨肉瘤细胞中甲氨蝶呤的敏感性。

Circular RNA circ_0081001 knockdown enhances methotrexate sensitivity in osteosarcoma cells by regulating miR-494-3p/TGM2 axis.

J Orthop Surg Res.

1.777

郑州大学第一附属医院等

29

环状RNA作为癌症中的生物标志物和治疗靶标。

Circular RNAs as Biomarkers and Therapeutic Targets in Cancer.

Semin Cancer Biol.

11.09

上虞市人民医院等

30

环状RNA circSlc7a11通过调节LLC-WRC 256细胞增殖和凋亡促进大鼠骨痛的发病机理。

The circular RNA circSlc7a11 promotes bone cancer pain pathogenesis in rats by modulating LLC-WRC 256 cell proliferation and apoptosis.

Mol Cell Biochem.

2.795

美国伯明翰大学等

31

利多卡因通过调节circ_ITCH/miR-421/CPEB3轴抑制肝癌的发展。

Lidocaine Inhibits Hepatocellular Carcinoma Development by Modulating circ_ITCH/miR-421/CPEB3 Axis.

Dig Dis Sci.

2.751

暨南大学附属第一医院等

32

环状RNA circZFR通过调节miR-375/HMGA2轴促进肝细胞癌的进展。

Circular RNA circZFR Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating miR-375/HMGA2 Axis.

Dig Dis Sci.

2.751

安徽省立医院等

33

环状RNA hsa_Circ_0005795通过海绵miR-1231介导皮肤基底细胞癌的细胞增殖。

Circular RNA hsa_Circ_0005795 mediates cell proliferation of cutaneous basal cell carcinoma via sponging miR-1231.

Arch Dermatol Res.

2.339

安徽省立医院等

34

深低温停循环后大鼠海马中环状RNA的差异表达谱。

Differential Expression Profiles of Circular RNAs in the Rat Hippocampus after Deep Hypothermic Circulatory Arrest.

Artif Organs.

2.259

北京协和医学院等

35

在绵羊中发现新的circRNA显示出较高的反向剪接连接保守性。

Novel circRNA discovery in sheep shows evidence of high backsplice junction conservation.

Sci Rep.

3.998

巴斯克大学等

36

CircRNA GFRA1通过调节miR-498/NAP1L3轴促进肝癌的进展。

CircRNA GFRA1 promotes hepatocellular carcinoma progression by modulating the miR-498/NAP1L3 axis.

Sci Rep.

3.998

河南省人民医院等

37

体液中的环状RNA作为癌症生物标记物:液体活检的新领域。

Circular RNAs in body fluids as cancer biomarkers: the new frontier of liquid biopsies.

Mol Cancer.Review

15.302

南京医科大学等

38

circPTPN22作为胃癌的生物标志物,通过EMT途径调节胃癌的进展。

As a biomarker for gastric cancer, circPTPN22 regulates the progression of gastric cancer through the EMT pathway.

Cancer Cell Int.

4.175

南通大学附属医院等

39

整合分析circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)肝脏中的热应激的响应。

Integrated analysis of the responses of a circRNA-miRNA-mRNA ceRNA network to heat stress in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) liver.

BMC Genomics.

3.594

甘肃农业大学等

40

癌症中非编码RNA的编辑和化学修饰:具有临床意义的新故事。

Editing and Chemical Modifications on Non-Coding RNAs in Cancer: A New Tale with Clinical Significance.

Int J Mol Sci.Review

4.556

德州大学安德森癌症中心等

41

环状RNA circ_0068,888通过海绵化microRNA-21-5p防止脂多糖诱导的HK-2细胞损伤。

Circular RNA circ_0068,888 protects against lipopolysaccharide-induced HK-2 cell injury via sponging microRNA-21-5p.

Biochem Biophys Res Commun.

2.985

哈尔滨医科大学附属第四医院等

42

骨肉瘤中环状RNA表达失调的诊断和预后意义。

Diagnostic and Prognostic Significance of Dysregulated Expression of Circular RNAs in Osteosarcoma.

Expert Rev Mol Diagn.

4.096

中南大学湘雅二医院等

43

CircRNA_25487通过将miR-134-3p插入p21来抑制创伤性股骨头坏死的骨修复。

CircRNA_25487 inhibits bone repair in trauma-induced osteonecrosis of femoral head by sponging miR-134-3p through p21.

Regen Ther.

2.286

洛阳市骨伤科医院等

44

CircHmbox1靶向miRNA-1247-5p参与绝经后骨质疏松症中TNF-α的骨代谢调控。

CircHmbox1 Targeting miRNA-1247-5p Is Involved in the Regulation of Bone Metabolism by TNF-伪 in Postmenopausal Osteoporosis.

Front Cell Dev Biol.

5.201

上海瑞金医院等

45

CircRNA_000864通过与miR-361-3p结合来上调B细胞易位基因2的表达并抑制胰腺癌细胞的迁移和侵袭。

CircRNA_000864 Upregulates B-cell Translocation Gene 2 Expression and Represses Migration and Invasion in Pancreatic Cancer Cells by Binding to miR-361-3p.

Front Oncol.

4.848

湖北医科大学等

46

环状RNA:具有多个方面来调节其亲本基因表达的重要角色。

Circular RNA: an important player with multiple facets to regulate its parental gene expression.

Mol Ther Nucleic Acids.Review

7.032

广东医科大学等

47

circDCUN1D4通过稳定TXNIP表达来抑制肺腺癌的肿瘤转移和糖酵解。

circDCUN1D4 suppresses tumor metastasis and glycolysis in lung adenocarcinoma by stabilizing TXNIP expression.

Mol Ther Nucleic Acids.

7.032

江苏省肿瘤医院等

48

CircMEG3通过降低人肝癌干细胞中的Cbf5来抑制端粒酶活性。

CircMEG3 inhibits telomerase activity by reducing Cbf5 in human liver cancer stem cells.

Mol Ther Nucleic Acids.

7.032

上海市普陀区人民医院等

49

circRNA circARNT2通过靶向miR-155-5p/PDK1轴来抑制肝癌细胞对顺铂的敏感性。

circRNA circARNT2 Suppressed the Sensitivity of Hepatocellular Carcinoma Cells to Cisplatin by Targeting the miR-155-5p/PDK1 Axis.

Mol Ther Nucleic Acids.

7.032

右江民族医学院等

50

环状RNA Circ_0000735使miR-502-5p海绵化,从而促进膀胱癌细胞的增殖和侵袭并抑制细胞凋亡。

Cyclic RNA Circ_0000735 sponges miR-502-5p to promote bladder cancer cell proliferation and invasion and inhibit apoptosis.

Int J Clin Exp Pathol.

0.252

湘南学院附属医院等

51

鉴定驴肌肉内脂肪含量的候选环状RNA。

Identification of Candidate Circular RNAs Underlying Intramuscular Fat Content in the Donkey.

Front Genet.

3.258

沈阳农业大学等

52

外周血中环状RNA hsa_Circ_0003391的鉴定可能与阿尔茨海默氏病有关。

Identification of Circular RNA hsa_Circ_0003391 in Peripheral Blood Is Potentially Associated With Alzheimer’s Disease.

Front Aging Neurosci.

4.362

中国医科大学等

53

circPHIP通过使miR-142-5p海绵化并调节PHIP和ACTN4表达来促进口腔鳞状细胞癌的进展。

circPHIP promotes oral squamous cell carcinoma progression by sponging miR-142-5p and regulating PHIP and ACTN4 expression.

Mol Ther Nucleic Acids.

7.032

北京大学深圳医院等

54

自噬在心血管疾病中的作用:非编码RNA的作用。

Autophagy in cardiovascular diseases: role of noncoding RNAs.

Mol Ther Nucleic Acids.Review

7.032

山东齐鲁医院等

55

通过机器学习在各种细胞环境中揭示circRNA表达的表观遗传因素。

Revealing Epigenetic Factors of circRNA Expression by Machine Learning in Various Cellular Contexts.

iScience.

4.447

海南医学院等

56

circRASGRF2通过充当miR-1224海绵,在肝细胞癌中起致癌基因的作用。

circRASGRF2 functions as an oncogenic gene in hepatocellular carcinoma by acting as a miR-1224 sponge.

Mol Ther Nucleic Acids.

7.032

南京鼓楼医院等

57

circEYA1充当miR-582-3p的海绵,通过上调CXCL14抑制宫颈腺癌的发生。

circEYA1 Functions as a Sponge of miR-582-3p to Suppress Cervical Adenocarcinoma Tumorigenesis via Upregulating CXCL14.

Mol Ther Nucleic Acids.

7.032

浙江省妇女医院等

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