欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索(收集最新发布的circRNA文献共计31篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

  1. NPInter v4.0:ncRNA互作数据库。

标题:NPInter v4.0: an integrated database of ncRNA interactions.

杂志:Nucleic Acids Res

影响因子:11.147

通讯作者:陈润生院士,何顺民研究员(中国科学院生物物理研究所)和赵屹研究员(中国科学院计算技术研究所)

非编码RNA(ncRNA)在多种生物信号通路中起着至关重要的调控作用。已有研究表明非编码RNA可以与蛋白、RNA以及基因组相互作用,调控复杂生物过程。陈润生院士课题组早在2006年发布了NPInter数据库,近日该数据库已更新至第4版,NPInter(NPInter v4.0)数据库系统地收录了绝大多数种类非编码RNA(新增circRNA)的相互作用,并对相互作用以及相关分子进行了详细的注释以及可视化,提供了一个全面、系统的非编码RNA相互作用的研究平台。环状RNA(circRNA)的相互作用和ChIRP-seq获得的非编码RNA-基因组的相互作用首次被收录进来。总数据量上升到11万条,涵盖了35个物种。相互作用以及作用分子还增加了疾病注释,可帮助研究者更好地理解相互作用的功能。除了整合数据之外,整个数据库的网站也进行了重新构建,提高了原有搜索模块的易用性。数据库网址为:http://bigdata.ibp.ac.cn/npinter4

图注:NPInter v4.0数据库首页

  1. Circ-AKT3通过调控miR-296-3p / E-cadherin信号抑制透明细胞肾细胞癌的转移。

标题:Circ-AKT3 inhibits clear cell renal cell carcinoma metastasis via altering miR-296-3p/E-cadherin signals.

杂志:Mol Cancer

影响因子:10.679

通讯作者:李恭会和liqun xia(浙江大学医学院附属邵逸夫医院)

目前很少报道circRNA在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的作用。该研究中,作者使用环状RNA微阵列芯片在ccRCC中筛选到circ-AKT3显著低表达。然后,在60 ccRCC组织和邻近正常组织以及ccRCC细胞系和人正常肾细胞(HK-2)之间应用qPCR进一步验证了circ-AKT3的表达。通过体外和体内实验结果表明,circ-AKT3在ccRCC中显著下调。敲低circ-AKT3促进了ccRCC的迁移和侵袭,而circ-AKT3的过表达抑制了ccRCC的转移。此外,circ-AKT3通过circ-AKT3 / miR-296-3p / E-cadherin轴抑制ccRCC转移。最终结论表明,Circ-AKT3通过竞争性结合miR-296-3p促进E-cadherin表达来抑制ccRCC转移。因此,Circ-AKT3可以作为一种更好地抑制ccRCC转移新型疗法靶标。

图注: circ-AKT3抑制透明细胞肾细胞癌转移的机制示意图

  1. CircMYO10通过调控miR-370-3p/RUVBL1轴对染色质重塑的影响增强β-catenin/LEF1复合物的转录活性,进而促进骨肉瘤的进展。

标题:CircMYO10 promotes osteosarcoma progression by regulating miR-370-3p/RUVBL1 axis to enhance the transcriptional activity of β-catenin/LEF1 complex via effects on chromatin remodeling.

杂志:Mol Cancer

影响因子:10.679

通讯作者:沈舒滢 和 方向前(浙江大学医学院附属邵逸夫医院)

CircMYO10是由基因MYO10反向剪接产生的环状RNA,在骨肉瘤细胞系中表达上调,但其在骨肉瘤中的功能作用和机制仍然未知。该研究旨在阐明circMYO10在骨肉瘤中的作用机制。研究者首先通过qPCR评估了10对配对的骨肉瘤和软骨瘤组织中CircMYO10的表达。围绕两个关键特征增殖和内皮-间质转化(EMT)评估了circMYO10 / miR-370-3p / RUVBL1轴的功能。结果显示,在骨肉瘤细胞系和人骨肉瘤样品中,CircMYO10显著上调,而miR-370-3p被下调。在体内和体外沉默circMYO10可抑制细胞增殖和EMT。机理研究表明,miR-370-3p直接靶向RUVBL1,并抑制RUVBL1与β-catenin/ LEF1复合物之间的相互作用,而circMYO10通过抑制miR-370-3p表现出相反的作用。进一步研究发现RUVBL1与染色质重塑和组蛋白修饰因子TIP60和淋巴增强因子-1(LEF1)结合,以促进基因C-myc启动子区域附近的组蛋白H4K16乙酰化(H4K16Ac)。染色质免疫沉淀法显示,miR-370-3p可在指定区域促进H4K16Ac的表达,部分被RUVBL1小发夹RNA(shRNA)抵消,而circMYO10通过抑制miR-370-3p表现出相反的结果。miR-370-3p海绵吸附或ShRUVBL1敲低减弱了骨肉瘤细胞系中circMYO10诱导的表型。在通过抑制circMYO10后,MiR-370-3p抑制Wnt /β-catenin信号作用在体外和体内都消除了对骨肉瘤细胞增殖,EMT的抑制作用。因此,该研究结论得出CircMYO10通过调控miR-370-3p / RUVBL1轴增强β-catenin/ LEF1复合物的转录活性调控染色质重塑来促进骨肉瘤进展,这表明circMYO10可能是骨肉瘤治疗的潜在治疗靶点。

图注:circMYO10/miR-370-3p/RUVBL1调控模式图

参考文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 NPInter v4.0:ncRNA互作数据库。 NPInter v4.0: an integrated database of ncRNA interactions. Nucleic Acids Res 11.147 中国科学院生物物理研究所
2 Circ-AKT3通过改变miR-296-3p / E-cadherin信号抑制透明细胞肾细胞癌的转移。 Circ-AKT3 inhibits clear cell renal cell carcinoma metastasis via altering miR-296-3p/E-cadherin signals. Mol Cancer 10.679 浙江大学医学院附属邵逸夫医院
3 CircMYO10通过调控miR-370-3p/RUVBL1轴对染色质重塑的影响增强β-catenin/LEF1复合物的转录活性,进而促进骨肉瘤的进展。 CircMYO10 promotes osteosarcoma progression by regulating miR-370-3p/RUVBL1 axis to enhance the transcriptional activity of β-catenin/LEF1 complex via effects on chromatin remodeling. Mol Cancer 10.679 浙江大学医学院附属邵逸夫医院
4 microRNA和长非编码RNA在肝细胞癌耐药中的新兴作用。 The emerging role of microRNAs and long noncoding RNAs in drug resistance of hepatocellular carcinoma. Mol Cancer 10.679 山东第一医科大学等
5 CircRNA:胃癌的后起之秀。 CircRNA: a rising star in gastric cancer. Cell Mol Life Sci 7.014 江苏大学澳洋肿瘤研究院等
6 环状RNA circPICALM使miR-1265具有抑制膀胱癌转移并影响FAK磷酸化的功能。 Circular RNA circPICALM sponges miR-1265 to inhibit bladder cancer metastasis and influence FAK phosphorylation. EBioMedicine 6.68 中山大学中山纪念医院
7 CircWHSC1通过调节miR-145和miR-1182的含量来调节MUC1和hTERT,从而促进卵巢癌的进展。 CircWHSC1 promotes ovarian cancer progression by regulating MUC1 and hTERT through sponging miR-145 and miR-1182. J Exp Clin Cancer Res 5.646 广州医科大学附属第三医院等
8 外泌体circRNAs:胆管癌领域的新参与者。 Exosomal circRNAs: new players in the field of cholangiocarcinoma. Clin Sci (Lond) 5.237 法国国家健康与医学研究院
9 社论:长非编码RNA和免疫力。 Editorial: Long Non-coding RNAs and Immunity. Front Immunol 4.716 康涅狄格大学健康中心等
10 环状RNA USP1通过miR-194-5p/FLI1轴调节血液肿瘤屏障的通透性。 Circular RNA USP1 regulates the permeability of blood-tumour barrier via miR-194-5p/FLI1 axis. J Cell Mol Med 4.658 中国医科大学生命科学学院等
11 GMEC中circ-016910海绵吸附miR-574-5p通过MAPK和PI3K /AKT-mTOR途径来调节细胞生理和牛奶合成。 circ-016910 sponges miR-574-5p to regulate cell physiology and milk synthesis via MAPK and PI3K/AKT-mTOR pathways in GMECs. J Cell Physiol 4.522 西北农林科技大学
12 (综述)CircRNA:从默默无闻到调控癌症基因表达的新型调节剂。 CircRNAs: From anonymity to novel regulators of gene expression in cancer (Review). Int J Oncol 3.571 利兹大学生物科学学院
13 CircCode:鉴定circRNA编码能力的有力工具。 CircCode: A Powerful Tool for Identifying circRNA Coding Ability. Front Genet 3.517 陕西师范大学
14 沉默环状RNA hsa_circ_0004491促进口腔鳞状细胞癌的转移。 Silencing circular RNA hsa_circ_0004491 promotes metastasis of oral squamous cell carcinoma. Life Sci 3.448 北京大学深圳医院
15 Circ_0076305海绵吸附miR-296-5p,通过正向调节STAT3来调控非小细胞肺癌对顺铂的耐药性。 Circ_0076305 regulates cisplatin resistance of non-small cell lung cancer via positively modulating STAT3 by sponging miR-296-5p. Life Sci 3.448 西安交通大学附属第二医院
16 早期肺腺癌血浆外泌体中环状RNA的表达谱及潜在的生物标志物。 Circular RNAs expression profiles in plasma exosomes from early-stage lung adenocarcinoma and the potential biomarkers. J Cell Biochem 3.448 福建省立医院
17 异常表达的环状RNA作为肝细胞癌的新型非侵入性生物标记物:一项荟萃分析。 Abnormally expressed circular RNAs as novel non-invasive biomarkers for hepatocellular carcinoma: A meta-analysis. World J Gastrointest Oncol 2.758 河南科技大学附属第一医院
18 环状RNA circ_0067934通过靶向CSF1,在神经胶质瘤中作为癌基因起作用。 Circular RNA circ_0067934 functions as an oncogene in glioma by targeting CSF1. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 北华大学附属医院
19 新型环状RNA hsa-circ-0000211通过海绵吸附hsa-miR-622,调节HIF1-α的表达促进肺腺癌的迁移和侵袭。 A novel circular RNA, hsa-circ-0000211, promotes lung adenocarcinoma migration and invasion through sponging of hsa-miR-622 and modulating HIF1-α expression. Biochem Biophys Res Commun 2.705 南京医科大学附属肿瘤医院等
20 Hsa_circ_0001546充当miRNA-421海绵,通过ATM /Chk2/p53依赖性途径抑制胃癌细胞的化学耐药性。 Hsa_circ_0001546 acts as a miRNA-421 sponge to inhibit the chemoresistance of gastric cancer cells via ATM/Chk2/p53-dependent pathway. Biochem Biophys Res Commun 2.705 山东大学第二医院
21 Circ-EZH2敲低通过miR-1265海绵活性逆转DDAH1和CBX3介导的胶质瘤细胞生长和侵袭。 Circ-EZH2 Knockdown Reverses DDAH1 and CBX3-Mediated Cell Growth and Invasion in Glioma through miR-1265 Sponge Activity. Gene 2.638 齐齐哈尔医学院第三附属医院
22 下一代测序表明,hsa_circ_0058092是胃癌中潜在的癌基因。 Next-generation sequencing reveals hsa_circ_0058092 being a potential oncogene candidate involved in gastric cancer. Gene 2.638 江苏大学附属人民医院
23 血浆环状RNA panel可作为结直肠癌的新型诊断生物标志物。 Plasma circular RNA panel acts as a novel diagnostic biomarker for colorectal cancer. Clin Biochem 2.43 重庆医科大学等
24 Circ_ANKIB1稳定了SOCS3/STAT3通路上miR-19b的调控,从而促进骨肉瘤细胞的生长和侵袭。 Circ_ANKIB1 stabilizes the regulation of miR-19b on SOCS3/STAT3 pathway to promote osteosarcoma cell growth and invasion. Hum Cell 2.333 台州市第一人民医院
25 对乳腺癌分子生物标志物的多尺度整体看法。 Toward a holistic view of multiscale breast cancer molecular biomarkers. Biomark Med 2.268 无锡市人民医院
26 鉴定沙眼衣原体感染的HeLa细胞中差异表达的环状RNA。 Identification of differentially-expressed circular RNAs in HeLa cells infected with Chlamydia trachomatis. Pathog Dis 2.182 天津医科大学总医院
27 检测5-circRNA标记以改善胃癌的预后预测。 Detection of a 5-circRNA signature to improve prognostic prediction in gastric cancer. J Investig Med 1.994 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院
28 电针刺激疗法对糖尿病小鼠血浆外泌体中circRNA的影响的测定:一种RNA测序方法。 Determination of Electroacupuncture Effects on circRNAs in Plasma Exosomes in Diabetic Mice: An RNA-Sequencing Approach. Evid Based Complement Alternat Med 1.984 上海中医药大学
29 环状RNA:从生物形成,功能到疾病。 Circular RNAs: from biogenesis and function to diseases. Chin Med J (Engl) 1.555 西华师范大学环境科学与工程学院
30 EB病毒circRNAome作为宿主miRNA海绵调节病毒感染,细胞周期和肿瘤发生。 Epstein-Barr virus circRNAome as host miRNA sponge regulates virus infection, cell cycle, and oncogenesis. Bioengineered 1.544 天津市第一中心医院
31 肛门鳞状细胞癌中环化E7 RNA,GLUT1和PD-L1的评估。 Assessment of circularized E7 RNA, GLUT1, and PD-L1 in anal squamous cell carcinoma. Oncotarget Not Found 美国UT西南医学中心

 

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