欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献25篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。
- 一种新型环状RNA适体自剪切高效表达体系
论文标题：Highly efficient expression of circular RNA aptamers in cells using autocatalytic transcripts
杂志：Nat Biotechnol. 影响因子：35.724
通讯作者单位：洛克菲勒大学
该研究开发了一种新型的基于核酶（Ribosome）自剪切作用的环状RNA过表达体系，可高效过表达环状RNA分子。该环状RNA表达体系被命名为“Tornado”， 该技术是基于具有自剪切功能的核酶（Ribosome）实现待环化序列的上下游切割，环化作用则借助于内源的RNA连接酶RtcB实现，最终的产物包含了待环化序列以及为实现环化而携带的Ligated stem序列（racRNA）。Tornado环状RNA过表达体系具有自动剪切，自动环化，表达高效且可实现适体体内过表达的优点，为环状RNA的过表达开辟了新途径。该研究详细解读请看荐读 | 新型环状RNA表达载体
图注：Tornado环状RNA过表达载体的线性序列组成图
2、超级增强子调控的circNfix缺失可诱导成年小鼠心肌梗死后心脏再生
论文标题：Loss of Super-Enhancer-Regulated CircRNA Nfix Induces Cardiac Regeneration After Myocardial Infarction in Adult Mice
杂志：Circulation 影响因子：18.88
通讯作者单位：南方医科大学南方医院
超级增强子（Super Enhancer, SE) 为8—20 kb具有转录增强活性的超长顺式作用元件，可富集高密度的关键转录因子(master transcription factors)、辅因子(cofactor)和增强子表观修饰标记(histone modification marks)，是一组强大的调控因子。超级增强子控制着关键基因的表达赋予各种细胞独特属性和功能，不仅控制健康细胞而且在细胞病变调控中发挥重要作用。该研究鉴定出与心脏再生相关的circRNA—circNfix，转录因子Meis1可结合在circNifx的超级增强子上，促进circNifx的高表达；circNifx表达下调可以促进心肌细胞的增殖和血管生成，而抑制心肌梗死后心肌细胞的凋亡，从而改善心肌功能和预后。机制上，circNfix增强Ybx1与Nedd41的结合，诱导Ybx1的泛素化降解，抑制cyclin A2和cyclin B1表达；另一方面circNfix可吸附miR-214，促进其靶基因Gsk3β的表达，而抑制β-catenin的活性。该研究为改善心肌梗死后心肌功能和预后提供了新的靶点和治疗策略。该研究详细解读请看Circulation | CircNfix可削弱心脏再生的能力
图注：circNfix减弱小鼠心肌梗死后心脏再生的作用机制示意图
3、通过m6a介导RNase P/MRP复合体降解靶RNA分子的新机制
论文标题：Endoribonucleolytic Cleavage of m6A-Containing RNAs by RNase P/MRP Complex
杂志：Mol Cell. 影响因子： 14.248
通讯作者单位：韩国高丽大学
circRNA降解机制方面的研究一直不多，但对认识circRNA的功能机制至关重要。该研究发现了一种新的m6a介导的RNA降解机制，m6A识别蛋白YTHDF2结合靶分子，并募集HRSP12，进而介导RNA内切核酸酶RNase P/MRP复合物切割靶分子，这种降解模式不单适用于mRNA，对circRNA同样有效。YTHDF2，HRSP12和POP1参与m6A介导的RNA降解过程，其中YTHDF2的N端100aa是介导其与YTHDF2相互作用及m6A介导的RNA降解作用的关键区域，研究者进一步验证出circRNA分子可以通过YTHDF2- HRSP12介导的RNase P/MRP复合物结合并降解，该研究对于circRNA表达和降解动态变化相关的机制认识具有重要参考意义。该研究详细解读请看荐读 | m6A介导mRNA和circRNA降解
图注：YTHDF2，HRSP12和RNase P/MRP参与m6A介导的RNA降解过程
4、circFOXP1环状RNA通过抑制microRNA维持间充质干细胞的特性
论文标题：FOXP1 circular RNA sustains mesenchymal stem cell identity via microRNA inhibition
杂志：Nucleic Acids Res. 影响因子： 11.561
通讯作者单位：加州大学洛杉矶分校
干细胞特性的维持和分化涉及多种调控基因和复杂信号通路，也包括非编码RNA。环状RNA (circRNAs)是一类通过反剪接从编码蛋白质的基因中产生的RNA，其结构稳定，没有游离的5’端和3’端。目前对环状RNA在干细胞中的作用机制知之甚少。在该研究中，研究者首次确定了circRNA控制间充质干细胞(MSC)的特征和分化。来自不同组织的间充质干细胞circRNA高通量测序获得大量差异表达的环状RNA。其中，与分化的中胚层衍生物相比，间充质干细胞中含有丰富的circFOXP1。沉默circFOXP1的在体外和体内均显著影响MSC的分化。此外，研究者发现circFOXP1与miR-17-3p/miR-127-5p之间的直接相互作用，调控非典型Wnt和EGFR通路。骨髓间充质干细胞多能性的重编程过程中， circFOXP1和非典型Wnt下调，而典型Wnt成分则增加。在从人类多能干细胞中产生间充质干细胞的过程中观察到了相反的效果。该研究成果为circFOXP1作为干细胞分子网络的关键调控作用提供了关键证据。
图注：circFOXP1在间充质干细胞转换多潜能干细胞过程中与wnt信号通路的动态变化示意图
参考文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | 一种新型环状RNA适体自剪切高效表达体系 | Highly efficient expression of circular RNA aptamers in cells using autocatalytic transcripts | Nat Biotechnol. | 35.724 | 洛克菲勒大学 |
| 2 | 超增强子调控的环状rna Nfix缺失可诱导成年小鼠心肌梗死后心脏再生 | Loss of Super-Enhancer-Regulated CircRNA Nfix Induces Cardiac Regeneration After Myocardial Infarction in Adult Mice | Circulation | 18.88 | 南方医科大学南方医院 |
| 3 | 心血管研究新篇章circRNA | Circular RNAs open a new chapter in cardiovascular biology | Nat Rev Cardiol. | 15.162 | 阿姆斯特丹大学 |
| 4 | 通过m6a介导RNase P/MRP复合体降解靶RNA分子的新机制 | Endoribonucleolytic Cleavage of m6A-Containing RNAs by RNase P/MRP Complex | Mol Cell. | 14.248 | 韩国高丽大学 |
| 5 | circFOXP1环状RNA通过抑制microRNA维持间充质干细胞的特性 | FOXP1 circular RNA sustains mesenchymal stem cell identity via microRNA inhibition | Nucleic Acids Res. | 11.561 | 加州大学洛杉矶分校 |
| 6 | 环状RNA——cPWWP2A减轻糖尿病视网膜血管功能障碍的研究 | Targeting pericyte-endothelial cell crosstalk by circular RNA-cPWWP2A inhibition aggravates diabetes-induced microvascular dysfunction | Proc Natl Acad Sci U S A. | 9.504 | 复旦大学上海医学院 |
| 7 | 环状RNA circTADA2A通过吸附miR-203a-3p并调控CREB3的表达，促进骨肉瘤的进展和转移 | Circular RNA circTADA2A promotes osteosarcoma progression and metastasis by sponging miR-203a-3p and regulating CREB3 expression | Mol Cancer. | 7.776 | 浙江大学医学院 |
| 8 | 环状RNA AKT3通过抑制miR-198上调PIK3R1，增强胃癌顺铂耐药 | Circular RNA AKT3 upregulates PIK3R1 to enhance cisplatin resistance in gastric cancer via miR-198 suppression | Mol Cancer. | 7.776 | 南京医科大学第一附属医院 |
| 9 | 疱疹病毒中circRNA研究进展 | Gammaherpesvirus RNAs Come Full Circle | MBio. | 6.689 | 杜兰大学医学院 |
| 10 | 葡萄环状rna的鉴定和克隆鉴定了葡萄抗寒性相关的Vv-circATS1 | Characterization and cloning of grape circular RNAs identified the cold resistance-related Vv-circATS1 | Plant Physiol. | 5.949 | 上海交通大学 |
| 11 | 高表达环状RNA circ_0005230通过海绵miR-1238和miR-1299在胆管癌中促进细胞生长和转移 | Elevation of circular RNA circ_0005230 facilitates cell growth and metastasis via sponging miR-1238 and miR-1299 in cholangiocarcinoma | Aging (Albany NY) | 5.179 | 哈尔滨医科大学 |
| 12 | 多囊卵巢综合征患者卵丘细胞环状RNA表达谱的研究 | Characterization of circular RNA expression profiles in cumulus cells from patients with polycystic ovary syndrome | Fertil Steril. | 4.803 | 复旦大学中山医院 |
| 13 | 发夹状核酶变异的RNA重组和剪接工程 | Engineering of hairpin ribozyme variants for RNA recombination and splicing | Ann N Y Acad Sci. | 4.277 | 格赖夫斯瓦尔德大学 |
| 14 | 抑制circHIPK3可通过吸附miR-29b-3p抑制血管紧张素ii诱导的心肌纤维化 | Inhibition of circHIPK3 prevents angiotensin II-induced cardiac fibrosis by sponging miR-29b-3p | Int J Cardiol. | 4.034 | 上海交通大学医学院 |
| 15 | circFNDC3B通过调节E-cadherin和CD44的表达，促进胃癌细胞的迁移和侵袭 | FNDC3B circular RNA promotes the migration and invasion of gastric cancer cells via the regulation of E-cadherin and CD44 expression | J Cell Physiol. | 3.923 | 厦门大学中山医院 |
| 16 | 环状RNA circ_0026134通过吸附miR-1256和miR-1287调控非小细胞肺癌细胞的增殖和侵袭 | Circular RNA circ_0026134 regulates non-small cell lung cancer cell proliferation and invasion via sponging miR-1256 and miR-1287 | Biomed Pharmacother. | 3.457 | 黑龙江省绥化市第一医院 |
| 17 | circ-MTO1/miR-17/QKI-5调控通路抑制肺腺癌的增殖 | A regulatory circuit of circ-MTO1/miR-17/QKI-5 inhibits the proliferation of lung adenocarcinoma | Cancer Biol Ther. | 3.373 | 河南胸科医院 |
| 18 | circRNA和胃肠道癌症 | circRNA and gastrointestinal cancer | J Cell Biochem. | 2.959 | 广州医科大学附属第六医院 |
| 19 | 沉默hsa_circ_0004771通过靶向ZEB2信号通路激活miR-653，抑制乳腺癌细胞增殖，诱导细胞凋亡 | Silencing of hsa_circ_0004771 inhibits proliferation and induces apoptosis in breast cancer through activation of miR-653 by targeting ZEB2 signaling pathway | Biosci Rep. | 2.899 | 湖北省肿瘤医院 |
| 20 | 环状RNA circ-FOXM1通过海绵样吸附miR-1304-5p作用于非小细胞肺癌进展 | Circular RNA circ-FOXM1 facilitates cell progression as ceRNA to target PPDPF and MACC1 by sponging miR-1304-5p in non-small cell lung cancer | Biochem Biophys Res Commun. | 2.559 | 齐齐哈尔医科大学第三附属医院 |
| 21 | 上调的环状RNA circ_0070934通过海绵样吸附miR-1238和miR-1247-5p促进皮肤鳞状细胞癌细胞的生长和侵袭 | Upregulated circular RNA circ_0070934 facilitates cutaneous squamous cell carcinoma cell growth and invasion by sponging miR-1238 and miR-1247-5p | Biochem Biophys Res Commun. | 2.559 | 黑龙江省医院 |
| 22 | RNA测序揭示amp活化蛋白激酶信号在小鼠心肌缺血再灌注损伤中的作用 | RNA sequencing revealing the role of AMP-activated protein kinase signaling in mice myocardial ischemia reperfusion injury | Gene. | 2.498 | 温州医科大学 |
| 23 | 参与调控小麦根系长度的环状rna的鉴定与表征 | Identification and characterization of CircRNAs involved in the regulation of wheat root length | Biol Res. | 2.357 | 河南农业大学 |
| 24 | 多囊卵巢综合征育龄妇女颗粒细胞的环状RNA表达谱 | Circular RNA expression profiling of granulosa cells in women of reproductive age with polycystic ovary syndrome | Arch Gynecol Obstet. | 2.236 | 广州医科大学附属第一医院 |
| 25 | 多囊卵巢综合征患者卵丘细胞中环状RNA的表达 | Novel circular RNA expression in the cumulus cells of patients with polycystic ovary syndrome | Arch Gynecol Obstet. | 2.236 | 青岛大学医学院 |