六月份pumed收录circRNA文献共计24篇,主要集中在医学相关的研究领域。下面我们一起来了解相关研究内容。

1、哺乳动物大脑中非编码RNA调控网络研究

论文标题:A Network of Noncoding Regulatory RNAs Acts in the Mammalian Brain

杂志:Cell 影响因子:31.189

通讯作者单位:剑桥 霍华德•休斯医学研究所

来自剑桥大学霍华德•休斯医学研究所的研究者们,在小鼠大脑模型中发现了一个非常有趣的ncRNA调控网络,该ncRNA调控网络主要由lncRNA(cyrano),circRNA(cdr1as)和两个miRNAs(miR-7,miR-671)组成,四种分子间通过精细复杂的互调控,准确控制cdr1as在脑部的含量,位置脑部神经系统的正常发育。长链非编码RNA-cyrano通常在脑部发育过程中高表达,研究者发现cyrano上存在很强的miR-7结合位点,可以有效抑制miR-7的表达,从而释放miR-7下游靶基因的表达,其中包括circRNA,cdr1as分子,高表达的cyrano分子可以促进cdr1as在脑补的有效富集,维持脑部正常功能。若在cyrano敲除小鼠中,miR-7含量升高后,cdr1as快速被miR-671降解,含量降低。进一步研究表明,miR-7可增强miR-671结合降解cdr1as的作用,其中miR-7和miR-671的结合位点不少重合,可能miR-7的介入,从空间或募集RISC诱导沉默复合体的能力加强,进一步加速cdr1as的降解。

图1:Cyrano,miR-7,miR-671和Cdr1as在哺乳动物大脑中精细调控模型

论文标题:Novel insight into circular RNA HECTD1 in astrocyte activation via autophagy by targeting MIR142-TIPARP: Implications for cerebral ischemic stroke

2、环状RNA HECTD1在星形胶质细胞通靶向MIR142-TIPARP激活自噬通路及其对脑缺血性中风的影响

杂志:Autophagy 影响因子11.1

通讯作者单位:东南大学

该文为东南大学的姚红红教授团队在Autophagy自噬杂志上又一篇circRNA在自噬方面的力作。该研究主要关注中风疾病中circRNA的作用,circRNA在各种生理和病理过程中发挥重要作用,但在中风疾病中研究并不多,研究人员首先通过circRNA芯片技术在中风小鼠模型-短暂性大脑中动脉闭塞缺血性脑组织中发现环状RNA circHECTD1显著高表达,同时在AIS中风病人的血浆样本得到证实。敲低circHectd1表达后,可明显减少中风小鼠模型的脑梗塞区域,减少神经毒性以及改善星形胶质细胞,进一步分子机制研究表明,circHECTD1可以通过miRNA海绵作用竞争性吸附miRNA-142,抑制miRNA-142的活性,导致TIPARP(TCDD诱导型聚[ADP-核糖]聚合酶)表达的抑制,随后通过巨自噬/自噬抑制星形胶质细胞活化。研究结果表明,circHECTD1及其偶联机制参与脑缺血中风过程,circHECTD1可以作为中风的新型生物标志物和治疗靶标。

图:circHECTD1通过miR142-TIPARP抑制脑部星形胶质细胞自噬过程的机制示意图

3、环状RNA circZNF609通过竞争性吸附miR-615调控视网膜神经退化

论文标题:Circular RNA-ZNF609 regulates retinal neurodegeneration by acting as miR-615 sponge

杂志:Theranostics 影响因子:8.537

通讯作者单位:复旦大学附属眼耳鼻喉科医院

以渐进性视网膜神经变性导致的视力损伤是青光眼形成的主要原因。环状RNA是一类内源性RNA,可调节真核生物中的基因表达。该研究中,研究者调查了cZNF609在视网膜神经变性诱导的青光眼中的作用。方法:qRT-PCR和Sanger测序法检测cZNF609在视网膜神经变性过程中的表达模式。免疫荧光染色检测cZNF609沉默对体内视网膜神经变性的影响。 MTT法,Ki67染色法和PI染色法检测cZNF609沉默对视网膜胶质细胞的影响及体外RGC功能。生物信息学分析,RNApulldown实验测定揭示cZNF609介导的视网膜神经变性的机制。结果:cZNF609表达在视网膜神经变性过程中显着上调。 cZNF609沉默减少了视网膜反应性神经胶质细胞增生和神经胶质细胞活化,并促进了RGC(视网膜神经节细胞)在体内的存活。 cZNF609沉默直接调节Müller细胞功能,但间接调节RGC功能。 cZNF609内源性吸附miR-615,起到隔离和抑制miR-615活性的作用,导致METRN增加。 METRN过表达可部分挽救cZNF609沉默介导的对视网膜神经胶质细胞增殖的抑制作用。结论:干预cZNF609表达是视网膜神经变性的一种有前途的治疗策略。

4、CircITGA7通过ras通路上调宿主基因ITGA7抑制结肠癌增殖和转移

论文标题: Circular RNA circITGA7 inhibits colorectal cancer growth and metastasis by modulating the Ras pathway and upregulating transcription of its host gene ITGA7

杂志:J Pathol 影响因子:6.253

通讯作者单位:南方医科大学

环状RNA(circRNA)在各种癌症类型中显着失调。然而,circRNA在癌症中的作用和机制在很大程度上仍然未知。在这项研究中,研究者发现了一种新的circRNA(circITGA7)分子及其线性宿主基因ITGA7在结肠直肠癌(CRC)组织和细胞系都显著下调。circITGA7低表达水平与CRC进展相关。功能测定表明,异位过表达circITGA7在体外和体内实验中可显著抑制CRC细胞的生长和转移。敲减circITGA7或ITGA7可促进CRC细胞的增殖和迁移。机制研究中,通过RNA-seq的和KEGG富集分析表明,circITGA7是RAS通路的负调节信号,ITGA7与细胞因子相关的信号途径有关。此外,circITGA7结合的miR-370-3p,上调miR-370-3P靶基因NF1,这是Ras通路的公认的负调节剂的抑制,因此,circITGA7通过Ras途径抑制RREB1来上调ITGA7的转录。研究结果表明circITGA7和ITGA7在CRC的抑制的作用,揭示了circITGA7通过抑制Ras信号通路,促进ITGA7的转录,这表明circITGA7可抑制CRC细胞增殖和转移是CRC治疗的潜在靶点。

文献列表

序号 论文标题 杂志 IF 单位
1
A Network of Noncoding Regulatory RNAs Acts in the Mammalian Brain

哺乳动物大脑中非编码RNA调控网络研究

Cell 31.189 剑桥 霍华德•休斯医学研究所
2 Novel insight into circular RNA HECTD1 in astrocyte activation via autophagy by targeting MIR142-TIPARP: Implications for cerebral ischemic stroke

环状RNA HECTD1在星形胶质细胞通靶向MIR142-TIPARP激活自噬通路及其对脑缺血性中风的影响

Autophagy 11.1 东南大学
3 Circular RNA-ZNF609 regulates retinal neurodegeneration by acting as miR-615 sponge

环状RNA circZNF609通过竞争性吸附miR-615调控视网膜神经退化

Theranostics 8.537 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
4 Circular RNA circITGA7 inhibits colorectal cancer growth and metastasis by modulating the Ras pathway and upregulating transcription of its host gene ITGA7

CircITGA7通过ras通路上调宿主基因ITGA7抑制结肠癌增殖和转移

J Pathol 6.253 南方医科大学
5
circFGFR4 Promotes Differentiation of Myoblasts via Binding miR-107 to Relieve Its Inhibition of Wnt3a

circFGFR4通过miR-107,Wnt3a途径促进成肌细胞分化

Mol Ther Nucleic Acids 5.66 西北农林科技大学
6 Genome-Wide Identification of Circular RNAs as a Novel Class of Putative Biomarkers for an Ocular Surface Disease

高通量测序考察circRNA是眼表疾病潜在标志物

Cell Physiol Biochem 5.5 南京医科大学附属眼科医院
7 Whole-Transcriptome Analysis of CD133+CD144+ Cancer Stem Cells Derived from Human Laryngeal Squamous Cell Carcinoma Cells

全转录组分析喉鳞状细胞癌细胞起源的CD133+CD144+肿瘤干细胞

Cell Physiol Biochem 5.5 山西医科大学
8 CircIBTK inhibits DNA demethylation and activation of AKT signaling pathway via miR-29b in peripheral blood mononuclear cells in systemic lupus erythematosus

全身性红斑狼疮的周围血单核细胞中,CircIBTK通过miR-29b激活AKT信号通路抑制DNA去甲基化

Arthritis Res Ther 4.269 上海交通大学医学院
9 Differential expression profile of hepatic circular RNAs in chronic hepatitis B

慢性乙型肝炎中circRNA表达谱研究

J Viral Hepat. 4.237 云南省第二人民医院

10
Association of microRNA-7 and its binding partner CDR1-AS with the prognosis and prediction of 1st-line tamoxifen therapy in breast cancer Sci Rep 4.122 伊拉斯姆斯大学医学中心
11 Re-analysis of long non-coding RNAs and prediction of circRNAs reveal their novel roles in susceptible tomato following TYLCV infection

TYLCV感染的番茄中对lncRNA重分析反映circRNA的新功能角色

BMC Plant Biol 3.93 江苏省农业科学院
12 Circular RNA hsa_circ_0016788 regulates hepatocellular carcinoma tumorigenesis through miR-486/CDK4 pathway

hsa_circ_0016788通过miR-486/CDK4通路调控肝癌形成

J Cell Physiol 3.923 西安交通大学第一附属医院
13
Circular RNA Signature Predicts Gemcitabine Resistance of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

环状RNA对胰腺导管腺癌的吉西他滨耐药性的预测作用研究

Front Pharmacol 3.831 山东大学医学院
14 Circular RNAs in hepatocellular carcinoma: Functions and implications

肝癌中circRNA研究进展综述

Cancer Med 3.202 宁波大学的医学院
15 Characteristics of circular RNA expression in lung tissues from mice with hypoxia‑induced pulmonary hypertension

低氧诱导肺动脉高压小鼠肺组织环RNA表达特征研究

Int J Mol Med 2.784 复旦大学华东医院
16 hsa_circ_0000729, a potential prognostic biomarker in lung adenocarcinoma

hsa_circ_0000729肺腺癌中潜在的诊断标记物研究

Thorac Cancer 2.569 青岛大学附属医院
17 Circular RNA HIPK3 regulates human lens epithelial cells proliferation and apoptosis by targeting the miR-193a/CRYAA axis

环状RNA HIPK3通过靶向miR-193a / CRYAA轴调节人晶状体上皮细胞的增殖和凋亡

Biochem Biophys Res Commun. 2.559 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
18 Circ-UBR5: An exonic circular RNA and novel small nuclear RNA involved in RNA splicing

Circ-UBR5参与RNA剪接的新型小核RNA

Biochem Biophys Res Commun. 2.559 上海复旦大学医学院
19 CircRNA circ_0026344 as a prognostic biomarker suppresses colorectal cancer progression via microRNA-21 and microRNA-31

circ_0026344通过microRNA-21 and microRNA-318抑制结肠癌发展

Biochem Biophys Res Commun. 2.559 徐州中心医院
20 Circular RNA HIPK3 promotes gallbladder cancer cell growth by sponging microRNA-124

环状RNA HIPK3通过吸附microRNA-124促进胆囊癌细胞生长

Biochem Biophys Res Commun. 2.559 南京大学医学院
21 Circular RNA circ-CBFB promotes proliferation and inhibits apoptosis in chronic lymphocytic leukemia through regulating miR-607/FZD3/Wnt/β-catenin pathway

circ-CBFB通过调节miR-607 / FZD3 / Wnt /β-catenin途径促进慢性淋巴细胞白血病的增殖和抑制细胞凋亡

Biochem Biophys Res Commun. 2.559 安徽医科大学第一附属医院
22 Screening and bioinformatics analysis of circular RNA expression profiles in hepatitis B-related hepatocellular carcinoma

肝癌相关肝细胞癌环状RNA表达谱的筛选和生物信息学分析

Cancer Biomark 2.392 首都医科大学
23 Comprehensive circular RNA expression profile in radiation-treated HeLa cells and analysis of radioresistance-related circRNAs

辐射处理的HeLa细胞中的环状RNA表达谱和放射抗性相关的circRNA的分析

PeerJ 2.118 吉林大学第二医院
24 Preliminary investigation of the function of hsa_circ_0006215 in pancreatic cancer

hsa_circ_0006215在胰腺癌中的功能初探

Oncol Lett 1.664 中国医科大学盛京医院

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