5月上旬的circRNA研究报道总结又跟大家见面了,往期每半月的总结,大家可以在本公众号的近期文章目录中查看,下面我们一起浏览下这半个月circRNA的研究进展情况。
1、视网膜神经退化疾病中对circRNA-ZRANB1的治疗干预研究
论文标题:Targeting circular RNA-ZRANB1 for therapeutic intervention in retinal neurodegeneration
杂志:Cell Death Dis 影响因子:5.97分
通讯作者单位:上海医科大学眼科研究所
青光眼是一种常见的视网膜退行性疾病,表现为视网膜神经节细胞、双极细胞、感光细胞、色素细胞等进行性变性、凋亡和坏死等。目前针对这类疾病主要是缓解视网膜细胞变性和凋亡进展,已有研究表明circRNA在神经退行性疾病中似乎起着重要调控作用,该研究发现circRNA cZRANB1在青光眼中显著上调,体内实验表明敲低c ZRANB1可显著降低神经胶质细胞活性和提高视网膜神经节细胞(RGC)的生存率。体外实验表明,cZRANB1敲低可直接调控Müller细胞的功能和间接调控RGC细胞功能,cZRANB1通过cZRANB1/miR-217/RUNX2途径发挥miRNA sponge功能,因此研究者认为在青光眼神经退行性疾病中,靶向cZRANB1也许是一个重要的治疗靶点。
2、肺癌细胞中TNRC6A蛋白调控circRNA-0006916的表达研究
论文标题:RNA-binding Protein Trinucleotide repeat-containing 6A Regulates the Formation of Circular RNA 0006916, with Important Functions in Lung Cancer Cells
杂志:Carcinogenesis 影响因子5.11分
作者通讯单位:广州医科大学
镍化合物广泛存在于人类职业环境中,是人类发生肺癌的主要危险因素,该文研究者利用抗BPDE(benzo[a]pyrene-trans-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide)诱导人正常支气管上皮细胞16HBE恶性转化为16HBE-T,建立细胞模型。发现该模型中circRNA circ0006916持续下调,在A549和H460细胞中,敲低circRNA circ0006916后,通过加速细胞周期的方式加速细胞增殖,并不抑制细胞凋亡,对应地,过表达circRNA circ0006916可引起相反的细胞功能,荧光素酶报告基因实验表明circRNA circ0006916可结合miR-522-3P抑制PHLPP1的活性,同时研究者还发现RNA结合蛋白TNRC6A可以结合到circRNA circ0006916的侧翼内含子序列处,调控circRNA circ0006916的形成,同时RNA pulldown实验也证实了两者的结合,缺少TNRC6A则circRNA circ0006916不能有效成环,表明TNRC6A的重要性,该研究成功地揭示了circRNA circ0006916上游的调控蛋白,较清晰地揭示了circRNA在细胞恶变过程中的作用机制。
3、has_circ_0001275:绝经后骨质疏松症的潜在新型诊断生物标记
论文标题:Hsa_Circ_0001275: A Potential Novel Diagnostic Biomarker for Postmenopausal Osteoporosis
杂志:CELL PHYSIOL BIOCHEM 影响因子:5.1分
作者通讯单位:南方医科大学
本研究研究对象为绝经后骨质疏松症(PMOP)患者PBMCs细胞为研究对象,通过circRNA芯片实验筛选差异表达的circRNA,经扩大样本,PCR验证6个差异表达的circRNAs,发现has_circ_0001275与患者年龄、体重、淋巴细胞,单核细胞和骨密度密切相关,ROC曲线显示has_circ_0001275在绝经后骨质疏松症患者有较高的诊断价值(AUC=0.759,P<0.001),表明has_circ_0001275可作为PMOP的潜在诊断分子指标。
4、非小细胞肺癌中的血浆标志物
论文标题:A novel plasma circular RNA circFARSA is a potential biomarker for non‐small cell lung cancer circFARSA
杂志:cancer medicine 影响因子:3.36
通讯作者单位:南京医科大学
本研究主要考察非小细胞肺癌(NSCLC)患者临床样本中circRNA差异表达变化,并分析是否可以作为潜在NSCLC诊断标志物,通过RNA-seq技术在NSCLC组织样本中发现共鉴定出5471个circRNA,其中185个显著差异表达,其中circFARSA起源于FARSA基因的5-7号外显子,在肺癌组织中异常高表达,qPCR进一步在患者血浆样本中发现circFARSA相对于健康人血浆样本显著高表达,A549细胞中过表达circFARSA可显著提高细胞的迁移和侵袭能力,生物信息预测发现circFARSA可吸附miR-330-5p和miR-326,释放癌基因脂肪酸合成酶的表达,或许是circFARSA促进肿瘤发生的作用机制,也提示circFARSA可作为非小细胞肺癌的诊断标志物。
参考文献列表
序号 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | Targeting circular RNA-ZRANB1 for therapeutic intervention in retinal neurodegeneration
视网膜神经退化疾病中对circRNA-ZRANB1的干预治疗研究 |
Cell Death Dis | 5.97 | 复旦大学上海医学院 |
2 | RNA-binding Protein Trinucleotide repeat-containing 6A Regulates the Formation of Circular RNA 0006916, with Important Functions in Lung Cancer Cells
肺癌细胞中TNRC6A蛋白调控circRNA-0006916的表达研究 |
Carcinogenesis | 5.11 | 广州医科大学 |
3 | Hsa_Circ_0001275: A Potential Novel Diagnostic Biomarker for Postmenopausal Osteoporosis
has_circ_0001275:绝经后骨质疏松症的潜在新型诊断生物标记 |
CELL PHYSIOL BIOCHEM | 5.1 | 南方医科大学 |
4 | CircRNAs in the tree shrew (Tupaia belangeri) brain during postnatal development and aging
树鼩(Tupaia belangeri)在产后发育和衰老过程中的大脑中circRNA表达谱研究 |
Aging | 4.87 | 中国医学科学院医学生物学研究所 |
5 | Ouroboros resembling competitive endogenous loop (ORCEL) in circular RNAs revealed through transcriptome sequencing dataset analysis
转录组数据中circRNA竞争性结合RNA调控回路分析 |
BMC Genomics. | 3.73 | 台湾国立交通大学 |
6 | Circular RNA expression and regulatory network prediction in posterior cingulate astrocytes in elderly subjects.
老年患者星形胶质瘤中circRNA表达及调控网络分析 |
BMC Genomics. | 3.73 | 亚利桑那州立大学 |
7 | A novel plasma circular RNA circFARSA is a potential biomarker for non‐small cell lung cancer
circFARSA非小细胞肺癌中的血浆标志物 |
cancer medicine | 3.36 | 南京医科大学 |
8 | CircR2Disease: a manually curated database for experimentally supported circular RNAs associated with various diseases
circRNA疾病相关数据库:circR2Disease |
database | 3.29 | 陕西师范大学 |
9 | Circular RNA hsa_circ_0023404 exerts an oncogenic role in cervical cancer through regulating miR-136/TFCP2/YAP pathway.
子宫颈癌中hsa_circ_0023404通过miR-126/TFCP2/YAP途径发挥功能 |
BBRC | 2.47 | 西安医科大学 |
10 | Circular RNA hsa_circ_0000673 promotes hepatocellular carcinoma malignance by decreasing miR-767-3p targeting SET
hsa_circ_0000673通过降低miR-767-3p靶向SET从而促进肝癌恶性肿瘤的发生 |
BBRC | 2.47 | 吉林大学第二医院 |
11 | Identification of Potentially Functional CircRNA-miRNA-mRNA Regulatory Network in Hepatocellular Carcinoma by Integrated Microarray Analysis
微阵列分析确定肝细胞癌中潜在功能性的CircRNA-miRNA-mRNA调控网络 |
Med Sci Monit Basic Res. | 1.58 | 汕头大学医学院 |
12 | Effect of alkylglycerone phosphate synthase on the expression profile of circRNAs in the human thyroid cancer cell line FRO.
甲状腺癌细胞FRO中AGPS酶调控circRNA表达的研究 |
Oncol Lett. | 1.39 | 天津医科大学总医院 |
13 | CircRNA accumulation: A new hallmark of aging?
综述:circRNA聚集,细胞衰老的标志? |
Mech Ageing Dev | * | 内华达大学雷诺分校 |