5月上旬的circRNA研究报道总结又跟大家见面了,往期每半月的总结,大家可以在本公众号的近期文章目录中查看,下面我们一起浏览下这半个月circRNA的研究进展情况。

1、视网膜神经退化疾病中对circRNA-ZRANB1的治疗干预研究

论文标题:Targeting circular RNA-ZRANB1 for therapeutic intervention in retinal neurodegeneration

杂志:Cell Death Dis 影响因子:5.97分

通讯作者单位:上海医科大学眼科研究所

青光眼是一种常见的视网膜退行性疾病,表现为视网膜神经节细胞、双极细胞、感光细胞、色素细胞等进行性变性、凋亡和坏死等。目前针对这类疾病主要是缓解视网膜细胞变性和凋亡进展,已有研究表明circRNA在神经退行性疾病中似乎起着重要调控作用,该研究发现circRNA cZRANB1在青光眼中显著上调,体内实验表明敲低c ZRANB1可显著降低神经胶质细胞活性和提高视网膜神经节细胞(RGC)的生存率。体外实验表明,cZRANB1敲低可直接调控Müller细胞的功能和间接调控RGC细胞功能,cZRANB1通过cZRANB1/miR-217/RUNX2途径发挥miRNA sponge功能,因此研究者认为在青光眼神经退行性疾病中,靶向cZRANB1也许是一个重要的治疗靶点。

2、肺癌细胞中TNRC6A蛋白调控circRNA-0006916的表达研究

论文标题:RNA-binding Protein Trinucleotide repeat-containing 6A Regulates the Formation of Circular RNA 0006916, with Important Functions in Lung Cancer Cells

杂志:Carcinogenesis 影响因子5.11分

作者通讯单位:广州医科大学

镍化合物广泛存在于人类职业环境中,是人类发生肺癌的主要危险因素,该文研究者利用抗BPDE(benzo[a]pyrene-trans-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide)诱导人正常支气管上皮细胞16HBE恶性转化为16HBE-T,建立细胞模型。发现该模型中circRNA circ0006916持续下调,在A549和H460细胞中,敲低circRNA circ0006916后,通过加速细胞周期的方式加速细胞增殖,并不抑制细胞凋亡,对应地,过表达circRNA circ0006916可引起相反的细胞功能,荧光素酶报告基因实验表明circRNA circ0006916可结合miR-522-3P抑制PHLPP1的活性,同时研究者还发现RNA结合蛋白TNRC6A可以结合到circRNA circ0006916的侧翼内含子序列处,调控circRNA circ0006916的形成,同时RNA pulldown实验也证实了两者的结合,缺少TNRC6A则circRNA circ0006916不能有效成环,表明TNRC6A的重要性,该研究成功地揭示了circRNA circ0006916上游的调控蛋白,较清晰地揭示了circRNA在细胞恶变过程中的作用机制。

3、has_circ_0001275:绝经后骨质疏松症的潜在新型诊断生物标记

论文标题:Hsa_Circ_0001275: A Potential Novel Diagnostic Biomarker for Postmenopausal Osteoporosis

杂志:CELL PHYSIOL BIOCHEM 影响因子:5.1分

作者通讯单位:南方医科大学

本研究研究对象为绝经后骨质疏松症(PMOP)患者PBMCs细胞为研究对象,通过circRNA芯片实验筛选差异表达的circRNA,经扩大样本,PCR验证6个差异表达的circRNAs,发现has_circ_0001275与患者年龄、体重、淋巴细胞,单核细胞和骨密度密切相关,ROC曲线显示has_circ_0001275在绝经后骨质疏松症患者有较高的诊断价值(AUC=0.759,P<0.001),表明has_circ_0001275可作为PMOP的潜在诊断分子指标。

4、非小细胞肺癌中的血浆标志物

论文标题:A novel plasma circular RNA circFARSA is a potential biomarker for non‐small cell lung cancer circFARSA

杂志:cancer medicine 影响因子:3.36

通讯作者单位:南京医科大学

本研究主要考察非小细胞肺癌(NSCLC)患者临床样本中circRNA差异表达变化,并分析是否可以作为潜在NSCLC诊断标志物,通过RNA-seq技术在NSCLC组织样本中发现共鉴定出5471个circRNA,其中185个显著差异表达,其中circFARSA起源于FARSA基因的5-7号外显子,在肺癌组织中异常高表达,qPCR进一步在患者血浆样本中发现circFARSA相对于健康人血浆样本显著高表达,A549细胞中过表达circFARSA可显著提高细胞的迁移和侵袭能力,生物信息预测发现circFARSA可吸附miR-330-5p和miR-326,释放癌基因脂肪酸合成酶的表达,或许是circFARSA促进肿瘤发生的作用机制,也提示circFARSA可作为非小细胞肺癌的诊断标志物。

参考文献列表

序号 论文标题 杂志 IF 单位
1 Targeting circular RNA-ZRANB1 for therapeutic intervention in retinal neurodegeneration

视网膜神经退化疾病中对circRNA-ZRANB1的干预治疗研究

Cell Death Dis 5.97 复旦大学上海医学院
2 RNA-binding Protein Trinucleotide repeat-containing 6A Regulates the Formation of Circular RNA 0006916, with Important Functions in Lung Cancer Cells

肺癌细胞中TNRC6A蛋白调控circRNA-0006916的表达研究

Carcinogenesis 5.11 广州医科大学
3 Hsa_Circ_0001275: A Potential Novel Diagnostic Biomarker for Postmenopausal Osteoporosis

has_circ_0001275:绝经后骨质疏松症的潜在新型诊断生物标记

CELL PHYSIOL BIOCHEM 5.1 南方医科大学
4 CircRNAs in the tree shrew (Tupaia belangeri) brain during postnatal development and aging

树鼩(Tupaia belangeri)在产后发育和衰老过程中的大脑中circRNA表达谱研究

Aging 4.87 中国医学科学院医学生物学研究所
5 Ouroboros resembling competitive endogenous loop (ORCEL) in circular RNAs revealed through transcriptome sequencing dataset analysis

转录组数据中circRNA竞争性结合RNA调控回路分析

BMC Genomics. 3.73 台湾国立交通大学
6 Circular RNA expression and regulatory network prediction in posterior cingulate astrocytes in elderly subjects.

老年患者星形胶质瘤中circRNA表达及调控网络分析

BMC Genomics. 3.73 亚利桑那州立大学
7 A novel plasma circular RNA circFARSA is a potential biomarker for non‐small cell lung cancer

circFARSA非小细胞肺癌中的血浆标志物

cancer medicine 3.36 南京医科大学
8 CircR2Disease: a manually curated database for experimentally supported circular RNAs associated with various diseases

circRNA疾病相关数据库:circR2Disease

database 3.29 陕西师范大学
9 Circular RNA hsa_circ_0023404 exerts an oncogenic role in cervical cancer through regulating miR-136/TFCP2/YAP pathway.

子宫颈癌中hsa_circ_0023404通过miR-126/TFCP2/YAP途径发挥功能

BBRC 2.47 西安医科大学
10 Circular RNA hsa_circ_0000673 promotes hepatocellular carcinoma malignance by decreasing miR-767-3p targeting SET

hsa_circ_0000673通过降低miR-767-3p靶向SET从而促进肝癌恶性肿瘤的发生

BBRC 2.47 吉林大学第二医院
11 Identification of Potentially Functional CircRNA-miRNA-mRNA Regulatory Network in Hepatocellular Carcinoma by Integrated Microarray Analysis

微阵列分析确定肝细胞癌中潜在功能性的CircRNA-miRNA-mRNA调控网络

Med Sci Monit Basic Res. 1.58 汕头大学医学院
12 Effect of alkylglycerone phosphate synthase on the expression profile of circRNAs in the human thyroid cancer cell line FRO.

甲状腺癌细胞FRO中AGPS酶调控circRNA表达的研究

Oncol Lett. 1.39 天津医科大学总医院
13 CircRNA accumulation: A new hallmark of aging?

综述:circRNA聚集,细胞衰老的标志?

Mech Ageing Dev * 内华达大学雷诺分校

 

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