图2中登场的这个看起来错综复杂的圆形图就是弦图,是不是很酷炫?这种图是用R包GOplot中的GOChord函数画出来的。它可以方便直观地展示所选基因和通路(Term)之间的关系,以及基因的logFC变化。GOChord函数主要包含三个参数:data、gene、process,分别代表logFC、基因和通路,将这三个数据整理成一个二进制的关系矩阵即可进行绘制。当然,这个矩阵不仅可以按其要求自行构建,也可以使用其自带函数chord_dat来构建。像其他绘图功能一样GOChord为用户提供了许多参数来更改绘图布局,包括标签字体大小、标签之间的间距、logFC的色阶和色带颜色的调整等,我们可以根据自己的需求进行调整。二、图解最外圈右侧环:10 条GO biological process terms,每条term用一种颜色标识。